Protein–RNA interactions for Protein: O43173

ST8SIA3, Sia-alpha-2,3-Gal-beta-1,4-GlcNAc-R:alpha 2,8-sialyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST8SIA3O43173 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ST8SIA3O43173 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ST8SIA3O43173 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ST8SIA3O43173 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ST8SIA3O43173 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ST8SIA3O43173 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ST8SIA3O43173 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ST8SIA3O43173 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ST8SIA3O43173 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ST8SIA3O43173 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ST8SIA3O43173 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ST8SIA3O43173 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ST8SIA3O43173 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ST8SIA3O43173 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ST8SIA3O43173 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms