Protein–RNA interactions for Protein: O00337

SLC28A1, Sodium/nucleoside cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A1O00337 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC28A1O00337 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC28A1O00337 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC28A1O00337 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC28A1O00337 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC28A1O00337 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC28A1O00337 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC28A1O00337 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC28A1O00337 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC28A1O00337 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC28A1O00337 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC28A1O00337 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC28A1O00337 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC28A1O00337 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC28A1O00337 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC28A1O00337 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC28A1O00337 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC28A1O00337 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC28A1O00337 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC28A1O00337 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC28A1O00337 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC28A1O00337 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC28A1O00337 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC28A1O00337 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC28A1O00337 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC28A1O00337 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC28A1O00337 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC28A1O00337 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC28A1O00337 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC28A1O00337 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC28A1O00337 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC28A1O00337 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC28A1O00337 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC28A1O00337 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC28A1O00337 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC28A1O00337 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC28A1O00337 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC28A1O00337 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC28A1O00337 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC28A1O00337 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms