Protein–RNA interactions for Protein: P36016

LHS1, Heat shock protein 70 homolog LHS1, yeastyeast

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LHS1P36016 NSR1YGR159C 1245 nt18.77■□□□□ 0.6
LHS1P36016 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.4■□□□□ 0.54
LHS1P36016 NOP1YDL014W 984 nt17.82■□□□□ 0.44
LHS1P36016 MDJ1YFL016C 1536 nt17.2■□□□□ 0.34
LHS1P36016 YKL036CYKL036C 393 nt16.72■□□□□ 0.27
LHS1P36016 YJL027CYJL027C 417 nt15.84■□□□□ 0.13
LHS1P36016 Q0297Q0297 156 nt15.7■□□□□ 0.1
LHS1P36016 SSA3YBL075C 1950 nt15.66■□□□□ 0.1
LHS1P36016 SRX1YKL086W 384 nt15.55■□□□□ 0.08
LHS1P36016 SCS3YGL126W 1143 nt15.35■□□□□ 0.05
LHS1P36016 DBP2YNL112W 1641 nt14.97□□□□□ -0.01
LHS1P36016 YBR190WYBR190W 312 nt14.85□□□□□ -0.03
LHS1P36016 YCR051WYCR051W 669 nt14.72□□□□□ -0.05
LHS1P36016 RTC3YHR087W 336 nt14.48□□□□□ -0.09
LHS1P36016 YOL085CYOL085C 342 nt14.44□□□□□ -0.1
LHS1P36016 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.26□□□□□ -0.13
LHS1P36016 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.26□□□□□ -0.13
LHS1P36016 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.26□□□□□ -0.13
LHS1P36016 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.26□□□□□ -0.13
LHS1P36016 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.26□□□□□ -0.13
LHS1P36016 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.26□□□□□ -0.13
LHS1P36016 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.26□□□□□ -0.13
LHS1P36016 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.26□□□□□ -0.13
LHS1P36016 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.26□□□□□ -0.13
LHS1P36016 SCJ1YMR214W 1134 nt14.16□□□□□ -0.14
LHS1P36016 PKP1YIL042C 1185 nt14.08□□□□□ -0.16
LHS1P36016 CCC1YLR220W 969 nt14.08□□□□□ -0.16
LHS1P36016 RPP1BYDL130W 321 nt14.06□□□□□ -0.16
LHS1P36016 PUT4YOR348C 1884 nt14.04□□□□□ -0.16
LHS1P36016 RVS167YDR388W 1449 nt14□□□□□ -0.17
LHS1P36016 ATS1YAL020C 1002 nt13.83□□□□□ -0.2
LHS1P36016 SSA4YER103W 1929 nt13.61□□□□□ -0.23
LHS1P36016 SPT5YML010W 3192 nt13.58□□□□□ -0.24
LHS1P36016 POA1YBR022W 534 nt13.51□□□□□ -0.25
LHS1P36016 ARE1YCR048W 1833 nt13.49□□□□□ -0.25
LHS1P36016 BSC6YOL137W 1494 nt13.42□□□□□ -0.26
LHS1P36016 SCR1SCR1 522 nt13.35□□□□□ -0.27
LHS1P36016 SHR5YOL110W 714 nt13.35□□□□□ -0.27
LHS1P36016 PET122YER153C 765 nt13.34□□□□□ -0.27
LHS1P36016 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.34□□□□□ -0.27
LHS1P36016 SAH1YER043C 1350 nt13.32□□□□□ -0.28
LHS1P36016 URN1YPR152C 1398 nt13.32□□□□□ -0.28
LHS1P36016 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.32□□□□□ -0.28
LHS1P36016 OPI9YLR338W 858 nt13.27□□□□□ -0.29
LHS1P36016 BDF1YLR399C 2061 nt13.2□□□□□ -0.3
LHS1P36016 DEP1YAL013W 1218 nt13.13□□□□□ -0.31
