Protein–RNA interactions for Protein: P53941

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
IMP4P53941 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.94■□□□□ 0.94
IMP4P53941 NOP1YDL014W 984 nt20.64■□□□□ 0.89
IMP4P53941 NSR1YGR159C 1245 nt20.54■□□□□ 0.88
IMP4P53941 YKL036CYKL036C 393 nt19.35■□□□□ 0.69
IMP4P53941 Q0297Q0297 156 nt18.14■□□□□ 0.49
IMP4P53941 YJL027CYJL027C 417 nt18.13■□□□□ 0.49
IMP4P53941 SRX1YKL086W 384 nt17.97■□□□□ 0.47
IMP4P53941 SCS3YGL126W 1143 nt17.74■□□□□ 0.43
IMP4P53941 MDJ1YFL016C 1536 nt17.72■□□□□ 0.43
IMP4P53941 YCR051WYCR051W 669 nt17.07■□□□□ 0.32
IMP4P53941 YOL085CYOL085C 342 nt16.7■□□□□ 0.26
IMP4P53941 SCJ1YMR214W 1134 nt16.35■□□□□ 0.21
IMP4P53941 PKP1YIL042C 1185 nt16.34■□□□□ 0.21
IMP4P53941 RPP1BYDL130W 321 nt16.27■□□□□ 0.2
IMP4P53941 ATS1YAL020C 1002 nt16.02■□□□□ 0.16
IMP4P53941 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.97■□□□□ 0.15
IMP4P53941 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.97■□□□□ 0.15
IMP4P53941 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.97■□□□□ 0.15
IMP4P53941 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.97■□□□□ 0.15
IMP4P53941 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.97■□□□□ 0.15
IMP4P53941 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.97■□□□□ 0.15
IMP4P53941 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.97■□□□□ 0.15
IMP4P53941 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.97■□□□□ 0.15
IMP4P53941 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.97■□□□□ 0.15
IMP4P53941 DBP2YNL112W 1641 nt15.83■□□□□ 0.12
IMP4P53941 CCC1YLR220W 969 nt15.8■□□□□ 0.12
IMP4P53941 SCR1SCR1 522 nt15.51■□□□□ 0.07
IMP4P53941 PET122YER153C 765 nt15.42■□□□□ 0.06
IMP4P53941 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.25■□□□□ 0.03
IMP4P53941 RVS167YDR388W 1449 nt15.15■□□□□ 0.02
IMP4P53941 YBR190WYBR190W 312 nt15.12■□□□□ 0.01
IMP4P53941 RRN5YLR141W 1092 nt15.06■□□□□ 0
IMP4P53941 RSB1YOR049C 1065 nt14.89□□□□□ -0.03
IMP4P53941 RTC3YHR087W 336 nt14.79□□□□□ -0.04
IMP4P53941 YDJ1YNL064C 1230 nt14.79□□□□□ -0.04
IMP4P53941 PST2YDR032C 597 nt14.76□□□□□ -0.05
IMP4P53941 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.75□□□□□ -0.05
IMP4P53941 SHR5YOL110W 714 nt14.66□□□□□ -0.06
IMP4P53941 SSA3YBL075C 1950 nt14.54□□□□□ -0.08
IMP4P53941 YKL097CYKL097C 411 nt14.42□□□□□ -0.1
IMP4P53941 GAR1YHR089C 618 nt14.35□□□□□ -0.11
IMP4P53941 SHU1YHL006C 453 nt14.02□□□□□ -0.17
IMP4P53941 DEP1YAL013W 1218 nt14.02□□□□□ -0.17
IMP4P53941 RPN10YHR200W 807 nt13.97□□□□□ -0.17
IMP4P53941 URN1YPR152C 1398 nt13.96□□□□□ -0.17
IMP4P53941 YNL208WYNL208W 600 nt13.95□□□□□ -0.18
IMP4P53941 TIR1YER011W 765 nt13.87□□□□□ -0.19
IMP4P53941 OPI9YLR338W 858 nt13.71□□□□□ -0.21
IMP4P53941 YOR139CYOR139C 393 nt13.67□□□□□ -0.22
