RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	SOL1	P50278	321 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	MDM34	P53083	459 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	HHT1	P61830	136 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	RUB1	Q03919	77 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	FMP42	Q04991	504 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	YPS3	Q12303	508 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	STP22	P25604	385 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	UGX2	P32772	223 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	NKP2	Q06162	153 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	AKR2	Q12013	749 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	SDH3	P33421	198 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	IRC22	P40006	225 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	AVT6	P40074	448 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	BIR1	P47134	954 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	YGL262W	P53054	175 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	ORM1	P53224	222 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	YDL180W	Q12301	547 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	TFC1	P32367	649 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	YLR281C	Q05863	155 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	YOR342C	Q12182	319 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	TSC3	Q3E790	80 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	LDB16	P25587	256 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	VMA7	P39111	118 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	RFC2	P40348	353 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	YIL152W	P40455	235 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	THI74	Q04083	370 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	LPP1	Q04396	274 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	EMI1	Q04406	187 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	TIM22	Q12328	207 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	IZH2	Q12442	317 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYF1	YDR416W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	DLS1	P40366	167 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	YGL088W	P53151	121 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	LDB18	Q07887	179 aa		3.34	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	MRP49	P32388	137 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	YPL073C	P40323	161 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	PGD1	P40356	397 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	SNM1	P40993	198 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	RPA43	P46669	326 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	CNL1	Q06333	122 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	DAS2	Q12084	232 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	YLR462W	O13556	202 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	YCR101C	P25607	182 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	TKL2	P33315	681 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	YBR063C	P38083	404 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	CSH1	P38287	376 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	YEL075C	P39972	122 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	OST2	P46964	130 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	GAS3	Q03655	524 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	YPL162C	Q12042	273 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	POP4	P38336	279 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	YJL028W	P47062	111 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	XPT1	P47165	209 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	INP1	Q03694	420 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	YMR244W	Q04018	355 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	FYV7	Q12247	151 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	ATG5	Q12380	294 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	Q0255	P03881	472 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	YPT53	P36019	220 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.32	□□□□□ -1.88	not detected
SYF1	YDR416W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	TIM17	P39515	158 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	YND1	P40009	630 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	YFR054C	P43622	192 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	TTI2	P47168	421 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	UFD1	P53044	361 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	CAB4	P53332	305 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	YDR366C	P87287	132 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
SYF1	YDR416W	YPL039W	Q03080	316 aa		3.32	□□□□□ -1.88

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