Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YX44

TRBV5-5, T-cell receptor beta variable 5-5 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-5A0A0J9YX44 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRBV5-5A0A0J9YX44 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV5-5A0A0J9YX44 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRBV5-5A0A0J9YX44 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRBV5-5A0A0J9YX44 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV5-5A0A0J9YX44 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV5-5A0A0J9YX44 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV5-5A0A0J9YX44 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV5-5A0A0J9YX44 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV5-5A0A0J9YX44 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV5-5A0A0J9YX44 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV5-5A0A0J9YX44 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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TRBV5-5A0A0J9YX44 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV5-5A0A0J9YX44 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-5A0A0J9YX44 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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TRBV5-5A0A0J9YX44 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-5A0A0J9YX44 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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TRBV5-5A0A0J9YX44 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV5-5A0A0J9YX44 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV5-5A0A0J9YX44 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV5-5A0A0J9YX44 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV5-5A0A0J9YX44 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV5-5A0A0J9YX44 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV5-5A0A0J9YX44 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV5-5A0A0J9YX44 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV5-5A0A0J9YX44 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV5-5A0A0J9YX44 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV5-5A0A0J9YX44 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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TRBV5-5A0A0J9YX44 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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TRBV5-5A0A0J9YX44 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV5-5A0A0J9YX44 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV5-5A0A0J9YX44 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV5-5A0A0J9YX44 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV5-5A0A0J9YX44 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV5-5A0A0J9YX44 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV5-5A0A0J9YX44 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV5-5A0A0J9YX44 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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TRBV5-5A0A0J9YX44 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV5-5A0A0J9YX44 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV5-5A0A0J9YX44 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV5-5A0A0J9YX44 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV5-5A0A0J9YX44 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV5-5A0A0J9YX44 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV5-5A0A0J9YX44 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV5-5A0A0J9YX44 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV5-5A0A0J9YX44 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV5-5A0A0J9YX44 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV5-5A0A0J9YX44 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV5-5A0A0J9YX44 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV5-5A0A0J9YX44 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV5-5A0A0J9YX44 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRBV5-5A0A0J9YX44 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRBV5-5A0A0J9YX44 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV5-5A0A0J9YX44 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV5-5A0A0J9YX44 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV5-5A0A0J9YX44 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV5-5A0A0J9YX44 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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