RNA–Protein interactions for RNA: YAL059C-A

YAL059C-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YAL059C-A, Length 423 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAL059C-AYAL059C-A ESP1Q03018 1630 aa3.52□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A RET1P22276 1149 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A AIM26P32858 118 aa3.52□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A HSE1P38753 452 aa3.52□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A SLS1P42900 643 aa3.52□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A MTR4P47047 1073 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A ACF4P47129 309 aa3.52□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A GSF2Q04697 403 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A LAP2Q10740 671 aa3.52□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A YLR358CO13565 187 aa3.51□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A MDL2P33311 773 aa3.51□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data3.51□□□□□ -1.85not detected
YAL059C-AYAL059C-A MNL2Q12205 849 aa3.51□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A EXO5P38289 585 aa3.5□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A HRK1Q08732 759 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A TUB2P02557 457 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A SAM35P14693 329 aa3.49□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A NEM1P38757 446 aa3.49□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A YNR063WP53749 607 aa3.49□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A NBA1Q08229 501 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A RLF2Q12495 606 aa3.49□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A ATG2P53855 1592 aa3.49□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A POL1P13382 1468 aa3.48□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A BPT1P14772 1559 aa3.48□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A SHM2P37291 469 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A RSA3Q05942 220 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A STU1P38198 1513 aa3.48□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A MYO2P19524 1574 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A SPS1P08458 490 aa3.47□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A TRL1P09880 827 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A SRO9P25567 434 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A SAM37P50110 327 aa3.47□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A PEX13P80667 386 aa3.47□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A PNS1Q12412 539 aa3.47□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A UFD4P33202 1483 aa3.47□□□□□ -1.85
YAL059C-AYAL059C-A ECM5Q03214 1411 aa3.46□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A MSH3P25336 1018 aa3.46□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A CTS1P29029 562 aa3.46□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A GRS1P38088 690 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A XKS1P42826 600 aa3.46□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A YJL045WP47052 634 aa3.46□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A SPT20P50875 604 aa3.46□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A UTP5Q04177 643 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A YCS4Q06156 1176 aa3.46□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A TAF2P23255 1407 aa3.45□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data3.45□□□□□ -1.86not detected
YAL059C-AYAL059C-A CIC1P38779 376 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data3.45□□□□□ -1.86not detected
YAL059C-AYAL059C-A RSM26P47141 266 aa3.45□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A ENV11P53246 860 aa3.45□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A NOG1Q02892 647 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A PEP1P32319 1579 aa3.44□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A YPK9Q12697 1472 aa3.44□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A VMA4P22203 233 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A SQT1P35184 431 aa3.44□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A QNS1P38795 714 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A SGD1Q06132 899 aa3.44□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A RSC58Q07979 502 aa3.44□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A NUP170P38181 1502 aa3.44□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A SCC2Q04002 1493 aa3.43□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A YSC84P32793 468 aa3.43□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A TAT2P38967 592 aa3.43□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A MDJ2P42834 146 aa3.43□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A VPS53P47061 822 aa3.43□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A GPI13Q07830 1017 aa3.43□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A TRM732Q03496 1420 aa3.43□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A COQ4O13525 335 aa3.42□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data3.42□□□□□ -1.86not detected
YAL059C-AYAL059C-A CCZ1P38273 704 aa3.42□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A ERP5P38819 212 aa3.42□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A RSB1Q08417 382 aa3.42□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A FRT1Q99332 602 aa3.42□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A DNA2P38859 1522 aa3.42□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A YOR1P53049 1477 aa3.41□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A TY1B-DR3Q99231 1755 aa3.41□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A CYC1P00044 109 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data3.41□□□□□ -1.86not detected
YAL059C-AYAL059C-A LAM1P38851 1228 aa3.41□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A MEF2P39677 819 aa3.41□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A HNT2P49775 206 aa3.41□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A GCN5Q03330 439 aa3.41□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A ROT1Q03691 256 aa3.41□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A TAD3Q9URQ3 322 aa3.41□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A BUD4P47136 1447 aa3.41□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A RKR1Q04781 1562 aa3.41□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa3.4□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A TY2B-FP0CX63 1770 aa3.4□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A TY2B-GR2P0CX64 1770 aa3.4□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A TY2B-CP25384 1770 aa3.4□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A TY2B-DR2Q03494 1770 aa3.4□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A TY1B-DR1Q03855 1755 aa3.4□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A TY2B-OR1Q12113 1770 aa3.4□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A TY2B-DR1Q12472 1770 aa3.4□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A TY2B-OR2Q12501 1770 aa3.4□□□□□ -1.86
YAL059C-AYAL059C-A SSA1P10591 642 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 39.1 ms