Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRID2O43424 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRID2O43424 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRID2O43424 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GRID2O43424 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRID2O43424 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRID2O43424 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRID2O43424 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRID2O43424 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRID2O43424 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRID2O43424 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRID2O43424 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRID2O43424 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRID2O43424 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRID2O43424 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRID2O43424 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRID2O43424 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRID2O43424 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRID2O43424 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRID2O43424 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRID2O43424 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRID2O43424 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRID2O43424 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRID2O43424 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GRID2O43424 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRID2O43424 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRID2O43424 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRID2O43424 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GRID2O43424 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRID2O43424 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRID2O43424 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRID2O43424 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRID2O43424 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRID2O43424 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRID2O43424 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRID2O43424 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRID2O43424 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GRID2O43424 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRID2O43424 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRID2O43424 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRID2O43424 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRID2O43424 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRID2O43424 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRID2O43424 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRID2O43424 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GRID2O43424 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRID2O43424 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRID2O43424 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRID2O43424 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRID2O43424 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRID2O43424 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRID2O43424 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRID2O43424 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRID2O43424 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRID2O43424 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRID2O43424 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRID2O43424 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRID2O43424 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRID2O43424 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRID2O43424 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRID2O43424 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRID2O43424 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRID2O43424 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRID2O43424 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRID2O43424 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRID2O43424 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRID2O43424 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRID2O43424 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRID2O43424 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRID2O43424 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRID2O43424 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRID2O43424 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRID2O43424 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRID2O43424 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRID2O43424 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRID2O43424 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRID2O43424 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRID2O43424 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRID2O43424 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GRID2O43424 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRID2O43424 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRID2O43424 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRID2O43424 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRID2O43424 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRID2O43424 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRID2O43424 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRID2O43424 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRID2O43424 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRID2O43424 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRID2O43424 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRID2O43424 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRID2O43424 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRID2O43424 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRID2O43424 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRID2O43424 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRID2O43424 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRID2O43424 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRID2O43424 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRID2O43424 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRID2O43424 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms