RNA–Protein interactions for RNA: YDR261C-D

YDR261C-D, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeast

Gene YDR261C-D, Length 4,815 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YDR261C-D	YDR261C-D	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	PUP2	P32379	260 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	EMP65	P40085	556 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	CIK1	Q01649	594 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	ZIP1	P31111	875 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	NTG1	P31378	399 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	PEX18	P38855	283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	PXA1	P41909	870 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	ENT3	P47160	408 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	VID30	P53076	958 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	SGD1	Q06132	899 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	ITT1	Q04638	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	YPL277C	Q08989	487 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	ATG3	P40344	310 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	MPS2	P53159	387 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	GGA1	Q06336	557 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	MCM21	Q06675	368 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	LHS1	P36016	881 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	POP7	P38291	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	MAD1	P40957	749 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	YML020W	Q03722	664 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	MRPL8	P22353	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
YDR261C-D	YDR261C-D	YLR125W	Q12138	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	PIM1	P36775	1133 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	ERV41	Q04651	352 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	ATP14	Q12349	124 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	IRR1	P40541	1150 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	RKM4	Q12504	494 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	YML002W	P0CF17	737 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	SNT1	P25357	1226 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	PZF1	P39933	429 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	PEA2	P40091	420 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	YNR061C	P53747	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	YLR455W	Q06188	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	CLN2	P20438	545 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	XRS2	P33301	854 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	SUM1	P46676	1062 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	VPS53	P47061	822 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	RMR1	P53060	241 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	RPN4	Q03465	531 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	NDL1	Q06568	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	LAG2	Q92325	660 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	SWI1	P09547	1314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	AFR1	P33304	620 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	UIP5	P36137	443 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	RTS1	P38903	757 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	VPS45	P38932	577 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	IRC4	Q03036	179 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	HEH2	Q03281	663 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	SIR1	P21691	654 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	MSH2	P25847	964 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	PTH2	P34222	208 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	EAF1	Q06337	982 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	IRC3	Q06683	689 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	RSM22	P36056	628 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	STU2	P46675	888 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	TPO2	P53283	614 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	YMR018W	Q04364	514 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	RAD34	Q06665	692 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	SYO1	Q07395	620 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YDR261C-D	YDR261C-D	SIR3	P06701	978 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	TPD3	P31383	635 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	HSM3	P38348	480 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	SKS1	Q12505	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	CYC8	P14922	966 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	RPC53	P25441	422 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	YKL063C	P35725	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	YSW1	P38280	609 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	UFE1	P41834	346 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	URB2	P47108	1174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	SLX4	Q12098	748 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	OSH2	Q12451	1283 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YDR261C-D	YDR261C-D	BUD14	P27637	709 aa		4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.7 ms