Protein–RNA interactions for Protein: Q06683

IRC3, Putative ATP-dependent helicase IRC3, yeastyeast

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Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
IRC3Q06683 YML009W-BYML009W-B 477 nt25.2■■□□□ 1.62
IRC3Q06683 NOP1YDL014W 984 nt24.77■■□□□ 1.56
IRC3Q06683 NSR1YGR159C 1245 nt24.59■■□□□ 1.53
IRC3Q06683 YKL036CYKL036C 393 nt23.36■■□□□ 1.33
IRC3Q06683 YJL027CYJL027C 417 nt21.89■■□□□ 1.09
IRC3Q06683 Q0297Q0297 156 nt21.85■■□□□ 1.09
IRC3Q06683 SRX1YKL086W 384 nt21.63■■□□□ 1.05
IRC3Q06683 SCS3YGL126W 1143 nt21.51■■□□□ 1.03
IRC3Q06683 MDJ1YFL016C 1536 nt21.25■□□□□ 0.99
IRC3Q06683 YCR051WYCR051W 669 nt20.54■□□□□ 0.88
IRC3Q06683 YOL085CYOL085C 342 nt20.2■□□□□ 0.82
IRC3Q06683 SCJ1YMR214W 1134 nt19.81■□□□□ 0.76
IRC3Q06683 PKP1YIL042C 1185 nt19.79■□□□□ 0.76
IRC3Q06683 RPP1BYDL130W 321 nt19.6■□□□□ 0.73
IRC3Q06683 ATS1YAL020C 1002 nt19.41■□□□□ 0.7
IRC3Q06683 TRN1tP(UGG)A 72 nt19.22■□□□□ 0.67
IRC3Q06683 SUF9tP(UGG)F 72 nt19.22■□□□□ 0.67
IRC3Q06683 SUF8tP(UGG)H 72 nt19.22■□□□□ 0.67
IRC3Q06683 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt19.22■□□□□ 0.67
IRC3Q06683 SUF7tP(UGG)M 72 nt19.22■□□□□ 0.67
IRC3Q06683 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt19.22■□□□□ 0.67
IRC3Q06683 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt19.22■□□□□ 0.67
IRC3Q06683 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt19.22■□□□□ 0.67
IRC3Q06683 SUF11tP(UGG)O2 72 nt19.22■□□□□ 0.67
IRC3Q06683 DBP2YNL112W 1641 nt19.03■□□□□ 0.64
IRC3Q06683 CCC1YLR220W 969 nt19■□□□□ 0.63
IRC3Q06683 PET122YER153C 765 nt18.63■□□□□ 0.57
IRC3Q06683 SCR1SCR1 522 nt18.63■□□□□ 0.57
IRC3Q06683 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt18.36■□□□□ 0.53
IRC3Q06683 RRN5YLR141W 1092 nt18.16■□□□□ 0.5
IRC3Q06683 RVS167YDR388W 1449 nt18.08■□□□□ 0.49
IRC3Q06683 YBR190WYBR190W 312 nt18.02■□□□□ 0.48
IRC3Q06683 RTC3YHR087W 336 nt17.97■□□□□ 0.47
IRC3Q06683 RSB1YOR049C 1065 nt17.96■□□□□ 0.47
IRC3Q06683 PST2YDR032C 597 nt17.88■□□□□ 0.45
IRC3Q06683 YER088W-BYER088W-B 147 nt17.81■□□□□ 0.44
IRC3Q06683 YDJ1YNL064C 1230 nt17.78■□□□□ 0.44
IRC3Q06683 SHR5YOL110W 714 nt17.57■□□□□ 0.4
IRC3Q06683 YKL097CYKL097C 411 nt17.47■□□□□ 0.39
IRC3Q06683 GAR1YHR089C 618 nt17.26■□□□□ 0.35
IRC3Q06683 SHU1YHL006C 453 nt17■□□□□ 0.31
IRC3Q06683 DEP1YAL013W 1218 nt16.84■□□□□ 0.29
IRC3Q06683 URN1YPR152C 1398 nt16.72■□□□□ 0.27
IRC3Q06683 YNL208WYNL208W 600 nt16.69■□□□□ 0.26
IRC3Q06683 TIR1YER011W 765 nt16.67■□□□□ 0.26
IRC3Q06683 YOR139CYOR139C 393 nt16.65■□□□□ 0.26
IRC3Q06683 RPN10YHR200W 807 nt16.64■□□□□ 0.25
IRC3Q06683 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.55■□□□□ 0.24
IRC3Q06683 NPL3YDR432W 1245 nt16.41■□□□□ 0.22
IRC3Q06683 OPI9YLR338W 858 nt16.38■□□□□ 0.21
IRC3Q06683 SSA1YAL005C 1929 nt16.33■□□□□ 0.21
IRC3Q06683 YGR021WYGR021W 873 nt16.14■□□□□ 0.17
IRC3Q06683 SRB2YHR041C 633 nt16.13■□□□□ 0.17
IRC3Q06683 SAH1YER043C 1350 nt16.1■□□□□ 0.17
IRC3Q06683 HOM6YJR139C 1080 nt16.08■□□□□ 0.16
IRC3Q06683 YOL037CYOL037C 354 nt16.07■□□□□ 0.16
IRC3Q06683 MNP1YGL068W 585 nt16.05■□□□□ 0.16
IRC3Q06683 WWM1YFL010C 636 nt16.01■□□□□ 0.15
IRC3Q06683 YJR018WYJR018W 363 nt15.99■□□□□ 0.15
IRC3Q06683 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.97■□□□□ 0.15
IRC3Q06683 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.97■□□□□ 0.15
IRC3Q06683 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.97■□□□□ 0.15
IRC3Q06683 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.97■□□□□ 0.15
IRC3Q06683 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.97■□□□□ 0.15
IRC3Q06683 PUN1YLR414C 792 nt15.92■□□□□ 0.14
IRC3Q06683 PUT4YOR348C 1884 nt15.9■□□□□ 0.14
IRC3Q06683 RPP2BYDR382W 333 nt15.85■□□□□ 0.13
IRC3Q06683 RKM5YLR137W 1104 nt15.85■□□□□ 0.13
IRC3Q06683 YJR120WYJR120W 351 nt15.83■□□□□ 0.12
IRC3Q06683 ARE1YCR048W 1833 nt15.79■□□□□ 0.12
IRC3Q06683 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.78■□□□□ 0.12
IRC3Q06683 PUS2YGL063W 1113 nt15.65■□□□□ 0.1
IRC3Q06683 YLR281CYLR281C 468 nt15.64■□□□□ 0.09
IRC3Q06683 BDH2YAL061W 1254 nt15.61■□□□□ 0.09
IRC3Q06683 SSA3YBL075C 1950 nt15.61■□□□□ 0.09
IRC3Q06683 PTC2YER089C 1395 nt15.6■□□□□ 0.09
IRC3Q06683 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.58■□□□□ 0.08
IRC3Q06683 MOT3YMR070W 1473 nt15.58■□□□□ 0.08
IRC3Q06683 LSM3YLR438C-A 270 nt15.54■□□□□ 0.08
IRC3Q06683 WHI5YOR083W 888 nt15.49■□□□□ 0.07
IRC3Q06683 POA1YBR022W 534 nt15.45■□□□□ 0.06
IRC3Q06683 BSC6YOL137W 1494 nt15.4■□□□□ 0.06
IRC3Q06683 INM2YDR287W 879 nt15.37■□□□□ 0.05
IRC3Q06683 NAB2YGL122C 1578 nt15.33■□□□□ 0.05
IRC3Q06683 YBL100CYBL100C 315 nt15.3■□□□□ 0.04
IRC3Q06683 BUD23YCR047C 828 nt15.27■□□□□ 0.04
IRC3Q06683 FMP45YDL222C 930 nt15.25■□□□□ 0.03
IRC3Q06683 DAL1YIR027C 1383 nt15.24■□□□□ 0.03
IRC3Q06683 DSK2YMR276W 1122 nt15.24■□□□□ 0.03
IRC3Q06683 TRM9YML014W 840 nt15.23■□□□□ 0.03
IRC3Q06683 MRPL8YJL063C 717 nt15.21■□□□□ 0.03
IRC3Q06683 IMP2'YIL154C 1041 nt15.2■□□□□ 0.02
IRC3Q06683 FPR4YLR449W 1179 nt15.2■□□□□ 0.02
IRC3Q06683 YPR011CYPR011C 981 nt15.19■□□□□ 0.02
IRC3Q06683 YCH1YGR203W 447 nt15.15■□□□□ 0.02
IRC3Q06683 FIS1YIL065C 468 nt15.15■□□□□ 0.02
IRC3Q06683 FUN26YAL022C 1554 nt15.13■□□□□ 0.01
IRC3Q06683 YLR236CYLR236C 324 nt15.13■□□□□ 0.01
IRC3Q06683 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt15.09■□□□□ 0.01
IRC3Q06683 PHO4YFR034C 939 nt15.08■□□□□ 0
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