Protein–RNA interactions for Protein: Q12093

SLM3, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, yeastyeast

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM3Q12093 YML009W-BYML009W-B 477 nt27.09■■□□□ 1.93
SLM3Q12093 NOP1YDL014W 984 nt26.46■■□□□ 1.83
SLM3Q12093 NSR1YGR159C 1245 nt26.35■■□□□ 1.81
SLM3Q12093 YKL036CYKL036C 393 nt24.96■■□□□ 1.59
SLM3Q12093 YJL027CYJL027C 417 nt23.44■■□□□ 1.34
SLM3Q12093 Q0297Q0297 156 nt23.35■■□□□ 1.33
SLM3Q12093 SRX1YKL086W 384 nt23.15■■□□□ 1.3
SLM3Q12093 SCS3YGL126W 1143 nt23.02■■□□□ 1.28
SLM3Q12093 MDJ1YFL016C 1536 nt22.99■■□□□ 1.27
SLM3Q12093 YCR051WYCR051W 669 nt22.07■■□□□ 1.12
SLM3Q12093 YOL085CYOL085C 342 nt21.63■■□□□ 1.05
SLM3Q12093 PKP1YIL042C 1185 nt21.32■■□□□ 1
SLM3Q12093 RPP1BYDL130W 321 nt20.97■□□□□ 0.95
SLM3Q12093 SCJ1YMR214W 1134 nt20.97■□□□□ 0.95
SLM3Q12093 ATS1YAL020C 1002 nt20.74■□□□□ 0.91
SLM3Q12093 TRN1tP(UGG)A 72 nt20.61■□□□□ 0.89
SLM3Q12093 SUF9tP(UGG)F 72 nt20.61■□□□□ 0.89
SLM3Q12093 SUF8tP(UGG)H 72 nt20.61■□□□□ 0.89
SLM3Q12093 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt20.61■□□□□ 0.89
SLM3Q12093 SUF7tP(UGG)M 72 nt20.61■□□□□ 0.89
SLM3Q12093 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt20.61■□□□□ 0.89
SLM3Q12093 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt20.61■□□□□ 0.89
SLM3Q12093 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt20.61■□□□□ 0.89
SLM3Q12093 SUF11tP(UGG)O2 72 nt20.61■□□□□ 0.89
SLM3Q12093 DBP2YNL112W 1641 nt20.52■□□□□ 0.88
SLM3Q12093 CCC1YLR220W 969 nt20.51■□□□□ 0.87
SLM3Q12093 PET122YER153C 765 nt20.02■□□□□ 0.8
SLM3Q12093 SCR1SCR1 522 nt19.91■□□□□ 0.78
SLM3Q12093 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt19.7■□□□□ 0.74
SLM3Q12093 RRN5YLR141W 1092 nt19.51■□□□□ 0.71
SLM3Q12093 RVS167YDR388W 1449 nt19.38■□□□□ 0.69
SLM3Q12093 YBR190WYBR190W 312 nt19.36■□□□□ 0.69
SLM3Q12093 RSB1YOR049C 1065 nt19.27■□□□□ 0.68
SLM3Q12093 RTC3YHR087W 336 nt19.2■□□□□ 0.66
SLM3Q12093 YER088W-BYER088W-B 147 nt19.11■□□□□ 0.65
SLM3Q12093 PST2YDR032C 597 nt19.1■□□□□ 0.65
SLM3Q12093 YDJ1YNL064C 1230 nt19■□□□□ 0.63
SLM3Q12093 SHR5YOL110W 714 nt18.84■□□□□ 0.61
SLM3Q12093 YKL097CYKL097C 411 nt18.65■□□□□ 0.58
SLM3Q12093 GAR1YHR089C 618 nt18.59■□□□□ 0.57
SLM3Q12093 SHU1YHL006C 453 nt18.24■□□□□ 0.51
SLM3Q12093 DEP1YAL013W 1218 nt18.23■□□□□ 0.51
SLM3Q12093 URN1YPR152C 1398 nt18.02■□□□□ 0.47
SLM3Q12093 TIR1YER011W 765 nt17.9■□□□□ 0.46
SLM3Q12093 YNL208WYNL208W 600 nt17.9■□□□□ 0.46
SLM3Q12093 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt17.85■□□□□ 0.45
SLM3Q12093 YOR139CYOR139C 393 nt17.83■□□□□ 0.44
SLM3Q12093 RPN10YHR200W 807 nt17.81■□□□□ 0.44
SLM3Q12093 OPI9YLR338W 858 nt17.6■□□□□ 0.41
SLM3Q12093 SSA1YAL005C 1929 nt17.6■□□□□ 0.41
SLM3Q12093 NPL3YDR432W 1245 nt17.54■□□□□ 0.4
SLM3Q12093 SRB2YHR041C 633 nt17.45■□□□□ 0.38
SLM3Q12093 SAH1YER043C 1350 nt17.41■□□□□ 0.38
SLM3Q12093 MNP1YGL068W 585 nt17.3■□□□□ 0.36
SLM3Q12093 WWM1YFL010C 636 nt17.25■□□□□ 0.35
SLM3Q12093 HOM6YJR139C 1080 nt17.23■□□□□ 0.35
SLM3Q12093 YGR021WYGR021W 873 nt17.21■□□□□ 0.35
SLM3Q12093 YJR018WYJR018W 363 nt17.21■□□□□ 0.35
SLM3Q12093 PUT4YOR348C 1884 nt17.18■□□□□ 0.34
SLM3Q12093 YOL037CYOL037C 354 nt17.12■□□□□ 0.33
SLM3Q12093 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt17.08■□□□□ 0.32
SLM3Q12093 IMT4tM(CAU)E 72 nt17.08■□□□□ 0.32
SLM3Q12093 IMT3tM(CAU)J3 72 nt17.08■□□□□ 0.32
SLM3Q12093 IMT1tM(CAU)O1 72 nt17.08■□□□□ 0.32
SLM3Q12093 IMT2tM(CAU)P 72 nt17.08■□□□□ 0.32
SLM3Q12093 YJR120WYJR120W 351 nt17.08■□□□□ 0.32
SLM3Q12093 PUN1YLR414C 792 nt17.08■□□□□ 0.32
SLM3Q12093 ARE1YCR048W 1833 nt17.07■□□□□ 0.32
SLM3Q12093 RPP2BYDR382W 333 nt16.98■□□□□ 0.31
SLM3Q12093 RKM5YLR137W 1104 nt16.98■□□□□ 0.31
SLM3Q12093 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt16.88■□□□□ 0.29
SLM3Q12093 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt16.87■□□□□ 0.29
SLM3Q12093 PTC2YER089C 1395 nt16.84■□□□□ 0.29
SLM3Q12093 PUS2YGL063W 1113 nt16.78■□□□□ 0.28
SLM3Q12093 SSA3YBL075C 1950 nt16.77■□□□□ 0.27
SLM3Q12093 POA1YBR022W 534 nt16.75■□□□□ 0.27
SLM3Q12093 BDH2YAL061W 1254 nt16.74■□□□□ 0.27
SLM3Q12093 YLR281CYLR281C 468 nt16.72■□□□□ 0.27
SLM3Q12093 MOT3YMR070W 1473 nt16.62■□□□□ 0.25
SLM3Q12093 WHI5YOR083W 888 nt16.61■□□□□ 0.25
SLM3Q12093 LSM3YLR438C-A 270 nt16.6■□□□□ 0.25
SLM3Q12093 BUD23YCR047C 828 nt16.56■□□□□ 0.24
SLM3Q12093 NAB2YGL122C 1578 nt16.49■□□□□ 0.23
SLM3Q12093 INM2YDR287W 879 nt16.48■□□□□ 0.23
SLM3Q12093 FPR4YLR449W 1179 nt16.46■□□□□ 0.23
SLM3Q12093 YBL100CYBL100C 315 nt16.46■□□□□ 0.23
SLM3Q12093 DAL1YIR027C 1383 nt16.39■□□□□ 0.21
SLM3Q12093 FMP45YDL222C 930 nt16.38■□□□□ 0.21
SLM3Q12093 YPR011CYPR011C 981 nt16.37■□□□□ 0.21
SLM3Q12093 BSC6YOL137W 1494 nt16.36■□□□□ 0.21
SLM3Q12093 TRM9YML014W 840 nt16.35■□□□□ 0.21
SLM3Q12093 FIS1YIL065C 468 nt16.33■□□□□ 0.2
SLM3Q12093 DSK2YMR276W 1122 nt16.3■□□□□ 0.2
SLM3Q12093 YLR236CYLR236C 324 nt16.28■□□□□ 0.2
SLM3Q12093 FUN26YAL022C 1554 nt16.28■□□□□ 0.2
SLM3Q12093 PHO4YFR034C 939 nt16.25■□□□□ 0.19
SLM3Q12093 YCH1YGR203W 447 nt16.19■□□□□ 0.18
SLM3Q12093 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt16.19■□□□□ 0.18
SLM3Q12093 IMP2'YIL154C 1041 nt16.15■□□□□ 0.18
SLM3Q12093 CCT6YDR188W 1641 nt16.12■□□□□ 0.17
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