Protein–RNA interactions for Protein: P47052

YJL045W, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit 2, mitochondrial, yeastyeast

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Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL045WP47052 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.5■■□□□ 1.03
YJL045WP47052 NOP1YDL014W 984 nt21.06■□□□□ 0.96
YJL045WP47052 NSR1YGR159C 1245 nt21.04■□□□□ 0.96
YJL045WP47052 YKL036CYKL036C 393 nt19.92■□□□□ 0.78
YJL045WP47052 MDJ1YFL016C 1536 nt18.96■□□□□ 0.63
YJL045WP47052 YJL027CYJL027C 417 nt18.74■□□□□ 0.59
YJL045WP47052 Q0297Q0297 156 nt18.53■□□□□ 0.56
YJL045WP47052 SCS3YGL126W 1143 nt18.38■□□□□ 0.53
YJL045WP47052 SRX1YKL086W 384 nt18.36■□□□□ 0.53
YJL045WP47052 YCR051WYCR051W 669 nt17.58■□□□□ 0.4
YJL045WP47052 YOL085CYOL085C 342 nt17.21■□□□□ 0.35
YJL045WP47052 PKP1YIL042C 1185 nt16.98■□□□□ 0.31
YJL045WP47052 SCJ1YMR214W 1134 nt16.86■□□□□ 0.29
YJL045WP47052 DBP2YNL112W 1641 nt16.7■□□□□ 0.26
YJL045WP47052 RPP1BYDL130W 321 nt16.67■□□□□ 0.26
YJL045WP47052 ATS1YAL020C 1002 nt16.57■□□□□ 0.24
YJL045WP47052 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.28■□□□□ 0.2
YJL045WP47052 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.28■□□□□ 0.2
YJL045WP47052 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.28■□□□□ 0.2
YJL045WP47052 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.28■□□□□ 0.2
YJL045WP47052 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.28■□□□□ 0.2
YJL045WP47052 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.28■□□□□ 0.2
YJL045WP47052 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.28■□□□□ 0.2
YJL045WP47052 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.28■□□□□ 0.2
YJL045WP47052 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.28■□□□□ 0.2
YJL045WP47052 CCC1YLR220W 969 nt16.27■□□□□ 0.2
YJL045WP47052 YBR190WYBR190W 312 nt16.1■□□□□ 0.17
YJL045WP47052 SCR1SCR1 522 nt15.9■□□□□ 0.14
YJL045WP47052 PET122YER153C 765 nt15.89■□□□□ 0.13
YJL045WP47052 RTC3YHR087W 336 nt15.79■□□□□ 0.12
YJL045WP47052 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.61■□□□□ 0.09
YJL045WP47052 RVS167YDR388W 1449 nt15.54■□□□□ 0.08
YJL045WP47052 RRN5YLR141W 1092 nt15.49■□□□□ 0.07
YJL045WP47052 RSB1YOR049C 1065 nt15.39■□□□□ 0.05
YJL045WP47052 PST2YDR032C 597 nt15.22■□□□□ 0.03
YJL045WP47052 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.17■□□□□ 0.02
YJL045WP47052 YDJ1YNL064C 1230 nt15.05■□□□□ -0
YJL045WP47052 SHR5YOL110W 714 nt14.99□□□□□ -0.01
YJL045WP47052 YKL097CYKL097C 411 nt14.98□□□□□ -0.01
YJL045WP47052 PUT4YOR348C 1884 nt14.8□□□□□ -0.04
YJL045WP47052 DEP1YAL013W 1218 nt14.75□□□□□ -0.05
YJL045WP47052 GAR1YHR089C 618 nt14.74□□□□□ -0.05
YJL045WP47052 URN1YPR152C 1398 nt14.73□□□□□ -0.05
YJL045WP47052 SAH1YER043C 1350 nt14.53□□□□□ -0.08
YJL045WP47052 SHU1YHL006C 453 nt14.53□□□□□ -0.08
YJL045WP47052 OPI9YLR338W 858 nt14.51□□□□□ -0.09
YJL045WP47052 ARE1YCR048W 1833 nt14.5□□□□□ -0.09
YJL045WP47052 YNL208WYNL208W 600 nt14.38□□□□□ -0.11
YJL045WP47052 POA1YBR022W 534 nt14.37□□□□□ -0.11
YJL045WP47052 RPN10YHR200W 807 nt14.36□□□□□ -0.11
YJL045WP47052 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.3□□□□□ -0.12
YJL045WP47052 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.22□□□□□ -0.13
YJL045WP47052 YOR139CYOR139C 393 nt14.22□□□□□ -0.13
YJL045WP47052 TIR1YER011W 765 nt14.18□□□□□ -0.14
YJL045WP47052 SSA3YBL075C 1950 nt14.16□□□□□ -0.14
YJL045WP47052 NPL3YDR432W 1245 nt14.08□□□□□ -0.16
YJL045WP47052 BSC6YOL137W 1494 nt14.06□□□□□ -0.16
YJL045WP47052 PUN1YLR414C 792 nt14.05□□□□□ -0.16
YJL045WP47052 YJR018WYJR018W 363 nt14.02□□□□□ -0.17
YJL045WP47052 PTC2YER089C 1395 nt13.99□□□□□ -0.17
YJL045WP47052 BUD23YCR047C 828 nt13.99□□□□□ -0.17
YJL045WP47052 SSA1YAL005C 1929 nt13.96□□□□□ -0.18
YJL045WP47052 YJR120WYJR120W 351 nt13.84□□□□□ -0.19
YJL045WP47052 SRB2YHR041C 633 nt13.78□□□□□ -0.2
YJL045WP47052 NAB2YGL122C 1578 nt13.77□□□□□ -0.21
YJL045WP47052 MNP1YGL068W 585 nt13.75□□□□□ -0.21
YJL045WP47052 YGR021WYGR021W 873 nt13.71□□□□□ -0.21
YJL045WP47052 YOL037CYOL037C 354 nt13.67□□□□□ -0.22
YJL045WP47052 WWM1YFL010C 636 nt13.66□□□□□ -0.22
YJL045WP47052 HOM6YJR139C 1080 nt13.66□□□□□ -0.22
YJL045WP47052 RPP2BYDR382W 333 nt13.64□□□□□ -0.23
YJL045WP47052 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.62□□□□□ -0.23
YJL045WP47052 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.62□□□□□ -0.23
YJL045WP47052 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.62□□□□□ -0.23
YJL045WP47052 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.62□□□□□ -0.23
YJL045WP47052 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.62□□□□□ -0.23
YJL045WP47052 FPR4YLR449W 1179 nt13.61□□□□□ -0.23
YJL045WP47052 FIS1YIL065C 468 nt13.59□□□□□ -0.23
YJL045WP47052 DAL1YIR027C 1383 nt13.57□□□□□ -0.24
YJL045WP47052 SPT5YML010W 3192 nt13.51□□□□□ -0.25
YJL045WP47052 INM2YDR287W 879 nt13.49□□□□□ -0.25
YJL045WP47052 RKM5YLR137W 1104 nt13.49□□□□□ -0.25
YJL045WP47052 PHO4YFR034C 939 nt13.46□□□□□ -0.25
YJL045WP47052 PUS2YGL063W 1113 nt13.42□□□□□ -0.26
YJL045WP47052 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.39□□□□□ -0.27
YJL045WP47052 YBL100CYBL100C 315 nt13.38□□□□□ -0.27
YJL045WP47052 BDH2YAL061W 1254 nt13.37□□□□□ -0.27
YJL045WP47052 MOT3YMR070W 1473 nt13.33□□□□□ -0.28
YJL045WP47052 YLR281CYLR281C 468 nt13.29□□□□□ -0.28
YJL045WP47052 YPS1YLR120C 1710 nt13.25□□□□□ -0.29
YJL045WP47052 FUN26YAL022C 1554 nt13.24□□□□□ -0.29
YJL045WP47052 WHI5YOR083W 888 nt13.22□□□□□ -0.29
YJL045WP47052 MEP2YNL142W 1500 nt13.18□□□□□ -0.3
YJL045WP47052 TRM9YML014W 840 nt13.16□□□□□ -0.3
YJL045WP47052 YDR095CYDR095C 411 nt13.13□□□□□ -0.31
YJL045WP47052 LSM3YLR438C-A 270 nt13.13□□□□□ -0.31
YJL045WP47052 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.12□□□□□ -0.31
YJL045WP47052 FMP45YDL222C 930 nt13.09□□□□□ -0.31
YJL045WP47052 SSA4YER103W 1929 nt13.07□□□□□ -0.32
YJL045WP47052 DCW1YKL046C 1350 nt13.06□□□□□ -0.32
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