Protein–RNA interactions for Protein: P04118

CLPS, Colipase, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSP04118 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPSP04118 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPSP04118 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLPSP04118 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLPSP04118 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLPSP04118 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLPSP04118 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPSP04118 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPSP04118 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPSP04118 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPSP04118 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPSP04118 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPSP04118 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPSP04118 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPSP04118 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPSP04118 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPSP04118 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPSP04118 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPSP04118 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPSP04118 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPSP04118 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPSP04118 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLPSP04118 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLPSP04118 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLPSP04118 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLPSP04118 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLPSP04118 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLPSP04118 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLPSP04118 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLPSP04118 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLPSP04118 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLPSP04118 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLPSP04118 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLPSP04118 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLPSP04118 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLPSP04118 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLPSP04118 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLPSP04118 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLPSP04118 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLPSP04118 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLPSP04118 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLPSP04118 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLPSP04118 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLPSP04118 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLPSP04118 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLPSP04118 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLPSP04118 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLPSP04118 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPSP04118 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPSP04118 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPSP04118 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPSP04118 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLPSP04118 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLPSP04118 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLPSP04118 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLPSP04118 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLPSP04118 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLPSP04118 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLPSP04118 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLPSP04118 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLPSP04118 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLPSP04118 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLPSP04118 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLPSP04118 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLPSP04118 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLPSP04118 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLPSP04118 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLPSP04118 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLPSP04118 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPSP04118 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPSP04118 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPSP04118 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLPSP04118 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLPSP04118 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLPSP04118 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLPSP04118 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPSP04118 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPSP04118 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPSP04118 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPSP04118 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPSP04118 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLPSP04118 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLPSP04118 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLPSP04118 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLPSP04118 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLPSP04118 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLPSP04118 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLPSP04118 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLPSP04118 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLPSP04118 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLPSP04118 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLPSP04118 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLPSP04118 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLPSP04118 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLPSP04118 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLPSP04118 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLPSP04118 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLPSP04118 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLPSP04118 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLPSP04118 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms