Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
EGFRP00533 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
EGFRP00533 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
EGFRP00533 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
EGFRP00533 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
EGFRP00533 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
EGFRP00533 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
EGFRP00533 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
EGFRP00533 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
EGFRP00533 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
EGFRP00533 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
EGFRP00533 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
EGFRP00533 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
EGFRP00533 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
EGFRP00533 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
EGFRP00533 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
EGFRP00533 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
EGFRP00533 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
EGFRP00533 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
EGFRP00533 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
EGFRP00533 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
EGFRP00533 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
EGFRP00533 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
EGFRP00533 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
EGFRP00533 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
EGFRP00533 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
EGFRP00533 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
EGFRP00533 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
EGFRP00533 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
EGFRP00533 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
EGFRP00533 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EGFRP00533 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
EGFRP00533 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EGFRP00533 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EGFRP00533 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EGFRP00533 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
EGFRP00533 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
EGFRP00533 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
EGFRP00533 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
EGFRP00533 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EGFRP00533 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
EGFRP00533 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EGFRP00533 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EGFRP00533 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
EGFRP00533 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
EGFRP00533 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
EGFRP00533 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
EGFRP00533 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EGFRP00533 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EGFRP00533 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EGFRP00533 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EGFRP00533 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EGFRP00533 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EGFRP00533 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EGFRP00533 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
EGFRP00533 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EGFRP00533 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EGFRP00533 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EGFRP00533 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EGFRP00533 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EGFRP00533 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
EGFRP00533 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
EGFRP00533 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
EGFRP00533 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EGFRP00533 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EGFRP00533 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EGFRP00533 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EGFRP00533 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EGFRP00533 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EGFRP00533 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EGFRP00533 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
EGFRP00533 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EGFRP00533 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EGFRP00533 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EGFRP00533 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EGFRP00533 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EGFRP00533 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EGFRP00533 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EGFRP00533 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
EGFRP00533 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
EGFRP00533 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
EGFRP00533 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
EGFRP00533 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
EGFRP00533 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
EGFRP00533 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EGFRP00533 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
EGFRP00533 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EGFRP00533 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EGFRP00533 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
EGFRP00533 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
EGFRP00533 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EGFRP00533 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
EGFRP00533 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EGFRP00533 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EGFRP00533 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EGFRP00533 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
EGFRP00533 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
EGFRP00533 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
EGFRP00533 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
EGFRP00533 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms