Protein–RNA interactions for Protein: A6PVI3

NCBP2L, Nuclear cap-binding protein subunit 2-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2LA6PVI3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP2LA6PVI3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP2LA6PVI3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP2LA6PVI3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP2LA6PVI3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCBP2LA6PVI3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NCBP2LA6PVI3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP2LA6PVI3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP2LA6PVI3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP2LA6PVI3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP2LA6PVI3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP2LA6PVI3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP2LA6PVI3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP2LA6PVI3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP2LA6PVI3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP2LA6PVI3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP2LA6PVI3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP2LA6PVI3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP2LA6PVI3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP2LA6PVI3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP2LA6PVI3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP2LA6PVI3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCBP2LA6PVI3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCBP2LA6PVI3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCBP2LA6PVI3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCBP2LA6PVI3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCBP2LA6PVI3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP2LA6PVI3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP2LA6PVI3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCBP2LA6PVI3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP2LA6PVI3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP2LA6PVI3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCBP2LA6PVI3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP2LA6PVI3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP2LA6PVI3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP2LA6PVI3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP2LA6PVI3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP2LA6PVI3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP2LA6PVI3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCBP2LA6PVI3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP2LA6PVI3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NCBP2LA6PVI3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP2LA6PVI3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCBP2LA6PVI3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP2LA6PVI3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP2LA6PVI3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP2LA6PVI3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP2LA6PVI3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCBP2LA6PVI3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCBP2LA6PVI3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCBP2LA6PVI3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP2LA6PVI3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP2LA6PVI3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP2LA6PVI3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP2LA6PVI3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP2LA6PVI3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCBP2LA6PVI3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP2LA6PVI3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP2LA6PVI3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP2LA6PVI3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP2LA6PVI3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP2LA6PVI3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP2LA6PVI3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP2LA6PVI3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCBP2LA6PVI3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms