Protein–RNA interactions for Protein: P27801

PEP3, Vacuolar membrane protein PEP3, yeastyeast

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PEP3P27801 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.81■■□□□ 1.4
PEP3P27801 NSR1YGR159C 1245 nt23.64■■□□□ 1.37
PEP3P27801 NOP1YDL014W 984 nt23.06■■□□□ 1.28
PEP3P27801 YKL036CYKL036C 393 nt21.27■■□□□ 1
PEP3P27801 MDJ1YFL016C 1536 nt21.09■□□□□ 0.97
PEP3P27801 Q0297Q0297 156 nt20.19■□□□□ 0.82
PEP3P27801 SRX1YKL086W 384 nt20.17■□□□□ 0.82
PEP3P27801 YJL027CYJL027C 417 nt19.87■□□□□ 0.77
PEP3P27801 SCS3YGL126W 1143 nt19.36■□□□□ 0.69
PEP3P27801 YCR051WYCR051W 669 nt19.16■□□□□ 0.66
PEP3P27801 DBP2YNL112W 1641 nt18.63■□□□□ 0.57
PEP3P27801 YOL085CYOL085C 342 nt18.43■□□□□ 0.54
PEP3P27801 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.28■□□□□ 0.52
PEP3P27801 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.28■□□□□ 0.52
PEP3P27801 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.28■□□□□ 0.52
PEP3P27801 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.28■□□□□ 0.52
PEP3P27801 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.28■□□□□ 0.52
PEP3P27801 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.28■□□□□ 0.52
PEP3P27801 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.28■□□□□ 0.52
PEP3P27801 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.28■□□□□ 0.52
PEP3P27801 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.28■□□□□ 0.52
PEP3P27801 PKP1YIL042C 1185 nt18.21■□□□□ 0.51
PEP3P27801 CCC1YLR220W 969 nt18.13■□□□□ 0.49
PEP3P27801 RPP1BYDL130W 321 nt18.12■□□□□ 0.49
PEP3P27801 YBR190WYBR190W 312 nt17.94■□□□□ 0.46
PEP3P27801 RTC3YHR087W 336 nt17.58■□□□□ 0.4
PEP3P27801 RVS167YDR388W 1449 nt17.47■□□□□ 0.39
PEP3P27801 SCJ1YMR214W 1134 nt17.44■□□□□ 0.38
PEP3P27801 PET122YER153C 765 nt17.36■□□□□ 0.37
PEP3P27801 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.28■□□□□ 0.36
PEP3P27801 ATS1YAL020C 1002 nt17.28■□□□□ 0.36
PEP3P27801 SCR1SCR1 522 nt17.12■□□□□ 0.33
PEP3P27801 SHR5YOL110W 714 nt16.86■□□□□ 0.29
PEP3P27801 RRN5YLR141W 1092 nt16.84■□□□□ 0.29
PEP3P27801 YDJ1YNL064C 1230 nt16.69■□□□□ 0.26
PEP3P27801 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.5■□□□□ 0.23
PEP3P27801 RSB1YOR049C 1065 nt16.49■□□□□ 0.23
PEP3P27801 DEP1YAL013W 1218 nt16.46■□□□□ 0.23
PEP3P27801 URN1YPR152C 1398 nt16.44■□□□□ 0.22
PEP3P27801 GAR1YHR089C 618 nt16.37■□□□□ 0.21
PEP3P27801 PUT4YOR348C 1884 nt16.35■□□□□ 0.21
PEP3P27801 OPI9YLR338W 858 nt16.19■□□□□ 0.18
PEP3P27801 RPN10YHR200W 807 nt16.15■□□□□ 0.18
PEP3P27801 YNL208WYNL208W 600 nt16.14■□□□□ 0.17
PEP3P27801 SAH1YER043C 1350 nt16.13■□□□□ 0.17
PEP3P27801 ARE1YCR048W 1833 nt16.05■□□□□ 0.16
PEP3P27801 PST2YDR032C 597 nt16.01■□□□□ 0.15
PEP3P27801 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.86■□□□□ 0.13
PEP3P27801 POA1YBR022W 534 nt15.85■□□□□ 0.13
PEP3P27801 TIR1YER011W 765 nt15.81■□□□□ 0.12
PEP3P27801 PUN1YLR414C 792 nt15.71■□□□□ 0.11
PEP3P27801 YJR018WYJR018W 363 nt15.67■□□□□ 0.1
PEP3P27801 SSA1YAL005C 1929 nt15.64■□□□□ 0.09
PEP3P27801 PTC2YER089C 1395 nt15.56■□□□□ 0.08
PEP3P27801 BSC6YOL137W 1494 nt15.51■□□□□ 0.07
PEP3P27801 BUD23YCR047C 828 nt15.5■□□□□ 0.07
PEP3P27801 YJR120WYJR120W 351 nt15.45■□□□□ 0.06
PEP3P27801 SRB2YHR041C 633 nt15.41■□□□□ 0.06
PEP3P27801 SHU1YHL006C 453 nt15.4■□□□□ 0.06
PEP3P27801 YKL097CYKL097C 411 nt15.36■□□□□ 0.05
PEP3P27801 NAB2YGL122C 1578 nt15.33■□□□□ 0.05
PEP3P27801 RPP2BYDR382W 333 nt15.33■□□□□ 0.04
PEP3P27801 SSA3YBL075C 1950 nt15.27■□□□□ 0.04
PEP3P27801 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.2■□□□□ 0.02
PEP3P27801 FIS1YIL065C 468 nt15.15■□□□□ 0.02
PEP3P27801 DAL1YIR027C 1383 nt15.13■□□□□ 0.01
PEP3P27801 WWM1YFL010C 636 nt15.13■□□□□ 0.01
PEP3P27801 FPR4YLR449W 1179 nt15.13■□□□□ 0.01
PEP3P27801 INM2YDR287W 879 nt15.09■□□□□ 0.01
PEP3P27801 BDH2YAL061W 1254 nt15.02■□□□□ -0
PEP3P27801 PHO4YFR034C 939 nt15.01□□□□□ -0.01
PEP3P27801 YGR021WYGR021W 873 nt14.98□□□□□ -0.01
PEP3P27801 YBL100CYBL100C 315 nt14.97□□□□□ -0.01
PEP3P27801 HOM6YJR139C 1080 nt14.95□□□□□ -0.02
PEP3P27801 MNP1YGL068W 585 nt14.92□□□□□ -0.02
PEP3P27801 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.84□□□□□ -0.03
PEP3P27801 FUN26YAL022C 1554 nt14.8□□□□□ -0.04
PEP3P27801 LSM3YLR438C-A 270 nt14.79□□□□□ -0.04
PEP3P27801 YOR139CYOR139C 393 nt14.78□□□□□ -0.04
PEP3P27801 SPT5YML010W 3192 nt14.77□□□□□ -0.05
PEP3P27801 TRM9YML014W 840 nt14.75□□□□□ -0.05
PEP3P27801 RKM5YLR137W 1104 nt14.74□□□□□ -0.05
PEP3P27801 YPS1YLR120C 1710 nt14.72□□□□□ -0.05
PEP3P27801 NPL3YDR432W 1245 nt14.65□□□□□ -0.06
PEP3P27801 YDR095CYDR095C 411 nt14.61□□□□□ -0.07
PEP3P27801 CCT6YDR188W 1641 nt14.59□□□□□ -0.07
PEP3P27801 ALF1YNL148C 765 nt14.59□□□□□ -0.07
PEP3P27801 YOL037CYOL037C 354 nt14.59□□□□□ -0.07
PEP3P27801 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.57□□□□□ -0.08
PEP3P27801 MEP2YNL142W 1500 nt14.54□□□□□ -0.08
PEP3P27801 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.46□□□□□ -0.09
PEP3P27801 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.46□□□□□ -0.09
PEP3P27801 DCW1YKL046C 1350 nt14.35□□□□□ -0.11
PEP3P27801 SIS1YNL007C 1059 nt14.35□□□□□ -0.11
PEP3P27801 RPP2AYOL039W 321 nt14.34□□□□□ -0.11
PEP3P27801 PTP1YDL230W 1008 nt14.3□□□□□ -0.12
PEP3P27801 YLR281CYLR281C 468 nt14.26□□□□□ -0.13
PEP3P27801 SSA4YER103W 1929 nt14.24□□□□□ -0.13
PEP3P27801 WHI5YOR083W 888 nt14.24□□□□□ -0.13
PEP3P27801 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.22□□□□□ -0.13
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