Protein–RNA interactions for Protein: O15522

NKX2-8, Homeobox protein Nkx-2.8, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-8O15522 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX2-8O15522 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKX2-8O15522 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKX2-8O15522 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKX2-8O15522 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKX2-8O15522 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NKX2-8O15522 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX2-8O15522 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX2-8O15522 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX2-8O15522 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX2-8O15522 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX2-8O15522 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX2-8O15522 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX2-8O15522 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX2-8O15522 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX2-8O15522 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX2-8O15522 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX2-8O15522 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX2-8O15522 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX2-8O15522 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX2-8O15522 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX2-8O15522 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX2-8O15522 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX2-8O15522 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKX2-8O15522 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NKX2-8O15522 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NKX2-8O15522 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NKX2-8O15522 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-8O15522 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX2-8O15522 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX2-8O15522 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX2-8O15522 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX2-8O15522 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX2-8O15522 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX2-8O15522 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX2-8O15522 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms