Protein–RNA interactions for Protein: P21242

PRE10, Probable proteasome subunit alpha type-7, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRE10P21242 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.08■■□□□ 1.29
PRE10P21242 NOP1YDL014W 984 nt22.65■■□□□ 1.22
PRE10P21242 NSR1YGR159C 1245 nt22.46■■□□□ 1.19
PRE10P21242 YKL036CYKL036C 393 nt21.39■■□□□ 1.01
PRE10P21242 YJL027CYJL027C 417 nt20.08■□□□□ 0.81
PRE10P21242 Q0297Q0297 156 nt19.98■□□□□ 0.79
PRE10P21242 SRX1YKL086W 384 nt19.78■□□□□ 0.76
PRE10P21242 SCS3YGL126W 1143 nt19.73■□□□□ 0.75
PRE10P21242 MDJ1YFL016C 1536 nt19.45■□□□□ 0.7
PRE10P21242 YCR051WYCR051W 669 nt18.83■□□□□ 0.6
PRE10P21242 YOL085CYOL085C 342 nt18.51■□□□□ 0.55
PRE10P21242 PKP1YIL042C 1185 nt18.18■□□□□ 0.5
PRE10P21242 SCJ1YMR214W 1134 nt18.14■□□□□ 0.49
PRE10P21242 RPP1BYDL130W 321 nt17.94■□□□□ 0.46
PRE10P21242 ATS1YAL020C 1002 nt17.8■□□□□ 0.44
PRE10P21242 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.56■□□□□ 0.4
PRE10P21242 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.56■□□□□ 0.4
PRE10P21242 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.56■□□□□ 0.4
PRE10P21242 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.56■□□□□ 0.4
PRE10P21242 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.56■□□□□ 0.4
PRE10P21242 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.56■□□□□ 0.4
PRE10P21242 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.56■□□□□ 0.4
PRE10P21242 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.56■□□□□ 0.4
PRE10P21242 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.56■□□□□ 0.4
PRE10P21242 CCC1YLR220W 969 nt17.43■□□□□ 0.38
PRE10P21242 DBP2YNL112W 1641 nt17.39■□□□□ 0.38
PRE10P21242 PET122YER153C 765 nt17.08■□□□□ 0.32
PRE10P21242 SCR1SCR1 522 nt17.06■□□□□ 0.32
PRE10P21242 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.8■□□□□ 0.28
PRE10P21242 RRN5YLR141W 1092 nt16.65■□□□□ 0.26
PRE10P21242 RTC3YHR087W 336 nt16.52■□□□□ 0.24
PRE10P21242 RVS167YDR388W 1449 nt16.52■□□□□ 0.23
PRE10P21242 RSB1YOR049C 1065 nt16.47■□□□□ 0.23
PRE10P21242 YBR190WYBR190W 312 nt16.43■□□□□ 0.22
PRE10P21242 PST2YDR032C 597 nt16.39■□□□□ 0.21
PRE10P21242 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.32■□□□□ 0.2
PRE10P21242 YDJ1YNL064C 1230 nt16.24■□□□□ 0.19
PRE10P21242 SHR5YOL110W 714 nt16.05■□□□□ 0.16
PRE10P21242 YKL097CYKL097C 411 nt16.03■□□□□ 0.16
PRE10P21242 SSA3YBL075C 1950 nt15.87■□□□□ 0.13
PRE10P21242 GAR1YHR089C 618 nt15.81■□□□□ 0.12
PRE10P21242 SHU1YHL006C 453 nt15.6■□□□□ 0.09
PRE10P21242 DEP1YAL013W 1218 nt15.44■□□□□ 0.06
PRE10P21242 URN1YPR152C 1398 nt15.28■□□□□ 0.04
PRE10P21242 YOR139CYOR139C 393 nt15.28■□□□□ 0.04
PRE10P21242 TIR1YER011W 765 nt15.26■□□□□ 0.03
PRE10P21242 YNL208WYNL208W 600 nt15.24■□□□□ 0.03
PRE10P21242 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.22■□□□□ 0.03
PRE10P21242 RPN10YHR200W 807 nt15.18■□□□□ 0.02
PRE10P21242 PUT4YOR348C 1884 nt15.16■□□□□ 0.02
PRE10P21242 NPL3YDR432W 1245 nt15.06■□□□□ 0
PRE10P21242 SSA1YAL005C 1929 nt14.96□□□□□ -0.02
PRE10P21242 OPI9YLR338W 858 nt14.94□□□□□ -0.02
PRE10P21242 SRB2YHR041C 633 nt14.79□□□□□ -0.04
PRE10P21242 YGR021WYGR021W 873 nt14.75□□□□□ -0.05
PRE10P21242 MNP1YGL068W 585 nt14.74□□□□□ -0.05
PRE10P21242 HOM6YJR139C 1080 nt14.72□□□□□ -0.05
PRE10P21242 SAH1YER043C 1350 nt14.71□□□□□ -0.06
PRE10P21242 YOL037CYOL037C 354 nt14.7□□□□□ -0.06
PRE10P21242 WWM1YFL010C 636 nt14.68□□□□□ -0.06
PRE10P21242 ARE1YCR048W 1833 nt14.67□□□□□ -0.06
PRE10P21242 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.65□□□□□ -0.06
PRE10P21242 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.65□□□□□ -0.06
PRE10P21242 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.65□□□□□ -0.06
PRE10P21242 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.65□□□□□ -0.06
PRE10P21242 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.65□□□□□ -0.06
PRE10P21242 YJR018WYJR018W 363 nt14.61□□□□□ -0.07
PRE10P21242 POA1YBR022W 534 nt14.59□□□□□ -0.07
PRE10P21242 PUN1YLR414C 792 nt14.52□□□□□ -0.09
PRE10P21242 RKM5YLR137W 1104 nt14.51□□□□□ -0.09
PRE10P21242 RPP2BYDR382W 333 nt14.48□□□□□ -0.09
PRE10P21242 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.48□□□□□ -0.09
PRE10P21242 YJR120WYJR120W 351 nt14.47□□□□□ -0.09
PRE10P21242 BSC6YOL137W 1494 nt14.43□□□□□ -0.1
PRE10P21242 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.42□□□□□ -0.1
PRE10P21242 PUS2YGL063W 1113 nt14.37□□□□□ -0.11
PRE10P21242 SPT5YML010W 3192 nt14.36□□□□□ -0.11
PRE10P21242 YLR281CYLR281C 468 nt14.32□□□□□ -0.12
PRE10P21242 MOT3YMR070W 1473 nt14.3□□□□□ -0.12
PRE10P21242 BDH2YAL061W 1254 nt14.26□□□□□ -0.13
PRE10P21242 PTC2YER089C 1395 nt14.25□□□□□ -0.13
PRE10P21242 WHI5YOR083W 888 nt14.2□□□□□ -0.14
PRE10P21242 LSM3YLR438C-A 270 nt14.18□□□□□ -0.14
PRE10P21242 SSA4YER103W 1929 nt14.13□□□□□ -0.15
PRE10P21242 BUD23YCR047C 828 nt14.11□□□□□ -0.15
PRE10P21242 INM2YDR287W 879 nt14.02□□□□□ -0.17
PRE10P21242 FMP45YDL222C 930 nt14.01□□□□□ -0.17
PRE10P21242 NAB2YGL122C 1578 nt13.98□□□□□ -0.17
PRE10P21242 YBL100CYBL100C 315 nt13.98□□□□□ -0.17
PRE10P21242 DSK2YMR276W 1122 nt13.96□□□□□ -0.17
PRE10P21242 YPR011CYPR011C 981 nt13.94□□□□□ -0.18
PRE10P21242 MRPL8YJL063C 717 nt13.92□□□□□ -0.18
PRE10P21242 FPR4YLR449W 1179 nt13.92□□□□□ -0.18
PRE10P21242 TRM9YML014W 840 nt13.91□□□□□ -0.18
PRE10P21242 DAL1YIR027C 1383 nt13.91□□□□□ -0.18
PRE10P21242 YCH1YGR203W 447 nt13.9□□□□□ -0.18
PRE10P21242 YLR236CYLR236C 324 nt13.89□□□□□ -0.19
PRE10P21242 IMP2'YIL154C 1041 nt13.88□□□□□ -0.19
PRE10P21242 FIS1YIL065C 468 nt13.83□□□□□ -0.2
PRE10P21242 FUN26YAL022C 1554 nt13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.3 ms