RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W MRPL33P20084 86 aa7.37□□□□□ -1.23
VHS1YDR247W MET1P36150 593 aa7.37□□□□□ -1.23
VHS1YDR247W SUT1P53032 299 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
VHS1YDR247W HED1Q03937 162 aa7.37□□□□□ -1.23
VHS1YDR247W RTT106P40161 455 aa7.36□□□□□ -1.23
VHS1YDR247W SPP41P38904 1435 aa7.36□□□□□ -1.23
VHS1YDR247W PHO4P07270 312 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
VHS1YDR247W NAP1P25293 417 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
VHS1YDR247W MNL2Q12205 849 aa7.35□□□□□ -1.23
VHS1YDR247W GCD6P32501 712 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
VHS1YDR247W JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
VHS1YDR247W SMC1P32908 1225 aa7.33□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W RPT1P33299 467 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W NUP170P38181 1502 aa7.33□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W KOG1P38873 1557 aa7.33□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W SSM4P40318 1319 aa7.33□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W KTR2P33550 425 aa7.33□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W FYV10P40492 516 aa7.33□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W YNL011CP53980 444 aa7.33□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W RPO31P04051 1460 aa7.32□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W SMC4Q12267 1418 aa7.32□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W VMA3P25515 160 aa7.32□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W ALA1P40825 983 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W HXT8P40886 569 aa7.32□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W CDC55Q00362 526 aa7.32□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W UTP4Q06679 776 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W STH1P32597 1359 aa7.31□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W VPS35P34110 944 aa7.31□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W LDH1P38139 375 aa7.31□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W DAK2P43550 591 aa7.31□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W SAM37P50110 327 aa7.31□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W Q0182Q9ZZW1 134 aa7.31□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W PEP1P32319 1579 aa7.3□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W MLP2P40457 1679 aa7.3□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W AMS1P22855 1083 aa7.3□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W OCA5P38738 679 aa7.3□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W RAS1P01119 309 aa7.29□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W MCM2P29469 868 aa7.29□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W NNF1P47149 201 aa7.29□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W MET32Q12041 191 aa7.29□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W UGA3P26370 528 aa7.28□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W DYS1P38791 387 aa7.28□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W RMD1Q03441 430 aa7.28□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W SPR28Q04921 423 aa7.28□□□□□ -1.24
VHS1YDR247W TY1B-DR3Q99231 1755 aa7.27□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W CIC1P38779 376 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W FIR1P40020 876 aa7.27□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W YNL165WP53891 406 aa7.27□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W OXR1Q08952 273 aa7.27□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa7.27□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W TY2B-FP0CX63 1770 aa7.27□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W TY2B-GR2P0CX64 1770 aa7.27□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W TY2B-CP25384 1770 aa7.27□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W TY2B-DR2Q03494 1770 aa7.27□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W TY1B-DR1Q03855 1755 aa7.27□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W TY2B-OR1Q12113 1770 aa7.27□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W TY2B-DR1Q12472 1770 aa7.27□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W TY2B-OR2Q12501 1770 aa7.27□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W YCF1P39109 1515 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W ARG82P07250 355 aa7.26□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W MLF3P32047 452 aa7.26□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W RAD55P38953 406 aa7.26□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W QDR2P40474 542 aa7.26□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W RSC4Q02206 625 aa7.26□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W BSC2Q05611 235 aa7.26□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W MAG2Q06436 670 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W PEP7P32609 515 aa7.25□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W YTA6P40328 754 aa7.25□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W MAD1P40957 749 aa7.25□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W CLA4P48562 842 aa7.25□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W MDS3P53094 1487 aa7.25□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W SSN3P39073 555 aa7.24□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W RPS26AP39938 119 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W RPS26BP39939 119 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W NTA1P40354 457 aa7.24□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W AAD14P42884 376 aa7.24□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W JJJ2P46997 583 aa7.24□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W MSB3P48566 633 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W MSN5P52918 1224 aa7.24□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W YGR122WP53272 402 aa7.23□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W HST3P53687 447 aa7.23□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W ESF1Q06344 628 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W CDC4P07834 779 aa7.22□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W CLN2P20438 545 aa7.22□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W MSN1P22148 382 aa7.22□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W AHP1P38013 176 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W YBR287WP38355 427 aa7.22□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W POL5P39985 1022 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W TY2B-BQ12491 1770 aa7.22□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W KAP122P32767 1081 aa7.21□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W IRS4P36115 615 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W RGD2P43556 714 aa7.21□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W SRC1Q03707 834 aa7.21□□□□□ -1.25
VHS1YDR247W PAN1P32521 1480 aa7.21□□□□□ -1.25
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