Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
XIRP2A4UGR9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XIRP2A4UGR9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XIRP2A4UGR9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
XIRP2A4UGR9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XIRP2A4UGR9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XIRP2A4UGR9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XIRP2A4UGR9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XIRP2A4UGR9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XIRP2A4UGR9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XIRP2A4UGR9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XIRP2A4UGR9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XIRP2A4UGR9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
XIRP2A4UGR9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XIRP2A4UGR9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
XIRP2A4UGR9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XIRP2A4UGR9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
XIRP2A4UGR9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XIRP2A4UGR9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XIRP2A4UGR9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XIRP2A4UGR9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms