Protein–RNA interactions for Protein: Q12505

SKS1, Serine/threonine-protein kinase SKS1, yeastyeast

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKS1Q12505 NSR1YGR159C 1245 nt19.1■□□□□ 0.65
SKS1Q12505 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.08■□□□□ 0.64
SKS1Q12505 NOP1YDL014W 984 nt18.53■□□□□ 0.56
SKS1Q12505 YKL036CYKL036C 393 nt17.02■□□□□ 0.32
SKS1Q12505 MDJ1YFL016C 1536 nt17.01■□□□□ 0.31
SKS1Q12505 Q0297Q0297 156 nt16.24■□□□□ 0.19
SKS1Q12505 SRX1YKL086W 384 nt16.23■□□□□ 0.19
SKS1Q12505 YJL027CYJL027C 417 nt15.83■□□□□ 0.12
SKS1Q12505 SCS3YGL126W 1143 nt15.44■□□□□ 0.06
SKS1Q12505 YCR051WYCR051W 669 nt15.32■□□□□ 0.04
SKS1Q12505 DBP2YNL112W 1641 nt15.07■□□□□ 0
SKS1Q12505 YOL085CYOL085C 342 nt14.76□□□□□ -0.05
SKS1Q12505 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.74□□□□□ -0.05
SKS1Q12505 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.74□□□□□ -0.05
SKS1Q12505 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.74□□□□□ -0.05
SKS1Q12505 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.74□□□□□ -0.05
SKS1Q12505 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.74□□□□□ -0.05
SKS1Q12505 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.74□□□□□ -0.05
SKS1Q12505 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.74□□□□□ -0.05
SKS1Q12505 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.74□□□□□ -0.05
SKS1Q12505 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.74□□□□□ -0.05
SKS1Q12505 YBR190WYBR190W 312 nt14.57□□□□□ -0.08
SKS1Q12505 RPP1BYDL130W 321 nt14.55□□□□□ -0.08
SKS1Q12505 PKP1YIL042C 1185 nt14.5□□□□□ -0.09
SKS1Q12505 CCC1YLR220W 969 nt14.5□□□□□ -0.09
SKS1Q12505 RTC3YHR087W 336 nt14.16□□□□□ -0.14
SKS1Q12505 RVS167YDR388W 1449 nt14.07□□□□□ -0.16
SKS1Q12505 SCJ1YMR214W 1134 nt14.04□□□□□ -0.16
SKS1Q12505 PET122YER153C 765 nt13.9□□□□□ -0.18
SKS1Q12505 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.89□□□□□ -0.19
SKS1Q12505 ATS1YAL020C 1002 nt13.78□□□□□ -0.2
SKS1Q12505 SCR1SCR1 522 nt13.69□□□□□ -0.22
SKS1Q12505 SHR5YOL110W 714 nt13.61□□□□□ -0.23
SKS1Q12505 RRN5YLR141W 1092 nt13.49□□□□□ -0.25
SKS1Q12505 YDJ1YNL064C 1230 nt13.47□□□□□ -0.25
SKS1Q12505 PUT4YOR348C 1884 nt13.31□□□□□ -0.28
SKS1Q12505 SSA3YBL075C 1950 nt13.29□□□□□ -0.28
SKS1Q12505 URN1YPR152C 1398 nt13.26□□□□□ -0.29
SKS1Q12505 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.23□□□□□ -0.29
SKS1Q12505 DEP1YAL013W 1218 nt13.2□□□□□ -0.3
SKS1Q12505 RSB1YOR049C 1065 nt13.15□□□□□ -0.3
SKS1Q12505 OPI9YLR338W 858 nt13.14□□□□□ -0.31
SKS1Q12505 GAR1YHR089C 618 nt13.12□□□□□ -0.31
SKS1Q12505 RPN10YHR200W 807 nt13.04□□□□□ -0.32
SKS1Q12505 SAH1YER043C 1350 nt13.04□□□□□ -0.32
SKS1Q12505 ARE1YCR048W 1833 nt13.03□□□□□ -0.32
SKS1Q12505 YNL208WYNL208W 600 nt13.02□□□□□ -0.33
SKS1Q12505 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.84□□□□□ -0.35
SKS1Q12505 POA1YBR022W 534 nt12.84□□□□□ -0.35
SKS1Q12505 PST2YDR032C 597 nt12.81□□□□□ -0.36
SKS1Q12505 PUN1YLR414C 792 nt12.73□□□□□ -0.37
SKS1Q12505 TIR1YER011W 765 nt12.71□□□□□ -0.37
SKS1Q12505 YJR018WYJR018W 363 nt12.66□□□□□ -0.38
SKS1Q12505 BSC6YOL137W 1494 nt12.61□□□□□ -0.39
SKS1Q12505 Q0182Q0182 405 nt12.6□□□□□ -0.39
SKS1Q12505 SSA1YAL005C 1929 nt12.58□□□□□ -0.39
SKS1Q12505 PTC2YER089C 1395 nt12.56□□□□□ -0.4
SKS1Q12505 YJR120WYJR120W 351 nt12.51□□□□□ -0.41
SKS1Q12505 BUD23YCR047C 828 nt12.5□□□□□ -0.41
SKS1Q12505 NAB2YGL122C 1578 nt12.43□□□□□ -0.42
SKS1Q12505 SRB2YHR041C 633 nt12.38□□□□□ -0.43
SKS1Q12505 RPP2BYDR382W 333 nt12.35□□□□□ -0.43
SKS1Q12505 SHU1YHL006C 453 nt12.3□□□□□ -0.44
SKS1Q12505 FIS1YIL065C 468 nt12.28□□□□□ -0.44
SKS1Q12505 DAL1YIR027C 1383 nt12.26□□□□□ -0.45
SKS1Q12505 INM2YDR287W 879 nt12.23□□□□□ -0.45
SKS1Q12505 YKL097CYKL097C 411 nt12.2□□□□□ -0.46
SKS1Q12505 FPR4YLR449W 1179 nt12.15□□□□□ -0.46
SKS1Q12505 SPT5YML010W 3192 nt12.14□□□□□ -0.47
SKS1Q12505 PHO4YFR034C 939 nt12.14□□□□□ -0.47
SKS1Q12505 WWM1YFL010C 636 nt12.13□□□□□ -0.47
SKS1Q12505 BDH2YAL061W 1254 nt12.13□□□□□ -0.47
SKS1Q12505 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.1□□□□□ -0.47
SKS1Q12505 YBL100CYBL100C 315 nt12.08□□□□□ -0.48
SKS1Q12505 YGR021WYGR021W 873 nt12.04□□□□□ -0.48
SKS1Q12505 HOM6YJR139C 1080 nt12.01□□□□□ -0.49
SKS1Q12505 LSM3YLR438C-A 270 nt11.97□□□□□ -0.49
SKS1Q12505 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.96□□□□□ -0.49
SKS1Q12505 YPS1YLR120C 1710 nt11.95□□□□□ -0.5
SKS1Q12505 FUN26YAL022C 1554 nt11.94□□□□□ -0.5
SKS1Q12505 MNP1YGL068W 585 nt11.91□□□□□ -0.5
SKS1Q12505 YDR095CYDR095C 411 nt11.88□□□□□ -0.51
SKS1Q12505 TRM9YML014W 840 nt11.88□□□□□ -0.51
SKS1Q12505 MEP2YNL142W 1500 nt11.86□□□□□ -0.51
SKS1Q12505 RKM5YLR137W 1104 nt11.82□□□□□ -0.52
SKS1Q12505 CCT6YDR188W 1641 nt11.81□□□□□ -0.52
SKS1Q12505 MOT3YMR070W 1473 nt11.8□□□□□ -0.52
SKS1Q12505 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.78□□□□□ -0.52
SKS1Q12505 YOR139CYOR139C 393 nt11.78□□□□□ -0.52
SKS1Q12505 ALF1YNL148C 765 nt11.75□□□□□ -0.53
SKS1Q12505 SSA4YER103W 1929 nt11.69□□□□□ -0.54
SKS1Q12505 YOL037CYOL037C 354 nt11.69□□□□□ -0.54
SKS1Q12505 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.68□□□□□ -0.54
SKS1Q12505 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.68□□□□□ -0.54
SKS1Q12505 DCW1YKL046C 1350 nt11.66□□□□□ -0.54
SKS1Q12505 SIS1YNL007C 1059 nt11.65□□□□□ -0.54
SKS1Q12505 PTP1YDL230W 1008 nt11.64□□□□□ -0.55
SKS1Q12505 NPL3YDR432W 1245 nt11.64□□□□□ -0.55
SKS1Q12505 RPP2AYOL039W 321 nt11.64□□□□□ -0.55
SKS1Q12505 CAC2YML102W 1407 nt11.53□□□□□ -0.56
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