Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS05

TRBV5-7, T-cell receptor beta variable 5-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-7A0A0A0MS05 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV5-7A0A0A0MS05 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV5-7A0A0A0MS05 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV5-7A0A0A0MS05 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV5-7A0A0A0MS05 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV5-7A0A0A0MS05 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRBV5-7A0A0A0MS05 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV5-7A0A0A0MS05 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV5-7A0A0A0MS05 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRBV5-7A0A0A0MS05 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV5-7A0A0A0MS05 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRBV5-7A0A0A0MS05 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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