Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN6O00399 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DCTN6O00399 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCTN6O00399 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCTN6O00399 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCTN6O00399 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms