Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC69A6NI79 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC69A6NI79 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC69A6NI79 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC69A6NI79 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC69A6NI79 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC69A6NI79 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC69A6NI79 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC69A6NI79 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC69A6NI79 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC69A6NI79 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC69A6NI79 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC69A6NI79 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC69A6NI79 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC69A6NI79 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC69A6NI79 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC69A6NI79 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC69A6NI79 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC69A6NI79 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC69A6NI79 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC69A6NI79 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC69A6NI79 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC69A6NI79 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC69A6NI79 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC69A6NI79 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC69A6NI79 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC69A6NI79 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC69A6NI79 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC69A6NI79 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC69A6NI79 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC69A6NI79 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC69A6NI79 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC69A6NI79 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC69A6NI79 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC69A6NI79 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC69A6NI79 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC69A6NI79 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC69A6NI79 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC69A6NI79 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC69A6NI79 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC69A6NI79 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC69A6NI79 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC69A6NI79 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC69A6NI79 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC69A6NI79 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC69A6NI79 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC69A6NI79 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC69A6NI79 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC69A6NI79 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC69A6NI79 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC69A6NI79 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC69A6NI79 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC69A6NI79 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC69A6NI79 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC69A6NI79 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC69A6NI79 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC69A6NI79 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC69A6NI79 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC69A6NI79 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC69A6NI79 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC69A6NI79 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC69A6NI79 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC69A6NI79 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC69A6NI79 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC69A6NI79 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC69A6NI79 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC69A6NI79 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC69A6NI79 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC69A6NI79 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC69A6NI79 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC69A6NI79 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.6 ms