Protein–RNA interactions for Protein: Q03213

HOT1, High-osmolarity-induced transcription protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HOT1Q03213 NSR1YGR159C 1245 nt19.18■□□□□ 0.66
HOT1Q03213 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.53■□□□□ 0.56
HOT1Q03213 MDJ1YFL016C 1536 nt17.94■□□□□ 0.46
HOT1Q03213 NOP1YDL014W 984 nt17.68■□□□□ 0.42
HOT1Q03213 YJL027CYJL027C 417 nt16.33■□□□□ 0.2
HOT1Q03213 SSA3YBL075C 1950 nt16.09■□□□□ 0.17
HOT1Q03213 YKL036CYKL036C 393 nt15.92■□□□□ 0.14
HOT1Q03213 DBP2YNL112W 1641 nt15.65■□□□□ 0.1
HOT1Q03213 SRX1YKL086W 384 nt15.46■□□□□ 0.07
HOT1Q03213 YBR190WYBR190W 312 nt15.45■□□□□ 0.06
HOT1Q03213 Q0297Q0297 156 nt15.34■□□□□ 0.05
HOT1Q03213 RTC3YHR087W 336 nt14.96□□□□□ -0.01
HOT1Q03213 PUT4YOR348C 1884 nt14.84□□□□□ -0.03
HOT1Q03213 YCR051WYCR051W 669 nt14.62□□□□□ -0.07
HOT1Q03213 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.55□□□□□ -0.08
HOT1Q03213 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.55□□□□□ -0.08
HOT1Q03213 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.55□□□□□ -0.08
HOT1Q03213 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.55□□□□□ -0.08
HOT1Q03213 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.55□□□□□ -0.08
HOT1Q03213 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.55□□□□□ -0.08
HOT1Q03213 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.55□□□□□ -0.08
HOT1Q03213 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.55□□□□□ -0.08
HOT1Q03213 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.55□□□□□ -0.08
HOT1Q03213 SPT5YML010W 3192 nt14.39□□□□□ -0.11
HOT1Q03213 ARE1YCR048W 1833 nt14.31□□□□□ -0.12
HOT1Q03213 CCC1YLR220W 969 nt14.31□□□□□ -0.12
HOT1Q03213 SCS3YGL126W 1143 nt14.26□□□□□ -0.13
HOT1Q03213 SCJ1YMR214W 1134 nt14.23□□□□□ -0.13
HOT1Q03213 POA1YBR022W 534 nt14.23□□□□□ -0.13
HOT1Q03213 RVS167YDR388W 1449 nt14.17□□□□□ -0.14
HOT1Q03213 SSA4YER103W 1929 nt14.13□□□□□ -0.15
HOT1Q03213 BSC6YOL137W 1494 nt14.1□□□□□ -0.15
HOT1Q03213 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.03□□□□□ -0.16
HOT1Q03213 SAH1YER043C 1350 nt13.96□□□□□ -0.18
HOT1Q03213 YOL085CYOL085C 342 nt13.8□□□□□ -0.2
HOT1Q03213 BDF1YLR399C 2061 nt13.79□□□□□ -0.2
HOT1Q03213 OPI9YLR338W 858 nt13.78□□□□□ -0.2
HOT1Q03213 URN1YPR152C 1398 nt13.78□□□□□ -0.2
HOT1Q03213 RPP1BYDL130W 321 nt13.76□□□□□ -0.21
HOT1Q03213 PKP1YIL042C 1185 nt13.64□□□□□ -0.23
HOT1Q03213 SHR5YOL110W 714 nt13.6□□□□□ -0.23
HOT1Q03213 BUD23YCR047C 828 nt13.55□□□□□ -0.24
HOT1Q03213 DEP1YAL013W 1218 nt13.55□□□□□ -0.24
HOT1Q03213 TAT1YBR069C 1860 nt13.55□□□□□ -0.24
HOT1Q03213 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.44□□□□□ -0.26
HOT1Q03213 PTC2YER089C 1395 nt13.34□□□□□ -0.27
HOT1Q03213 MEP2YNL142W 1500 nt13.34□□□□□ -0.27
HOT1Q03213 PAC11YDR488C 1602 nt13.29□□□□□ -0.28
HOT1Q03213 PUN1YLR414C 792 nt13.28□□□□□ -0.28
HOT1Q03213 NAB2YGL122C 1578 nt13.26□□□□□ -0.29
HOT1Q03213 PET122YER153C 765 nt13.21□□□□□ -0.29
HOT1Q03213 RPN10YHR200W 807 nt13.21□□□□□ -0.29
HOT1Q03213 DCW1YKL046C 1350 nt13.19□□□□□ -0.3
HOT1Q03213 YNL208WYNL208W 600 nt13.16□□□□□ -0.3
HOT1Q03213 FIS1YIL065C 468 nt13.12□□□□□ -0.31
HOT1Q03213 NVJ2YPR091C 2313 nt13.08□□□□□ -0.32
HOT1Q03213 YJR018WYJR018W 363 nt13.07□□□□□ -0.32
HOT1Q03213 YBR220CYBR220C 1683 nt13.04□□□□□ -0.32
HOT1Q03213 YDJ1YNL064C 1230 nt12.99□□□□□ -0.33
HOT1Q03213 SCR1SCR1 522 nt12.95□□□□□ -0.34
HOT1Q03213 YPS1YLR120C 1710 nt12.95□□□□□ -0.34
HOT1Q03213 YJR120WYJR120W 351 nt12.94□□□□□ -0.34
HOT1Q03213 DAL1YIR027C 1383 nt12.93□□□□□ -0.34
HOT1Q03213 EMI2YDR516C 1503 nt12.89□□□□□ -0.35
HOT1Q03213 PHO4YFR034C 939 nt12.85□□□□□ -0.35
HOT1Q03213 GAR1YHR089C 618 nt12.82□□□□□ -0.36
HOT1Q03213 FPR4YLR449W 1179 nt12.79□□□□□ -0.36
HOT1Q03213 RRN5YLR141W 1092 nt12.78□□□□□ -0.36
HOT1Q03213 SDH1YKL148C 1923 nt12.76□□□□□ -0.37
HOT1Q03213 GUT2YIL155C 1950 nt12.74□□□□□ -0.37
HOT1Q03213 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.73□□□□□ -0.37
HOT1Q03213 PCH2YBR186W 1695 nt12.73□□□□□ -0.37
HOT1Q03213 YDL221WYDL221W 552 nt12.72□□□□□ -0.37
HOT1Q03213 YDR095CYDR095C 411 nt12.72□□□□□ -0.37
HOT1Q03213 CAC2YML102W 1407 nt12.7□□□□□ -0.38
HOT1Q03213 PIB2YGL023C 1908 nt12.69□□□□□ -0.38
HOT1Q03213 YMR090WYMR090W 684 nt12.67□□□□□ -0.38
HOT1Q03213 INM2YDR287W 879 nt12.66□□□□□ -0.38
HOT1Q03213 ATS1YAL020C 1002 nt12.66□□□□□ -0.38
HOT1Q03213 PTP1YDL230W 1008 nt12.65□□□□□ -0.38
HOT1Q03213 Q0182Q0182 405 nt12.65□□□□□ -0.38
HOT1Q03213 SSA1YAL005C 1929 nt12.59□□□□□ -0.39
HOT1Q03213 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.52□□□□□ -0.41
HOT1Q03213 SEC11YIR022W 504 nt12.52□□□□□ -0.41
HOT1Q03213 SCC4YER147C 1875 nt12.52□□□□□ -0.41
HOT1Q03213 IRC15YPL017C 1500 nt12.52□□□□□ -0.41
HOT1Q03213 TIR1YER011W 765 nt12.45□□□□□ -0.42
HOT1Q03213 YBL100CYBL100C 315 nt12.45□□□□□ -0.42
HOT1Q03213 RPP2BYDR382W 333 nt12.43□□□□□ -0.42
HOT1Q03213 RPP2AYOL039W 321 nt12.42□□□□□ -0.42
HOT1Q03213 GIS3YLR094C 1509 nt12.41□□□□□ -0.42
HOT1Q03213 SRB2YHR041C 633 nt12.39□□□□□ -0.43
HOT1Q03213 RSB1YOR049C 1065 nt12.39□□□□□ -0.43
HOT1Q03213 YHL050CYHL050C 2094 nt12.38□□□□□ -0.43
HOT1Q03213 YSC84YHR016C 1407 nt12.37□□□□□ -0.43
HOT1Q03213 FPS1YLL043W 2010 nt12.37□□□□□ -0.43
HOT1Q03213 RTF1YGL244W 1677 nt12.31□□□□□ -0.44
HOT1Q03213 FUN26YAL022C 1554 nt12.3□□□□□ -0.44
HOT1Q03213 PTK1YKL198C 1989 nt12.28□□□□□ -0.44
HOT1Q03213 UME6YDR207C 2511 nt12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.9 ms