Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM200CA6NKL6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM200CA6NKL6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM200CA6NKL6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM200CA6NKL6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM200CA6NKL6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM200CA6NKL6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM200CA6NKL6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM200CA6NKL6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM200CA6NKL6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM200CA6NKL6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM200CA6NKL6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM200CA6NKL6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM200CA6NKL6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM200CA6NKL6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM200CA6NKL6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM200CA6NKL6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM200CA6NKL6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM200CA6NKL6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM200CA6NKL6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM200CA6NKL6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM200CA6NKL6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM200CA6NKL6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM200CA6NKL6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM200CA6NKL6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM200CA6NKL6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM200CA6NKL6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM200CA6NKL6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM200CA6NKL6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM200CA6NKL6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM200CA6NKL6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM200CA6NKL6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM200CA6NKL6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM200CA6NKL6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM200CA6NKL6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM200CA6NKL6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM200CA6NKL6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM200CA6NKL6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM200CA6NKL6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM200CA6NKL6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM200CA6NKL6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM200CA6NKL6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM200CA6NKL6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM200CA6NKL6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM200CA6NKL6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM200CA6NKL6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM200CA6NKL6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM200CA6NKL6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM200CA6NKL6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM200CA6NKL6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms