Protein–RNA interactions for Protein: P28272

URA1, Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate), yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
URA1P28272 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.97■■□□□ 1.27
URA1P28272 NSR1YGR159C 1245 nt22.85■■□□□ 1.25
URA1P28272 NOP1YDL014W 984 nt22.14■■□□□ 1.13
URA1P28272 MDJ1YFL016C 1536 nt20.56■□□□□ 0.88
URA1P28272 YKL036CYKL036C 393 nt20.37■□□□□ 0.85
URA1P28272 SRX1YKL086W 384 nt19.41■□□□□ 0.7
URA1P28272 Q0297Q0297 156 nt19.39■□□□□ 0.69
URA1P28272 YJL027CYJL027C 417 nt19.01■□□□□ 0.63
URA1P28272 SCS3YGL126W 1143 nt18.53■□□□□ 0.56
URA1P28272 YCR051WYCR051W 669 nt18.44■□□□□ 0.54
URA1P28272 DBP2YNL112W 1641 nt18.13■□□□□ 0.49
URA1P28272 YOL085CYOL085C 342 nt17.69■□□□□ 0.42
URA1P28272 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.67■□□□□ 0.42
URA1P28272 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.67■□□□□ 0.42
URA1P28272 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.67■□□□□ 0.42
URA1P28272 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.67■□□□□ 0.42
URA1P28272 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.67■□□□□ 0.42
URA1P28272 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.67■□□□□ 0.42
URA1P28272 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.67■□□□□ 0.42
URA1P28272 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.67■□□□□ 0.42
URA1P28272 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.67■□□□□ 0.42
URA1P28272 CCC1YLR220W 969 nt17.52■□□□□ 0.4
URA1P28272 PKP1YIL042C 1185 nt17.51■□□□□ 0.39
URA1P28272 YBR190WYBR190W 312 nt17.45■□□□□ 0.38
URA1P28272 RPP1BYDL130W 321 nt17.41■□□□□ 0.38
URA1P28272 RTC3YHR087W 336 nt17.09■□□□□ 0.33
URA1P28272 SCJ1YMR214W 1134 nt16.94■□□□□ 0.3
URA1P28272 RVS167YDR388W 1449 nt16.87■□□□□ 0.29
URA1P28272 PET122YER153C 765 nt16.72■□□□□ 0.27
URA1P28272 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.67■□□□□ 0.26
URA1P28272 ATS1YAL020C 1002 nt16.5■□□□□ 0.23
URA1P28272 SCR1SCR1 522 nt16.39■□□□□ 0.21
URA1P28272 SHR5YOL110W 714 nt16.3■□□□□ 0.2
URA1P28272 RRN5YLR141W 1092 nt16.2■□□□□ 0.18
URA1P28272 YDJ1YNL064C 1230 nt16.07■□□□□ 0.16
URA1P28272 PUT4YOR348C 1884 nt16.03■□□□□ 0.16
URA1P28272 DEP1YAL013W 1218 nt15.99■□□□□ 0.15
URA1P28272 URN1YPR152C 1398 nt15.97■□□□□ 0.15
URA1P28272 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.88■□□□□ 0.13
URA1P28272 GAR1YHR089C 618 nt15.81■□□□□ 0.12
URA1P28272 RSB1YOR049C 1065 nt15.81■□□□□ 0.12
URA1P28272 OPI9YLR338W 858 nt15.74■□□□□ 0.11
URA1P28272 SAH1YER043C 1350 nt15.74■□□□□ 0.11
URA1P28272 ARE1YCR048W 1833 nt15.71■□□□□ 0.11
URA1P28272 YNL208WYNL208W 600 nt15.61■□□□□ 0.09
URA1P28272 RPN10YHR200W 807 nt15.6■□□□□ 0.09
URA1P28272 POA1YBR022W 534 nt15.52■□□□□ 0.08
URA1P28272 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.51■□□□□ 0.07
URA1P28272 PST2YDR032C 597 nt15.31■□□□□ 0.04
URA1P28272 TIR1YER011W 765 nt15.26■□□□□ 0.03
URA1P28272 PUN1YLR414C 792 nt15.25■□□□□ 0.03
URA1P28272 SSA3YBL075C 1950 nt15.24■□□□□ 0.03
URA1P28272 BSC6YOL137W 1494 nt15.21■□□□□ 0.03
URA1P28272 YJR018WYJR018W 363 nt15.2■□□□□ 0.02
URA1P28272 SSA1YAL005C 1929 nt15.16■□□□□ 0.02
URA1P28272 PTC2YER089C 1395 nt15.15■□□□□ 0.02
URA1P28272 BUD23YCR047C 828 nt15.13■□□□□ 0.01
URA1P28272 YJR120WYJR120W 351 nt15.06■□□□□ 0
URA1P28272 SRB2YHR041C 633 nt14.99□□□□□ -0.01
URA1P28272 NAB2YGL122C 1578 nt14.92□□□□□ -0.02
URA1P28272 RPP2BYDR382W 333 nt14.8□□□□□ -0.04
URA1P28272 FIS1YIL065C 468 nt14.79□□□□□ -0.04
URA1P28272 SHU1YHL006C 453 nt14.77□□□□□ -0.05
URA1P28272 FPR4YLR449W 1179 nt14.72□□□□□ -0.05
URA1P28272 DAL1YIR027C 1383 nt14.72□□□□□ -0.05
URA1P28272 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.63□□□□□ -0.07
URA1P28272 INM2YDR287W 879 nt14.62□□□□□ -0.07
URA1P28272 WWM1YFL010C 636 nt14.62□□□□□ -0.07
URA1P28272 PHO4YFR034C 939 nt14.61□□□□□ -0.07
URA1P28272 YKL097CYKL097C 411 nt14.61□□□□□ -0.07
URA1P28272 SPT5YML010W 3192 nt14.6□□□□□ -0.07
URA1P28272 BDH2YAL061W 1254 nt14.53□□□□□ -0.08
URA1P28272 YBL100CYBL100C 315 nt14.53□□□□□ -0.08
URA1P28272 HOM6YJR139C 1080 nt14.4□□□□□ -0.1
URA1P28272 MNP1YGL068W 585 nt14.38□□□□□ -0.11
URA1P28272 YGR021WYGR021W 873 nt14.37□□□□□ -0.11
URA1P28272 YPS1YLR120C 1710 nt14.36□□□□□ -0.11
URA1P28272 FUN26YAL022C 1554 nt14.35□□□□□ -0.11
URA1P28272 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.29□□□□□ -0.12
URA1P28272 LSM3YLR438C-A 270 nt14.27□□□□□ -0.13
URA1P28272 MEP2YNL142W 1500 nt14.25□□□□□ -0.13
URA1P28272 YDR095CYDR095C 411 nt14.25□□□□□ -0.13
URA1P28272 TRM9YML014W 840 nt14.25□□□□□ -0.13
URA1P28272 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.2□□□□□ -0.14
URA1P28272 RKM5YLR137W 1104 nt14.18□□□□□ -0.14
URA1P28272 CCT6YDR188W 1641 nt14.13□□□□□ -0.15
URA1P28272 ALF1YNL148C 765 nt14.13□□□□□ -0.15
URA1P28272 YOR139CYOR139C 393 nt14.13□□□□□ -0.15
URA1P28272 DCW1YKL046C 1350 nt14.12□□□□□ -0.15
URA1P28272 SSA4YER103W 1929 nt14.11□□□□□ -0.15
URA1P28272 PTP1YDL230W 1008 nt14□□□□□ -0.17
URA1P28272 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.97□□□□□ -0.17
URA1P28272 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.97□□□□□ -0.17
URA1P28272 RPP2AYOL039W 321 nt13.97□□□□□ -0.17
URA1P28272 NPL3YDR432W 1245 nt13.96□□□□□ -0.17
URA1P28272 YOL037CYOL037C 354 nt13.96□□□□□ -0.17
URA1P28272 SIS1YNL007C 1059 nt13.95□□□□□ -0.18
URA1P28272 CAC2YML102W 1407 nt13.92□□□□□ -0.18
URA1P28272 EMI2YDR516C 1503 nt13.88□□□□□ -0.19
URA1P28272 ART5YGR068C 1761 nt13.81□□□□□ -0.2
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