IMP4P53941 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.65□□□□□ -0.22
IMP4P53941 NPL3YDR432W 1245 nt13.58□□□□□ -0.24
IMP4P53941 SSA1YAL005C 1929 nt13.55□□□□□ -0.24
IMP4P53941 SAH1YER043C 1350 nt13.45□□□□□ -0.26
IMP4P53941 YGR021WYGR021W 873 nt13.44□□□□□ -0.26
IMP4P53941 YJR018WYJR018W 363 nt13.38□□□□□ -0.27
IMP4P53941 PUN1YLR414C 792 nt13.36□□□□□ -0.27
IMP4P53941 PUT4YOR348C 1884 nt13.32□□□□□ -0.28
IMP4P53941 HOM6YJR139C 1080 nt13.32□□□□□ -0.28
IMP4P53941 YOL037CYOL037C 354 nt13.32□□□□□ -0.28
IMP4P53941 RPP2BYDR382W 333 nt13.29□□□□□ -0.28
IMP4P53941 WWM1YFL010C 636 nt13.28□□□□□ -0.28
IMP4P53941 SRB2YHR041C 633 nt13.28□□□□□ -0.28
IMP4P53941 MNP1YGL068W 585 nt13.25□□□□□ -0.29
IMP4P53941 ARE1YCR048W 1833 nt13.2□□□□□ -0.3
IMP4P53941 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.15□□□□□ -0.3
IMP4P53941 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.15□□□□□ -0.3
IMP4P53941 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.15□□□□□ -0.3
IMP4P53941 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.15□□□□□ -0.3
IMP4P53941 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.15□□□□□ -0.3
IMP4P53941 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.14□□□□□ -0.31
IMP4P53941 RKM5YLR137W 1104 nt13.13□□□□□ -0.31
IMP4P53941 YJR120WYJR120W 351 nt13.11□□□□□ -0.31
IMP4P53941 PTC2YER089C 1395 nt13.06□□□□□ -0.32
IMP4P53941 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.04□□□□□ -0.32
IMP4P53941 BDH2YAL061W 1254 nt13.03□□□□□ -0.32
IMP4P53941 LSM3YLR438C-A 270 nt12.98□□□□□ -0.33
IMP4P53941 POA1YBR022W 534 nt12.96□□□□□ -0.33
IMP4P53941 PUS2YGL063W 1113 nt12.94□□□□□ -0.34
IMP4P53941 YLR281CYLR281C 468 nt12.93□□□□□ -0.34
IMP4P53941 INM2YDR287W 879 nt12.91□□□□□ -0.34
IMP4P53941 NAB2YGL122C 1578 nt12.87□□□□□ -0.35
IMP4P53941 WHI5YOR083W 888 nt12.83□□□□□ -0.36
IMP4P53941 BUD23YCR047C 828 nt12.81□□□□□ -0.36
IMP4P53941 MOT3YMR070W 1473 nt12.79□□□□□ -0.36
IMP4P53941 YBL100CYBL100C 315 nt12.78□□□□□ -0.36
IMP4P53941 DAL1YIR027C 1383 nt12.77□□□□□ -0.37
IMP4P53941 TRM9YML014W 840 nt12.76□□□□□ -0.37
IMP4P53941 FPR4YLR449W 1179 nt12.73□□□□□ -0.37
IMP4P53941 BSC6YOL137W 1494 nt12.68□□□□□ -0.38
IMP4P53941 IMP2'YIL154C 1041 nt12.68□□□□□ -0.38
IMP4P53941 FUN26YAL022C 1554 nt12.64□□□□□ -0.39
IMP4P53941 SSA4YER103W 1929 nt12.62□□□□□ -0.39
IMP4P53941 FIS1YIL065C 468 nt12.62□□□□□ -0.39
IMP4P53941 DSK2YMR276W 1122 nt12.62□□□□□ -0.39
IMP4P53941 PHO4YFR034C 939 nt12.6□□□□□ -0.39
IMP4P53941 FMP45YDL222C 930 nt12.58□□□□□ -0.4
IMP4P53941 CCT6YDR188W 1641 nt12.56□□□□□ -0.4
IMP4P53941 MRPL8YJL063C 717 nt12.54□□□□□ -0.4
IMP4P53941 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.54□□□□□ -0.4
IMP4P53941 YCH1YGR203W 447 nt12.53□□□□□ -0.4
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