Protein–RNA interactions for Protein: Q05789

ATG38, Autophagy-related protein 38, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG38Q05789 NSR1YGR159C 1245 nt19.22■□□□□ 0.67
ATG38Q05789 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.12■□□□□ 0.65
ATG38Q05789 NOP1YDL014W 984 nt18.61■□□□□ 0.57
ATG38Q05789 MDJ1YFL016C 1536 nt17.18■□□□□ 0.34
ATG38Q05789 YKL036CYKL036C 393 nt16.85■□□□□ 0.29
ATG38Q05789 SRX1YKL086W 384 nt16.14■□□□□ 0.17
ATG38Q05789 Q0297Q0297 156 nt16.07■□□□□ 0.16
ATG38Q05789 YJL027CYJL027C 417 nt15.99■□□□□ 0.15
ATG38Q05789 YCR051WYCR051W 669 nt15.33■□□□□ 0.04
ATG38Q05789 SCS3YGL126W 1143 nt15.12■□□□□ 0.01
ATG38Q05789 DBP2YNL112W 1641 nt15.01□□□□□ -0.01
ATG38Q05789 YBR190WYBR190W 312 nt14.81□□□□□ -0.04
ATG38Q05789 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.7□□□□□ -0.06
ATG38Q05789 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.7□□□□□ -0.06
ATG38Q05789 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.7□□□□□ -0.06
ATG38Q05789 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.7□□□□□ -0.06
ATG38Q05789 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.7□□□□□ -0.06
ATG38Q05789 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.7□□□□□ -0.06
ATG38Q05789 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.7□□□□□ -0.06
ATG38Q05789 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.7□□□□□ -0.06
ATG38Q05789 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.7□□□□□ -0.06
ATG38Q05789 CCC1YLR220W 969 nt14.58□□□□□ -0.08
ATG38Q05789 RTC3YHR087W 336 nt14.53□□□□□ -0.08
ATG38Q05789 YOL085CYOL085C 342 nt14.52□□□□□ -0.09
ATG38Q05789 RPP1BYDL130W 321 nt14.44□□□□□ -0.1
ATG38Q05789 RVS167YDR388W 1449 nt14.38□□□□□ -0.11
ATG38Q05789 PKP1YIL042C 1185 nt14.3□□□□□ -0.12
ATG38Q05789 SCJ1YMR214W 1134 nt13.98□□□□□ -0.17
ATG38Q05789 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.83□□□□□ -0.2
ATG38Q05789 PET122YER153C 765 nt13.76□□□□□ -0.21
ATG38Q05789 SCR1SCR1 522 nt13.74□□□□□ -0.21
ATG38Q05789 SHR5YOL110W 714 nt13.71□□□□□ -0.21
ATG38Q05789 SSA3YBL075C 1950 nt13.69□□□□□ -0.22
ATG38Q05789 PUT4YOR348C 1884 nt13.49□□□□□ -0.25
ATG38Q05789 ATS1YAL020C 1002 nt13.46□□□□□ -0.25
ATG38Q05789 URN1YPR152C 1398 nt13.44□□□□□ -0.26
ATG38Q05789 YDJ1YNL064C 1230 nt13.42□□□□□ -0.26
ATG38Q05789 RPN10YHR200W 807 nt13.36□□□□□ -0.27
ATG38Q05789 RRN5YLR141W 1092 nt13.34□□□□□ -0.27
ATG38Q05789 DEP1YAL013W 1218 nt13.32□□□□□ -0.28
ATG38Q05789 OPI9YLR338W 858 nt13.29□□□□□ -0.28
ATG38Q05789 SAH1YER043C 1350 nt13.21□□□□□ -0.29
ATG38Q05789 YNL208WYNL208W 600 nt13.18□□□□□ -0.3
ATG38Q05789 ARE1YCR048W 1833 nt13.18□□□□□ -0.3
ATG38Q05789 GAR1YHR089C 618 nt13.14□□□□□ -0.31
ATG38Q05789 POA1YBR022W 534 nt13.11□□□□□ -0.31
ATG38Q05789 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.1□□□□□ -0.31
ATG38Q05789 RSB1YOR049C 1065 nt13.09□□□□□ -0.31
ATG38Q05789 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.06□□□□□ -0.32
ATG38Q05789 PUN1YLR414C 792 nt12.99□□□□□ -0.33
ATG38Q05789 BSC6YOL137W 1494 nt12.87□□□□□ -0.35
ATG38Q05789 BUD23YCR047C 828 nt12.83□□□□□ -0.36
ATG38Q05789 YJR018WYJR018W 363 nt12.83□□□□□ -0.36
ATG38Q05789 PTC2YER089C 1395 nt12.78□□□□□ -0.36
ATG38Q05789 TIR1YER011W 765 nt12.71□□□□□ -0.37
ATG38Q05789 NAB2YGL122C 1578 nt12.69□□□□□ -0.38
ATG38Q05789 RPP2BYDR382W 333 nt12.63□□□□□ -0.39
ATG38Q05789 SSA1YAL005C 1929 nt12.58□□□□□ -0.39
ATG38Q05789 DAL1YIR027C 1383 nt12.47□□□□□ -0.41
ATG38Q05789 FPR4YLR449W 1179 nt12.47□□□□□ -0.41
ATG38Q05789 PST2YDR032C 597 nt12.46□□□□□ -0.41
ATG38Q05789 INM2YDR287W 879 nt12.46□□□□□ -0.41
ATG38Q05789 FIS1YIL065C 468 nt12.38□□□□□ -0.43
ATG38Q05789 YJR120WYJR120W 351 nt12.37□□□□□ -0.43
ATG38Q05789 FPS1YLL043W 2010 nt12.33□□□□□ -0.43
ATG38Q05789 PHO4YFR034C 939 nt12.32□□□□□ -0.44
ATG38Q05789 YBL100CYBL100C 315 nt12.26□□□□□ -0.45
ATG38Q05789 BDH2YAL061W 1254 nt12.22□□□□□ -0.45
ATG38Q05789 SPT5YML010W 3192 nt12.2□□□□□ -0.46
ATG38Q05789 YPS1YLR120C 1710 nt12.14□□□□□ -0.47
ATG38Q05789 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.11□□□□□ -0.47
ATG38Q05789 MEP2YNL142W 1500 nt12.11□□□□□ -0.47
ATG38Q05789 NVJ2YPR091C 2313 nt12.1□□□□□ -0.47
ATG38Q05789 SRB2YHR041C 633 nt12.09□□□□□ -0.47
ATG38Q05789 TRM9YML014W 840 nt12.09□□□□□ -0.47
ATG38Q05789 ALF1YNL148C 765 nt12.08□□□□□ -0.48
ATG38Q05789 YGR021WYGR021W 873 nt12.07□□□□□ -0.48
ATG38Q05789 FUN26YAL022C 1554 nt12.07□□□□□ -0.48
ATG38Q05789 WWM1YFL010C 636 nt12.05□□□□□ -0.48
ATG38Q05789 LSM3YLR438C-A 270 nt12.05□□□□□ -0.48
ATG38Q05789 YDR095CYDR095C 411 nt12.04□□□□□ -0.48
ATG38Q05789 SSA4YER103W 1929 nt12.03□□□□□ -0.48
ATG38Q05789 SHU1YHL006C 453 nt12□□□□□ -0.49
ATG38Q05789 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.97□□□□□ -0.49
ATG38Q05789 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.97□□□□□ -0.49
ATG38Q05789 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.97□□□□□ -0.49
ATG38Q05789 YKL097CYKL097C 411 nt11.97□□□□□ -0.49
ATG38Q05789 PAC11YDR488C 1602 nt11.97□□□□□ -0.49
ATG38Q05789 CCT6YDR188W 1641 nt11.9□□□□□ -0.5
ATG38Q05789 Q0182Q0182 405 nt11.9□□□□□ -0.5
ATG38Q05789 YMR090WYMR090W 684 nt11.9□□□□□ -0.5
ATG38Q05789 HOM6YJR139C 1080 nt11.87□□□□□ -0.51
ATG38Q05789 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.87□□□□□ -0.51
ATG38Q05789 RPP2AYOL039W 321 nt11.85□□□□□ -0.51
ATG38Q05789 DCW1YKL046C 1350 nt11.82□□□□□ -0.52
ATG38Q05789 EMI2YDR516C 1503 nt11.77□□□□□ -0.52
ATG38Q05789 SIS1YNL007C 1059 nt11.75□□□□□ -0.53
ATG38Q05789 MNP1YGL068W 585 nt11.74□□□□□ -0.53
ATG38Q05789 RKM5YLR137W 1104 nt11.72□□□□□ -0.53
ATG38Q05789 YDL221WYDL221W 552 nt11.67□□□□□ -0.54
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