RNA–Protein interactions for RNA: YKR018C

YKR018C, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKR018C, Length 2,178 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR018CYKR018C SSF1P38789 453 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
YKR018CYKR018C EPS1P40557 701 aa8.18□□□□□ -1.1
YKR018CYKR018C YOL098CQ12496 1037 aa8.18□□□□□ -1.1
YKR018CYKR018C CCC2P38995 1004 aa8.17□□□□□ -1.1
YKR018CYKR018C HUL4P40985 892 aa8.17□□□□□ -1.1
YKR018CYKR018C EPL1P43572 832 aa8.17□□□□□ -1.1
YKR018CYKR018C MAL13P53338 473 aa8.17□□□□□ -1.1
YKR018CYKR018C DOS2P54858 310 aa8.17□□□□□ -1.1
YKR018CYKR018C HOT1Q03213 719 aa8.17□□□□□ -1.1
YKR018CYKR018C ATG9Q12142 997 aa8.17□□□□□ -1.1
YKR018CYKR018C PUS1Q12211 544 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
YKR018CYKR018C DAL7P21826 554 aa8.17□□□□□ -1.1
YKR018CYKR018C DEF1P35732 738 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
YKR018CYKR018C BOP3P53958 396 aa8.17□□□□□ -1.1
YKR018CYKR018C ECM23Q02710 187 aa8.17□□□□□ -1.1
YKR018CYKR018C SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
YKR018CYKR018C SDH5Q08230 162 aa8.16□□□□□ -1.1
YKR018CYKR018C ALF1P53904 254 aa8.15□□□□□ -1.1
YKR018CYKR018C VPS38Q05919 439 aa8.15□□□□□ -1.1
YKR018CYKR018C RGP1P16664 663 aa8.15□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C IMP2'P32351 346 aa8.15□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C SWI3P32591 825 aa8.15□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C MIC19P43594 170 aa8.15□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C VPS4P52917 437 aa8.15□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C YDR338CQ05497 695 aa8.15□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C SEC39Q12745 709 aa8.15□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C PGI1P12709 554 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C PEP3P27801 918 aa8.14□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C AFT2Q08957 416 aa8.14□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C HSP82P02829 709 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C AI2P03876 854 aa8.14□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C SEC65P29478 273 aa8.14□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C YEL043WP32618 956 aa8.14□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C SHM1P37292 490 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C SPT8P38915 602 aa8.14□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C MGA2P40578 1113 aa8.14□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C YJR008WP47085 338 aa8.14□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C HXK1P04806 485 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C PTC4P38089 393 aa8.13□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C YJR079WP47126 109 aa8.13□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C ESF1Q06344 628 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C RUD3Q12234 484 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C RAD1P06777 1100 aa8.12□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C SPT5P27692 1063 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C SMF1P38925 575 aa8.12□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C VPS64Q03944 604 aa8.12□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C INP54Q08227 384 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data8.11□□□□□ -1.11not detected
YKR018CYKR018C ADE17P38009 592 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C RCR1P38212 213 aa8.11□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C BUD16P39988 312 aa8.11□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C RAD53P22216 821 aa8.11□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C CDC60P26637 1090 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C HEL1P36113 551 aa8.11□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data8.11□□□□□ -1.11not detected
YKR018CYKR018C YNL011CP53980 444 aa8.11□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C GFD1Q04839 188 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C HCR1Q05775 265 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C OSH2Q12451 1283 aa8.11□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C SPT2P06843 333 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C SEC23P15303 768 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C DIT2P21595 489 aa8.1□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C URA1P28272 314 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C ATG3P40344 310 aa8.1□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C VAC14Q06708 880 aa8.1□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C SAC6P32599 642 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C LAM4P38800 1345 aa8.09□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C RAD3P06839 778 aa8.09□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C PAP1P29468 568 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C YET1P35723 206 aa8.09□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C EFM4P40516 257 aa8.09□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C YJR142WP47173 342 aa8.09□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C ERG5P54781 538 aa8.09□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C DCS2Q12123 353 aa8.09□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C RMP1Q12530 201 aa8.09□□□□□ -1.11
YKR018CYKR018C HCA4P20448 770 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C MCX1P38323 520 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C SET1P38827 1080 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C RIO2P40160 425 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C YMR147WP40218 223 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C VTC3Q02725 835 aa8.08□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C STE23Q06010 1027 aa8.08□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C HMI1Q12039 706 aa8.08□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data8.08□□□□□ -1.12not detected
YKR018CYKR018C APL2P36000 726 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C MAK10Q02197 733 aa8.07□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C SLM3Q12093 417 aa8.07□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C TOP1P04786 769 aa8.07□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C MTF2P10849 440 aa8.07□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C PMR1P13586 950 aa8.07□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C OPI1P21957 404 aa8.07□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C SEC14P24280 304 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C RPN10P38886 268 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C VPS8P39702 1274 aa8.07□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C TRS85P46944 698 aa8.07□□□□□ -1.12
YKR018CYKR018C ALD3P54114 506 aa8.07□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 129.1 ms