Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIPP01282 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIPP01282 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIPP01282 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIPP01282 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIPP01282 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIPP01282 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIPP01282 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIPP01282 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIPP01282 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VIPP01282 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIPP01282 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIPP01282 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIPP01282 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIPP01282 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VIPP01282 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VIPP01282 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VIPP01282 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VIPP01282 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VIPP01282 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIPP01282 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIPP01282 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIPP01282 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIPP01282 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VIPP01282 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VIPP01282 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VIPP01282 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VIPP01282 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VIPP01282 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VIPP01282 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VIPP01282 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VIPP01282 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VIPP01282 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VIPP01282 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VIPP01282 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VIPP01282 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VIPP01282 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VIPP01282 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VIPP01282 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VIPP01282 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VIPP01282 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VIPP01282 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VIPP01282 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VIPP01282 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VIPP01282 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VIPP01282 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VIPP01282 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VIPP01282 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VIPP01282 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VIPP01282 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VIPP01282 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VIPP01282 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VIPP01282 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIPP01282 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIPP01282 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIPP01282 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIPP01282 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIPP01282 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIPP01282 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIPP01282 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIPP01282 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIPP01282 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIPP01282 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIPP01282 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIPP01282 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIPP01282 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VIPP01282 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VIPP01282 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VIPP01282 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VIPP01282 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIPP01282 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIPP01282 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIPP01282 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIPP01282 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIPP01282 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VIPP01282 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIPP01282 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIPP01282 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIPP01282 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIPP01282 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIPP01282 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIPP01282 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIPP01282 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIPP01282 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIPP01282 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VIPP01282 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VIPP01282 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VIPP01282 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VIPP01282 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIPP01282 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIPP01282 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIPP01282 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIPP01282 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIPP01282 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIPP01282 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIPP01282 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIPP01282 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIPP01282 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIPP01282 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIPP01282 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms