Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ELL2O00472 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ELL2O00472 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ELL2O00472 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ELL2O00472 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ELL2O00472 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ELL2O00472 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ELL2O00472 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ELL2O00472 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ELL2O00472 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ELL2O00472 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ELL2O00472 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ELL2O00472 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ELL2O00472 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ELL2O00472 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ELL2O00472 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ELL2O00472 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ELL2O00472 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ELL2O00472 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ELL2O00472 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ELL2O00472 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ELL2O00472 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
ELL2O00472 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ELL2O00472 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ELL2O00472 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ELL2O00472 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ELL2O00472 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ELL2O00472 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ELL2O00472 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ELL2O00472 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ELL2O00472 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ELL2O00472 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ELL2O00472 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ELL2O00472 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ELL2O00472 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ELL2O00472 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ELL2O00472 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ELL2O00472 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ELL2O00472 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ELL2O00472 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
ELL2O00472 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ELL2O00472 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ELL2O00472 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ELL2O00472 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ELL2O00472 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
ELL2O00472 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ELL2O00472 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
ELL2O00472 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ELL2O00472 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ELL2O00472 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ELL2O00472 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
ELL2O00472 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ELL2O00472 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ELL2O00472 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ELL2O00472 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ELL2O00472 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ELL2O00472 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ELL2O00472 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ELL2O00472 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ELL2O00472 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ELL2O00472 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ELL2O00472 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ELL2O00472 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ELL2O00472 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ELL2O00472 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ELL2O00472 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ELL2O00472 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ELL2O00472 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ELL2O00472 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ELL2O00472 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ELL2O00472 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ELL2O00472 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ELL2O00472 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ELL2O00472 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ELL2O00472 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ELL2O00472 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ELL2O00472 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ELL2O00472 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ELL2O00472 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ELL2O00472 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ELL2O00472 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
ELL2O00472 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ELL2O00472 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ELL2O00472 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ELL2O00472 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ELL2O00472 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ELL2O00472 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ELL2O00472 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ELL2O00472 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ELL2O00472 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ELL2O00472 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ELL2O00472 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ELL2O00472 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ELL2O00472 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ELL2O00472 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ELL2O00472 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ELL2O00472 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ELL2O00472 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ELL2O00472 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ELL2O00472 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms