Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC66A2RUB6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC66A2RUB6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC66A2RUB6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC66A2RUB6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC66A2RUB6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC66A2RUB6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC66A2RUB6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC66A2RUB6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC66A2RUB6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC66A2RUB6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC66A2RUB6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC66A2RUB6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC66A2RUB6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC66A2RUB6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC66A2RUB6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC66A2RUB6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC66A2RUB6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC66A2RUB6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC66A2RUB6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC66A2RUB6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC66A2RUB6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC66A2RUB6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC66A2RUB6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC66A2RUB6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC66A2RUB6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC66A2RUB6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC66A2RUB6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC66A2RUB6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC66A2RUB6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC66A2RUB6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC66A2RUB6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC66A2RUB6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC66A2RUB6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC66A2RUB6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC66A2RUB6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC66A2RUB6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC66A2RUB6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC66A2RUB6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC66A2RUB6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC66A2RUB6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC66A2RUB6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC66A2RUB6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC66A2RUB6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC66A2RUB6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC66A2RUB6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC66A2RUB6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC66A2RUB6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC66A2RUB6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC66A2RUB6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC66A2RUB6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC66A2RUB6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC66A2RUB6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC66A2RUB6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC66A2RUB6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC66A2RUB6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC66A2RUB6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC66A2RUB6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC66A2RUB6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC66A2RUB6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC66A2RUB6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC66A2RUB6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC66A2RUB6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC66A2RUB6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC66A2RUB6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC66A2RUB6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC66A2RUB6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC66A2RUB6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC66A2RUB6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC66A2RUB6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC66A2RUB6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC66A2RUB6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC66A2RUB6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC66A2RUB6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC66A2RUB6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC66A2RUB6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC66A2RUB6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC66A2RUB6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC66A2RUB6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC66A2RUB6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC66A2RUB6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC66A2RUB6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC66A2RUB6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC66A2RUB6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC66A2RUB6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC66A2RUB6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC66A2RUB6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC66A2RUB6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC66A2RUB6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC66A2RUB6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC66A2RUB6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC66A2RUB6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC66A2RUB6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC66A2RUB6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC66A2RUB6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC66A2RUB6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC66A2RUB6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC66A2RUB6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms