Protein–RNA interactions for Protein: Q05611

BSC2, Bypass of stop codon protein 2, yeastyeast

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BSC2Q05611 NSR1YGR159C 1245 nt19.63■□□□□ 0.73
BSC2Q05611 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.61■□□□□ 0.73
BSC2Q05611 NOP1YDL014W 984 nt19■□□□□ 0.63
BSC2Q05611 MDJ1YFL016C 1536 nt17.56■□□□□ 0.4
BSC2Q05611 YKL036CYKL036C 393 nt17.44■□□□□ 0.38
BSC2Q05611 Q0297Q0297 156 nt16.64■□□□□ 0.25
BSC2Q05611 SRX1YKL086W 384 nt16.64■□□□□ 0.25
BSC2Q05611 YJL027CYJL027C 417 nt16.25■□□□□ 0.19
BSC2Q05611 SCS3YGL126W 1143 nt15.84■□□□□ 0.13
BSC2Q05611 YCR051WYCR051W 669 nt15.75■□□□□ 0.11
BSC2Q05611 DBP2YNL112W 1641 nt15.54■□□□□ 0.08
BSC2Q05611 YOL085CYOL085C 342 nt15.15■□□□□ 0.02
BSC2Q05611 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.13■□□□□ 0.01
BSC2Q05611 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.13■□□□□ 0.01
BSC2Q05611 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.13■□□□□ 0.01
BSC2Q05611 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.13■□□□□ 0.01
BSC2Q05611 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.13■□□□□ 0.01
BSC2Q05611 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.13■□□□□ 0.01
BSC2Q05611 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.13■□□□□ 0.01
BSC2Q05611 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.13■□□□□ 0.01
BSC2Q05611 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.13■□□□□ 0.01
BSC2Q05611 YBR190WYBR190W 312 nt14.99□□□□□ -0.01
BSC2Q05611 CCC1YLR220W 969 nt14.96□□□□□ -0.01
BSC2Q05611 PKP1YIL042C 1185 nt14.93□□□□□ -0.02
BSC2Q05611 RPP1BYDL130W 321 nt14.92□□□□□ -0.02
BSC2Q05611 RTC3YHR087W 336 nt14.62□□□□□ -0.07
BSC2Q05611 Q0182Q0182 405 nt14.61□□□□□ -0.07
BSC2Q05611 SCJ1YMR214W 1134 nt14.46□□□□□ -0.09
BSC2Q05611 RVS167YDR388W 1449 nt14.45□□□□□ -0.1
BSC2Q05611 MOT3YMR070W 1473 nt14.3□□□□□ -0.12
BSC2Q05611 PET122YER153C 765 nt14.29□□□□□ -0.12
BSC2Q05611 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.27□□□□□ -0.13
BSC2Q05611 ATS1YAL020C 1002 nt14.16□□□□□ -0.14
BSC2Q05611 SSA3YBL075C 1950 nt14.13□□□□□ -0.15
BSC2Q05611 SCR1SCR1 522 nt14.03□□□□□ -0.16
BSC2Q05611 SHR5YOL110W 714 nt13.98□□□□□ -0.17
BSC2Q05611 RRN5YLR141W 1092 nt13.87□□□□□ -0.19
BSC2Q05611 YDJ1YNL064C 1230 nt13.81□□□□□ -0.2
BSC2Q05611 PUT4YOR348C 1884 nt13.75□□□□□ -0.21
BSC2Q05611 URN1YPR152C 1398 nt13.67□□□□□ -0.22
BSC2Q05611 DEP1YAL013W 1218 nt13.63□□□□□ -0.23
BSC2Q05611 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.6□□□□□ -0.23
BSC2Q05611 OPI9YLR338W 858 nt13.51□□□□□ -0.25
BSC2Q05611 GAR1YHR089C 618 nt13.5□□□□□ -0.25
BSC2Q05611 RSB1YOR049C 1065 nt13.5□□□□□ -0.25
BSC2Q05611 SAH1YER043C 1350 nt13.46□□□□□ -0.25
BSC2Q05611 ARE1YCR048W 1833 nt13.46□□□□□ -0.25
BSC2Q05611 YNL208WYNL208W 600 nt13.39□□□□□ -0.27
BSC2Q05611 RPN10YHR200W 807 nt13.37□□□□□ -0.27
BSC2Q05611 POA1YBR022W 534 nt13.3□□□□□ -0.28
BSC2Q05611 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.25□□□□□ -0.29
BSC2Q05611 PST2YDR032C 597 nt13.14□□□□□ -0.31
BSC2Q05611 TIR1YER011W 765 nt13.07□□□□□ -0.32
BSC2Q05611 PUN1YLR414C 792 nt13.07□□□□□ -0.32
BSC2Q05611 YJR018WYJR018W 363 nt13.03□□□□□ -0.32
BSC2Q05611 BSC6YOL137W 1494 nt13.03□□□□□ -0.32
BSC2Q05611 SSA1YAL005C 1929 nt12.98□□□□□ -0.33
BSC2Q05611 PTC2YER089C 1395 nt12.96□□□□□ -0.33
BSC2Q05611 BUD23YCR047C 828 nt12.91□□□□□ -0.34
BSC2Q05611 YJR120WYJR120W 351 nt12.89□□□□□ -0.35
BSC2Q05611 SRB2YHR041C 633 nt12.8□□□□□ -0.36
BSC2Q05611 NAB2YGL122C 1578 nt12.8□□□□□ -0.36
BSC2Q05611 RPP2BYDR382W 333 nt12.68□□□□□ -0.38
BSC2Q05611 FIS1YIL065C 468 nt12.65□□□□□ -0.38
BSC2Q05611 YKL097CYKL097C 411 nt12.65□□□□□ -0.38
BSC2Q05611 SHU1YHL006C 453 nt12.63□□□□□ -0.39
BSC2Q05611 DAL1YIR027C 1383 nt12.61□□□□□ -0.39
BSC2Q05611 SPT5YML010W 3192 nt12.6□□□□□ -0.39
BSC2Q05611 INM2YDR287W 879 nt12.57□□□□□ -0.4
BSC2Q05611 FPR4YLR449W 1179 nt12.55□□□□□ -0.4
BSC2Q05611 PHO4YFR034C 939 nt12.5□□□□□ -0.41
BSC2Q05611 SSA4YER103W 1929 nt12.49□□□□□ -0.41
BSC2Q05611 WWM1YFL010C 636 nt12.49□□□□□ -0.41
BSC2Q05611 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.47□□□□□ -0.41
BSC2Q05611 BDH2YAL061W 1254 nt12.45□□□□□ -0.42
BSC2Q05611 YBL100CYBL100C 315 nt12.43□□□□□ -0.42
BSC2Q05611 NME1NME1 340 nt12.37□□□□□ -0.43
BSC2Q05611 HOM6YJR139C 1080 nt12.33□□□□□ -0.44
BSC2Q05611 YPS1YLR120C 1710 nt12.32□□□□□ -0.44
BSC2Q05611 YGR021WYGR021W 873 nt12.32□□□□□ -0.44
BSC2Q05611 FUN26YAL022C 1554 nt12.3□□□□□ -0.44
BSC2Q05611 LSM3YLR438C-A 270 nt12.28□□□□□ -0.44
BSC2Q05611 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.26□□□□□ -0.45
BSC2Q05611 MNP1YGL068W 585 nt12.25□□□□□ -0.45
BSC2Q05611 MEP2YNL142W 1500 nt12.24□□□□□ -0.45
BSC2Q05611 YDR095CYDR095C 411 nt12.22□□□□□ -0.45
BSC2Q05611 TRM9YML014W 840 nt12.22□□□□□ -0.45
BSC2Q05611 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.14□□□□□ -0.47
BSC2Q05611 RKM5YLR137W 1104 nt12.14□□□□□ -0.47
BSC2Q05611 YOR139CYOR139C 393 nt12.14□□□□□ -0.47
BSC2Q05611 CCT6YDR188W 1641 nt12.14□□□□□ -0.47
BSC2Q05611 ALF1YNL148C 765 nt12.09□□□□□ -0.47
BSC2Q05611 BDF1YLR399C 2061 nt12.09□□□□□ -0.47
BSC2Q05611 DCW1YKL046C 1350 nt12.07□□□□□ -0.48
BSC2Q05611 PTP1YDL230W 1008 nt12.02□□□□□ -0.49
BSC2Q05611 YGR139WYGR139W 339 nt12□□□□□ -0.49
BSC2Q05611 SIS1YNL007C 1059 nt11.99□□□□□ -0.49
BSC2Q05611 RPP2AYOL039W 321 nt11.98□□□□□ -0.49
BSC2Q05611 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.97□□□□□ -0.49
BSC2Q05611 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.97□□□□□ -0.49
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