LHS1P36016 PAC11YDR488C 1602 nt13.1□□□□□ -0.31
LHS1P36016 RPN10YHR200W 807 nt13.04□□□□□ -0.32
LHS1P36016 TAT1YBR069C 1860 nt13.01□□□□□ -0.33
LHS1P36016 RRN5YLR141W 1092 nt12.99□□□□□ -0.33
LHS1P36016 BUD23YCR047C 828 nt12.97□□□□□ -0.33
LHS1P36016 YDJ1YNL064C 1230 nt12.91□□□□□ -0.34
LHS1P36016 PUN1YLR414C 792 nt12.9□□□□□ -0.34
LHS1P36016 YNL208WYNL208W 600 nt12.9□□□□□ -0.34
LHS1P36016 PTC2YER089C 1395 nt12.81□□□□□ -0.36
LHS1P36016 RSB1YOR049C 1065 nt12.81□□□□□ -0.36
LHS1P36016 NVJ2YPR091C 2313 nt12.8□□□□□ -0.36
LHS1P36016 PST2YDR032C 597 nt12.77□□□□□ -0.37
LHS1P36016 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.75□□□□□ -0.37
LHS1P36016 NAB2YGL122C 1578 nt12.75□□□□□ -0.37
LHS1P36016 MEP2YNL142W 1500 nt12.7□□□□□ -0.38
LHS1P36016 YJR018WYJR018W 363 nt12.68□□□□□ -0.38
LHS1P36016 GAR1YHR089C 618 nt12.66□□□□□ -0.38
LHS1P36016 FIS1YIL065C 468 nt12.51□□□□□ -0.41
LHS1P36016 DCW1YKL046C 1350 nt12.49□□□□□ -0.41
LHS1P36016 DAL1YIR027C 1383 nt12.47□□□□□ -0.41
LHS1P36016 YKL097CYKL097C 411 nt12.43□□□□□ -0.42
LHS1P36016 YBR220CYBR220C 1683 nt12.42□□□□□ -0.42
LHS1P36016 FPR4YLR449W 1179 nt12.4□□□□□ -0.42
LHS1P36016 PHO4YFR034C 939 nt12.35□□□□□ -0.43
LHS1P36016 YJR120WYJR120W 351 nt12.34□□□□□ -0.43
LHS1P36016 FPS1YLL043W 2010 nt12.32□□□□□ -0.44
LHS1P36016 INM2YDR287W 879 nt12.32□□□□□ -0.44
LHS1P36016 YPS1YLR120C 1710 nt12.31□□□□□ -0.44
LHS1P36016 RPP2BYDR382W 333 nt12.29□□□□□ -0.44
LHS1P36016 EMI2YDR516C 1503 nt12.28□□□□□ -0.44
LHS1P36016 YMR090WYMR090W 684 nt12.27□□□□□ -0.45
LHS1P36016 TIR1YER011W 765 nt12.26□□□□□ -0.45
LHS1P36016 SSA1YAL005C 1929 nt12.23□□□□□ -0.45
LHS1P36016 PCH2YBR186W 1695 nt12.22□□□□□ -0.45
LHS1P36016 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.22□□□□□ -0.45
LHS1P36016 GUT2YIL155C 1950 nt12.2□□□□□ -0.46
LHS1P36016 SDH1YKL148C 1923 nt12.16□□□□□ -0.46
LHS1P36016 YDR095CYDR095C 411 nt12.15□□□□□ -0.46
LHS1P36016 SHU1YHL006C 453 nt12.12□□□□□ -0.47
LHS1P36016 YDL221WYDL221W 552 nt12.1□□□□□ -0.47
LHS1P36016 SEC11YIR022W 504 nt12.1□□□□□ -0.47
LHS1P36016 YBL100CYBL100C 315 nt12.1□□□□□ -0.47
LHS1P36016 PIB2YGL023C 1908 nt11.99□□□□□ -0.49
LHS1P36016 FUN26YAL022C 1554 nt11.93□□□□□ -0.5
LHS1P36016 CAC2YML102W 1407 nt11.93□□□□□ -0.5
LHS1P36016 SCC4YER147C 1875 nt11.92□□□□□ -0.5
LHS1P36016 BDH2YAL061W 1254 nt11.92□□□□□ -0.5
LHS1P36016 RPP2AYOL039W 321 nt11.92□□□□□ -0.5
LHS1P36016 PTP1YDL230W 1008 nt11.91□□□□□ -0.5
LHS1P36016 ALF1YNL148C 765 nt11.9□□□□□ -0.5
LHS1P36016 UME6YDR207C 2511 nt11.88□□□□□ -0.51
LHS1P36016 SRB2YHR041C 633 nt11.88□□□□□ -0.51
LHS1P36016 YOR139CYOR139C 393 nt11.85□□□□□ -0.51
LHS1P36016 RTF1YGL244W 1677 nt11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.8 ms