Protein–RNA interactions for Protein: C9IYK1

Gap junction protein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9IYK1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.52■■■□□ 2
C9IYK1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
C9IYK1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
C9IYK1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9IYK1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C9IYK1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9IYK1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9IYK1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C9IYK1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9IYK1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
C9IYK1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C9IYK1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
C9IYK1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9IYK1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C9IYK1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9IYK1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9IYK1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9IYK1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C9IYK1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9IYK1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9IYK1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
C9IYK1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
C9IYK1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
C9IYK1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
C9IYK1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C9IYK1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C9IYK1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C9IYK1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C9IYK1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C9IYK1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
C9IYK1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C9IYK1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C9IYK1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C9IYK1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C9IYK1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C9IYK1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C9IYK1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C9IYK1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C9IYK1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C9IYK1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C9IYK1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
C9IYK1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C9IYK1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
C9IYK1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C9IYK1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C9IYK1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C9IYK1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
C9IYK1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
C9IYK1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C9IYK1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C9IYK1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
C9IYK1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
C9IYK1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
C9IYK1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C9IYK1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
C9IYK1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C9IYK1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C9IYK1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C9IYK1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
C9IYK1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C9IYK1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C9IYK1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C9IYK1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
C9IYK1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C9IYK1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C9IYK1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C9IYK1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C9IYK1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
C9IYK1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
C9IYK1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C9IYK1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C9IYK1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C9IYK1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C9IYK1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
C9IYK1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C9IYK1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C9IYK1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C9IYK1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C9IYK1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
C9IYK1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C9IYK1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C9IYK1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
C9IYK1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
C9IYK1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C9IYK1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
C9IYK1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C9IYK1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C9IYK1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
C9IYK1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C9IYK1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
C9IYK1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C9IYK1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C9IYK1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C9IYK1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C9IYK1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
C9IYK1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C9IYK1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
C9IYK1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C9IYK1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C9IYK1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms