RNA–Protein interactions for RNA: tK(UUU)D

tK(UUU)D, Transcript of Lysine tRNA (tRNA-Lys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tK(UUU)D, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tK(UUU)DtK(UUU)D INO80P53115 1489 aa6.42□□□□□ -1.38
tK(UUU)DtK(UUU)D MON2P48563 1636 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
tK(UUU)DtK(UUU)D SGS1P35187 1447 aa6.14□□□□□ -1.43
tK(UUU)DtK(UUU)D TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
tK(UUU)DtK(UUU)D DNA2P38859 1522 aa6.03□□□□□ -1.44
tK(UUU)DtK(UUU)D SWR1Q05471 1514 aa6.02□□□□□ -1.45
tK(UUU)DtK(UUU)D KOG1P38873 1557 aa5.98□□□□□ -1.45
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-DR4Q07793 1604 aa5.97□□□□□ -1.45
tK(UUU)DtK(UUU)D RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
tK(UUU)DtK(UUU)D SPA2P23201 1466 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
tK(UUU)DtK(UUU)D SPT6P23615 1451 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
tK(UUU)DtK(UUU)D HSL1P34244 1518 aa5.79□□□□□ -1.48
tK(UUU)DtK(UUU)D ECM5Q03214 1411 aa5.76□□□□□ -1.49
tK(UUU)DtK(UUU)D MTC1P47018 478 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
tK(UUU)DtK(UUU)D HIR3P47171 1648 aa5.7□□□□□ -1.5
tK(UUU)DtK(UUU)D BUD4P47136 1447 aa5.68□□□□□ -1.5
tK(UUU)DtK(UUU)D XRN1P22147 1528 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
tK(UUU)DtK(UUU)D THO2P53552 1597 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
tK(UUU)DtK(UUU)D DRS1P32892 752 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
tK(UUU)DtK(UUU)D SSN2P38931 1420 aa5.62□□□□□ -1.51
tK(UUU)DtK(UUU)D MDS3P53094 1487 aa5.54□□□□□ -1.52
tK(UUU)DtK(UUU)D SKI3P17883 1432 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
tK(UUU)DtK(UUU)D TAF2P23255 1407 aa5.51□□□□□ -1.53
tK(UUU)DtK(UUU)D PEP1P32319 1579 aa5.5□□□□□ -1.53
tK(UUU)DtK(UUU)D REV3P14284 1504 aa5.49□□□□□ -1.53
tK(UUU)DtK(UUU)D BPT1P14772 1559 aa5.46□□□□□ -1.53
tK(UUU)DtK(UUU)D ATG2P53855 1592 aa5.46□□□□□ -1.54
tK(UUU)DtK(UUU)D SIN3P22579 1536 aa5.43□□□□□ -1.54
tK(UUU)DtK(UUU)D RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
tK(UUU)DtK(UUU)D UFD4P33202 1483 aa5.39□□□□□ -1.55
tK(UUU)DtK(UUU)D SSK2P53599 1579 aa5.38□□□□□ -1.55
tK(UUU)DtK(UUU)D ESP1Q03018 1630 aa5.37□□□□□ -1.55
tK(UUU)DtK(UUU)D YPK9Q12697 1472 aa5.35□□□□□ -1.55
tK(UUU)DtK(UUU)D YCF1P39109 1515 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
tK(UUU)DtK(UUU)D MYO2P19524 1574 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
tK(UUU)DtK(UUU)D RPO31P04051 1460 aa5.32□□□□□ -1.56
tK(UUU)DtK(UUU)D SCC2Q04002 1493 aa5.31□□□□□ -1.56
tK(UUU)DtK(UUU)D MET5P47169 1442 aa5.3□□□□□ -1.56
tK(UUU)DtK(UUU)D CHD1P32657 1468 aa5.29□□□□□ -1.56
tK(UUU)DtK(UUU)D TOP2P06786 1428 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
tK(UUU)DtK(UUU)D PAN1P32521 1480 aa5.26□□□□□ -1.57
tK(UUU)DtK(UUU)D CDC25P04821 1589 aa5.23□□□□□ -1.57
tK(UUU)DtK(UUU)D LTE1P07866 1435 aa5.22□□□□□ -1.57
tK(UUU)DtK(UUU)D MMS22Q06164 1454 aa5.21□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D YTA7P40340 1379 aa5.21□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D MIF2P35201 549 aa5.21□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D TRM732Q03496 1420 aa5.21□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D POL1P13382 1468 aa5.2□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D SMC4Q12267 1418 aa5.2□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D RTT106P40161 455 aa5.19□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D RKR1Q04781 1562 aa5.19□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D STH1P32597 1359 aa5.18□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D MET10P39692 1035 aa5.18□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D ITT1Q04638 464 aa5.18□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D TAF7Q05021 590 aa5.18□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D STU1P38198 1513 aa5.18□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa5.17□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D TY2B-FP0CX63 1770 aa5.17□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D TY2B-GR2P0CX64 1770 aa5.17□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D TY2B-CP25384 1770 aa5.17□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D TY2B-DR2Q03494 1770 aa5.17□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-DR1Q03855 1755 aa5.17□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D TY2B-OR1Q12113 1770 aa5.17□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D TY2B-DR1Q12472 1770 aa5.17□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D TY2B-OR2Q12501 1770 aa5.17□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D ABP1P15891 592 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D DNF1P32660 1571 aa5.16□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D SPP41P38904 1435 aa5.16□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D YOR1P53049 1477 aa5.16□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-BRQ12193 1756 aa5.15□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-GR3Q12316 1755 aa5.15□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-ORQ92393 1755 aa5.15□□□□□ -1.58
tK(UUU)DtK(UUU)D TSC11P40061 1430 aa5.14□□□□□ -1.59
tK(UUU)DtK(UUU)D GEA2P39993 1459 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
tK(UUU)DtK(UUU)D DRS2P39524 1355 aa5.12□□□□□ -1.59
tK(UUU)DtK(UUU)D RPA190P10964 1664 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
tK(UUU)DtK(UUU)D NUP159P40477 1460 aa5.11□□□□□ -1.59
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-HO13535 1793 aa5.11□□□□□ -1.59
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa5.11□□□□□ -1.59
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa5.11□□□□□ -1.59
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa5.11□□□□□ -1.59
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa5.11□□□□□ -1.59
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-JR1P47098 1755 aa5.11□□□□□ -1.59
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-ER1Q03612 1755 aa5.11□□□□□ -1.59
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-GR2Q12269 1755 aa5.11□□□□□ -1.59
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-OLQ12273 1755 aa5.11□□□□□ -1.59
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
tK(UUU)DtK(UUU)D TY2B-BQ12491 1770 aa5.11□□□□□ -1.59
tK(UUU)DtK(UUU)D MYO4P32492 1471 aa5.1□□□□□ -1.59
tK(UUU)DtK(UUU)D TY1B-DR3Q99231 1755 aa5.1□□□□□ -1.59
tK(UUU)DtK(UUU)D SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
tK(UUU)DtK(UUU)D SNT2P53127 1403 aa5.07□□□□□ -1.6
tK(UUU)DtK(UUU)D MMS1Q06211 1407 aa5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.7 ms