RNA–Protein interactions for RNA: YDL093W

PMT5, Transcript of Protein O-mannosyltransferase, yeast

Gene PMT5, Length 2,232 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PMT5	YDL093W	DRS1	P32892	752 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
PMT5	YDL093W	MTC1	P47018	478 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
PMT5	YDL093W	TFA1	P36100	482 aa		10.18	□□□□□ -0.78
PMT5	YDL093W	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PMT5	YDL093W	AVT3	P36062	692 aa		9.47	□□□□□ -0.89
PMT5	YDL093W	RQC2	Q12532	1038 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
PMT5	YDL093W	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
PMT5	YDL093W	TAF7	Q05021	590 aa		8.89	□□□□□ -0.99
PMT5	YDL093W	DMA1	P38823	416 aa		8.68	□□□□□ -1.02
PMT5	YDL093W	RSE1	Q04693	1361 aa	Known RBP	8.46	□□□□□ -1.05
PMT5	YDL093W	LEO1	P38439	464 aa		8.41	□□□□□ -1.06
PMT5	YDL093W	PTP3	P40048	928 aa		8.22	□□□□□ -1.09
PMT5	YDL093W	ISW2	Q08773	1120 aa		8.12	□□□□□ -1.11
PMT5	YDL093W	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	8.1	□□□□□ -1.11
PMT5	YDL093W	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	8.1	□□□□□ -1.11
PMT5	YDL093W	LEU3	P08638	886 aa		8.06	□□□□□ -1.12
PMT5	YDL093W	RIM101	P33400	625 aa		8.05	□□□□□ -1.12
PMT5	YDL093W	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	8.03	□□□□□ -1.12
PMT5	YDL093W	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	8.03	□□□□□ -1.12
PMT5	YDL093W	SSP1	P38871	571 aa		8.03	□□□□□ -1.12
PMT5	YDL093W	SPT21	P35209	758 aa		7.99	□□□□□ -1.13
PMT5	YDL093W	REB1	P21538	810 aa		7.86	□□□□□ -1.15
PMT5	YDL093W	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	7.85	□□□□□ -1.15
PMT5	YDL093W	OXP1	P28273	1286 aa		7.84	□□□□□ -1.15
PMT5	YDL093W	PRI1	P10363	409 aa		7.81	□□□□□ -1.16
PMT5	YDL093W	INO80	P53115	1489 aa		7.77	□□□□□ -1.17
PMT5	YDL093W	DMA2	P53924	522 aa		7.76	□□□□□ -1.17
PMT5	YDL093W	YLR271W	Q06152	274 aa		7.76	□□□□□ -1.17
PMT5	YDL093W	ABP1	P15891	592 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
PMT5	YDL093W	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.74	□□□□□ -1.17	not detected
PMT5	YDL093W	YAH1	Q12184	172 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.17
PMT5	YDL093W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
PMT5	YDL093W	MGA2	P40578	1113 aa		7.66	□□□□□ -1.18
PMT5	YDL093W	RLF2	Q12495	606 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PMT5	YDL093W	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
PMT5	YDL093W	CST9	Q06032	482 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PMT5	YDL093W	FAP1	P53971	965 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PMT5	YDL093W	CKB1	P43639	278 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PMT5	YDL093W	RSM7	P47150	247 aa		7.52	□□□□□ -1.2
PMT5	YDL093W	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
PMT5	YDL093W	AAD16	Q02895	342 aa		7.49	□□□□□ -1.21
PMT5	YDL093W	YPR148C	Q06523	435 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PMT5	YDL093W	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
PMT5	YDL093W	IFH1	P39520	1085 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PMT5	YDL093W	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
PMT5	YDL093W	DNA2	P38859	1522 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PMT5	YDL093W	RAM2	P29703	316 aa		7.42	□□□□□ -1.22
PMT5	YDL093W	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
PMT5	YDL093W	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
PMT5	YDL093W	SWR1	Q05471	1514 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PMT5	YDL093W	VPS70	P47161	811 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PMT5	YDL093W	DSF2	P38213	736 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PMT5	YDL093W	KOG1	P38873	1557 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PMT5	YDL093W	TFC8	Q12308	588 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PMT5	YDL093W	AI2	P03876	854 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PMT5	YDL093W	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PMT5	YDL093W	KIN1	P13185	1064 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PMT5	YDL093W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PMT5	YDL093W	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PMT5	YDL093W	HO	P09932	586 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PMT5	YDL093W	PBS2	P08018	668 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PMT5	YDL093W	RCR1	P38212	213 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PMT5	YDL093W	AIM7	Q12156	149 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PMT5	YDL093W	DCD1	P06773	312 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PMT5	YDL093W	GLC3	P32775	704 aa		7.21	□□□□□ -1.26
PMT5	YDL093W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
PMT5	YDL093W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
PMT5	YDL093W	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
PMT5	YDL093W	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
PMT5	YDL093W	YML020W	Q03722	664 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PMT5	YDL093W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
PMT5	YDL093W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
PMT5	YDL093W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
PMT5	YDL093W	BCH2	P36122	765 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PMT5	YDL093W	BBC1	P47068	1157 aa		7.16	□□□□□ -1.26
PMT5	YDL093W	DIT2	P21595	489 aa		7.15	□□□□□ -1.27
PMT5	YDL093W	MRM1	P25270	412 aa		7.15	□□□□□ -1.27
PMT5	YDL093W	MAM3	Q12296	706 aa		7.14	□□□□□ -1.27
PMT5	YDL093W	CDC27	P38042	758 aa		7.12	□□□□□ -1.27
PMT5	YDL093W	IES2	P40154	320 aa		7.12	□□□□□ -1.27
PMT5	YDL093W	AIM44	Q99299	758 aa		7.12	□□□□□ -1.27
PMT5	YDL093W	HPC2	Q01448	625 aa		7.11	□□□□□ -1.27
PMT5	YDL093W	IOC4	Q04213	475 aa		7.11	□□□□□ -1.27
PMT5	YDL093W	RTG3	P38165	486 aa		7.1	□□□□□ -1.27
PMT5	YDL093W	PRY3	P47033	881 aa		7.08	□□□□□ -1.28
PMT5	YDL093W	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
PMT5	YDL093W	COQ8	P27697	501 aa		7.08	□□□□□ -1.28
PMT5	YDL093W	EPS1	P40557	701 aa		7.08	□□□□□ -1.28
PMT5	YDL093W	SLX8	P40072	274 aa		7.07	□□□□□ -1.28
PMT5	YDL093W	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	7.07	□□□□□ -1.28
PMT5	YDL093W	GEF1	P37020	779 aa		7.07	□□□□□ -1.28
PMT5	YDL093W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
PMT5	YDL093W	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
PMT5	YDL093W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
PMT5	YDL093W	MRPL32	P25348	183 aa		7.06	□□□□□ -1.28
PMT5	YDL093W	SGS1	P35187	1447 aa		7.05	□□□□□ -1.28
PMT5	YDL093W	TFB3	Q03290	321 aa		7.04	□□□□□ -1.28
PMT5	YDL093W	VPS29	P38759	282 aa		7.03	□□□□□ -1.28
PMT5	YDL093W	BDF1	P35817	686 aa		7.02	□□□□□ -1.29
PMT5	YDL093W	HSL1	P34244	1518 aa		7.02	□□□□□ -1.29

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