Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCN2BO60939 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN2BO60939 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN2BO60939 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN2BO60939 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN2BO60939 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN2BO60939 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN2BO60939 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN2BO60939 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN2BO60939 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN2BO60939 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN2BO60939 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN2BO60939 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN2BO60939 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN2BO60939 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN2BO60939 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN2BO60939 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN2BO60939 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN2BO60939 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN2BO60939 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN2BO60939 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN2BO60939 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN2BO60939 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN2BO60939 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN2BO60939 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN2BO60939 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN2BO60939 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN2BO60939 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN2BO60939 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN2BO60939 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN2BO60939 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN2BO60939 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCN2BO60939 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms