Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A0U1RQJ8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A0U1RQJ8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A0U1RQJ8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A0U1RQJ8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A0U1RQJ8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A0U1RQJ8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A0U1RQJ8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
A0A0U1RQJ8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
A0A0U1RQJ8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A0U1RQJ8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A0U1RQJ8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
A0A0U1RQJ8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
A0A0U1RQJ8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
A0A0U1RQJ8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A0U1RQJ8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A0U1RQJ8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A0U1RQJ8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A0U1RQJ8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A0U1RQJ8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A0U1RQJ8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A0U1RQJ8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A0U1RQJ8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A0U1RQJ8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A0U1RQJ8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A0U1RQJ8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A0U1RQJ8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A0U1RQJ8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0U1RQJ8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0U1RQJ8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0U1RQJ8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0U1RQJ8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0U1RQJ8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0U1RQJ8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms