Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PLXNC1O60486 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PLXNC1O60486 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PLXNC1O60486 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PLXNC1O60486 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PLXNC1O60486 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PLXNC1O60486 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PLXNC1O60486 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PLXNC1O60486 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PLXNC1O60486 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
PLXNC1O60486 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PLXNC1O60486 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
PLXNC1O60486 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
PLXNC1O60486 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
PLXNC1O60486 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
PLXNC1O60486 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
PLXNC1O60486 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
PLXNC1O60486 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PLXNC1O60486 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
PLXNC1O60486 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
PLXNC1O60486 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PLXNC1O60486 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PLXNC1O60486 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PLXNC1O60486 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PLXNC1O60486 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PLXNC1O60486 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
PLXNC1O60486 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PLXNC1O60486 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PLXNC1O60486 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
PLXNC1O60486 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PLXNC1O60486 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PLXNC1O60486 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
PLXNC1O60486 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PLXNC1O60486 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.69
PLXNC1O60486 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
PLXNC1O60486 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PLXNC1O60486 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PLXNC1O60486 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
PLXNC1O60486 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PLXNC1O60486 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PLXNC1O60486 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PLXNC1O60486 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PLXNC1O60486 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PLXNC1O60486 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PLXNC1O60486 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PLXNC1O60486 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PLXNC1O60486 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PLXNC1O60486 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PLXNC1O60486 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PLXNC1O60486 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PLXNC1O60486 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PLXNC1O60486 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PLXNC1O60486 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PLXNC1O60486 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
PLXNC1O60486 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PLXNC1O60486 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PLXNC1O60486 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PLXNC1O60486 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
PLXNC1O60486 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PLXNC1O60486 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
PLXNC1O60486 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PLXNC1O60486 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PLXNC1O60486 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PLXNC1O60486 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PLXNC1O60486 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
PLXNC1O60486 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
PLXNC1O60486 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PLXNC1O60486 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PLXNC1O60486 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PLXNC1O60486 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PLXNC1O60486 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PLXNC1O60486 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PLXNC1O60486 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PLXNC1O60486 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PLXNC1O60486 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PLXNC1O60486 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PLXNC1O60486 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PLXNC1O60486 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PLXNC1O60486 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PLXNC1O60486 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PLXNC1O60486 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PLXNC1O60486 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PLXNC1O60486 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PLXNC1O60486 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PLXNC1O60486 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PLXNC1O60486 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PLXNC1O60486 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PLXNC1O60486 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PLXNC1O60486 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PLXNC1O60486 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PLXNC1O60486 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
PLXNC1O60486 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PLXNC1O60486 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PLXNC1O60486 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PLXNC1O60486 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PLXNC1O60486 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PLXNC1O60486 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PLXNC1O60486 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PLXNC1O60486 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PLXNC1O60486 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms