Protein–RNA interactions for Protein: O75879

GATB, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATBO75879 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATBO75879 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GATBO75879 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATBO75879 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATBO75879 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATBO75879 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GATBO75879 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATBO75879 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GATBO75879 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATBO75879 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATBO75879 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATBO75879 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATBO75879 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATBO75879 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GATBO75879 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATBO75879 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GATBO75879 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATBO75879 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATBO75879 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATBO75879 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATBO75879 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GATBO75879 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATBO75879 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATBO75879 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GATBO75879 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATBO75879 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATBO75879 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATBO75879 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATBO75879 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATBO75879 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATBO75879 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATBO75879 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATBO75879 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATBO75879 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATBO75879 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATBO75879 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATBO75879 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATBO75879 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATBO75879 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GATBO75879 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATBO75879 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATBO75879 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GATBO75879 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATBO75879 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATBO75879 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GATBO75879 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GATBO75879 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATBO75879 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATBO75879 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATBO75879 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATBO75879 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATBO75879 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATBO75879 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATBO75879 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATBO75879 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATBO75879 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATBO75879 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATBO75879 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATBO75879 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATBO75879 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATBO75879 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATBO75879 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATBO75879 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATBO75879 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATBO75879 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATBO75879 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATBO75879 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATBO75879 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GATBO75879 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATBO75879 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATBO75879 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATBO75879 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATBO75879 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATBO75879 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GATBO75879 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATBO75879 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATBO75879 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GATBO75879 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATBO75879 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATBO75879 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GATBO75879 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GATBO75879 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GATBO75879 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GATBO75879 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GATBO75879 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATBO75879 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GATBO75879 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATBO75879 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATBO75879 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATBO75879 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATBO75879 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATBO75879 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATBO75879 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATBO75879 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GATBO75879 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GATBO75879 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATBO75879 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATBO75879 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATBO75879 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GATBO75879 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms