Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
KDM4AO75164 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM4AO75164 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
KDM4AO75164 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM4AO75164 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM4AO75164 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM4AO75164 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KDM4AO75164 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM4AO75164 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM4AO75164 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM4AO75164 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM4AO75164 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KDM4AO75164 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM4AO75164 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KDM4AO75164 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KDM4AO75164 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KDM4AO75164 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KDM4AO75164 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KDM4AO75164 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM4AO75164 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM4AO75164 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM4AO75164 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
KDM4AO75164 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM4AO75164 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM4AO75164 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM4AO75164 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM4AO75164 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM4AO75164 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM4AO75164 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM4AO75164 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM4AO75164 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM4AO75164 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM4AO75164 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM4AO75164 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM4AO75164 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM4AO75164 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM4AO75164 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM4AO75164 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM4AO75164 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM4AO75164 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM4AO75164 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM4AO75164 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM4AO75164 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM4AO75164 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM4AO75164 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM4AO75164 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM4AO75164 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM4AO75164 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM4AO75164 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM4AO75164 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM4AO75164 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM4AO75164 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM4AO75164 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM4AO75164 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM4AO75164 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM4AO75164 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDM4AO75164 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDM4AO75164 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDM4AO75164 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDM4AO75164 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDM4AO75164 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
KDM4AO75164 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
KDM4AO75164 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
KDM4AO75164 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
KDM4AO75164 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM4AO75164 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM4AO75164 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM4AO75164 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM4AO75164 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM4AO75164 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM4AO75164 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KDM4AO75164 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM4AO75164 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM4AO75164 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KDM4AO75164 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDM4AO75164 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM4AO75164 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM4AO75164 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM4AO75164 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM4AO75164 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM4AO75164 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM4AO75164 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KDM4AO75164 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
KDM4AO75164 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
KDM4AO75164 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
KDM4AO75164 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM4AO75164 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM4AO75164 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
KDM4AO75164 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM4AO75164 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM4AO75164 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KDM4AO75164 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM4AO75164 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM4AO75164 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KDM4AO75164 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDM4AO75164 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms