Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBC2A0A5B9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TRBC2A0A5B9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRBC2A0A5B9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRBC2A0A5B9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRBC2A0A5B9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRBC2A0A5B9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRBC2A0A5B9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRBC2A0A5B9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRBC2A0A5B9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRBC2A0A5B9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRBC2A0A5B9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRBC2A0A5B9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRBC2A0A5B9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBC2A0A5B9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBC2A0A5B9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBC2A0A5B9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBC2A0A5B9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBC2A0A5B9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBC2A0A5B9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBC2A0A5B9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRBC2A0A5B9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBC2A0A5B9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBC2A0A5B9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBC2A0A5B9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBC2A0A5B9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBC2A0A5B9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBC2A0A5B9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRBC2A0A5B9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRBC2A0A5B9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
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