Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF1

SAC3D1, SAC3 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAC3D1A6NKF1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SAC3D1A6NKF1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SAC3D1A6NKF1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAC3D1A6NKF1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SAC3D1A6NKF1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SAC3D1A6NKF1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAC3D1A6NKF1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAC3D1A6NKF1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAC3D1A6NKF1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAC3D1A6NKF1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAC3D1A6NKF1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAC3D1A6NKF1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAC3D1A6NKF1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAC3D1A6NKF1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAC3D1A6NKF1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAC3D1A6NKF1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAC3D1A6NKF1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAC3D1A6NKF1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAC3D1A6NKF1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAC3D1A6NKF1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAC3D1A6NKF1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAC3D1A6NKF1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAC3D1A6NKF1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAC3D1A6NKF1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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