Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNC2P02585 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TNNC2P02585 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNC2P02585 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNC2P02585 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TNNC2P02585 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TNNC2P02585 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNC2P02585 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNNC2P02585 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNC2P02585 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNC2P02585 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNNC2P02585 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNC2P02585 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNNC2P02585 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNC2P02585 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNC2P02585 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNC2P02585 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNC2P02585 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNC2P02585 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNC2P02585 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNNC2P02585 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNC2P02585 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNC2P02585 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNC2P02585 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNNC2P02585 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNC2P02585 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNC2P02585 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNC2P02585 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNC2P02585 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TNNC2P02585 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
TNNC2P02585 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNNC2P02585 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNNC2P02585 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNC2P02585 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNC2P02585 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNC2P02585 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNC2P02585 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNNC2P02585 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNC2P02585 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNC2P02585 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNC2P02585 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNNC2P02585 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNC2P02585 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNC2P02585 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNC2P02585 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNNC2P02585 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNC2P02585 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNC2P02585 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNC2P02585 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNNC2P02585 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNC2P02585 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNC2P02585 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNC2P02585 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNC2P02585 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNC2P02585 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNC2P02585 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TNNC2P02585 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNC2P02585 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNC2P02585 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNC2P02585 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNC2P02585 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNC2P02585 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNC2P02585 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNC2P02585 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNC2P02585 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNC2P02585 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNC2P02585 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNC2P02585 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNC2P02585 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNC2P02585 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNC2P02585 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms