Protein–RNA interactions for Protein: Q12328

TIM22, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM22, yeastyeast

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIM22Q12328 NSR1YGR159C 1245 nt15.45■□□□□ 0.06
TIM22Q12328 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.19■□□□□ 0.02
TIM22Q12328 NOP1YDL014W 984 nt14.68□□□□□ -0.06
TIM22Q12328 MDJ1YFL016C 1536 nt13.97□□□□□ -0.17
TIM22Q12328 YKL036CYKL036C 393 nt13.19□□□□□ -0.3
TIM22Q12328 YJL027CYJL027C 417 nt12.92□□□□□ -0.34
TIM22Q12328 SRX1YKL086W 384 nt12.8□□□□□ -0.36
TIM22Q12328 Q0297Q0297 156 nt12.71□□□□□ -0.37
TIM22Q12328 DBP2YNL112W 1641 nt12.22□□□□□ -0.45
TIM22Q12328 YCR051WYCR051W 669 nt12.1□□□□□ -0.47
TIM22Q12328 YBR190WYBR190W 312 nt12.06□□□□□ -0.48
TIM22Q12328 SCS3YGL126W 1143 nt11.78□□□□□ -0.52
TIM22Q12328 RTC3YHR087W 336 nt11.77□□□□□ -0.53
TIM22Q12328 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.76□□□□□ -0.53
TIM22Q12328 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.76□□□□□ -0.53
TIM22Q12328 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.76□□□□□ -0.53
TIM22Q12328 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.76□□□□□ -0.53
TIM22Q12328 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.76□□□□□ -0.53
TIM22Q12328 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.76□□□□□ -0.53
TIM22Q12328 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.76□□□□□ -0.53
TIM22Q12328 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.76□□□□□ -0.53
TIM22Q12328 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.76□□□□□ -0.53
TIM22Q12328 CCC1YLR220W 969 nt11.63□□□□□ -0.55
TIM22Q12328 SSA3YBL075C 1950 nt11.51□□□□□ -0.57
TIM22Q12328 RVS167YDR388W 1449 nt11.49□□□□□ -0.57
TIM22Q12328 YOL085CYOL085C 342 nt11.41□□□□□ -0.58
TIM22Q12328 RPP1BYDL130W 321 nt11.4□□□□□ -0.58
TIM22Q12328 SCJ1YMR214W 1134 nt11.27□□□□□ -0.61
TIM22Q12328 PKP1YIL042C 1185 nt11.25□□□□□ -0.61
TIM22Q12328 PUT4YOR348C 1884 nt11.18□□□□□ -0.62
TIM22Q12328 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.01□□□□□ -0.65
TIM22Q12328 SHR5YOL110W 714 nt10.98□□□□□ -0.65
TIM22Q12328 PET122YER153C 765 nt10.9□□□□□ -0.66
TIM22Q12328 URN1YPR152C 1398 nt10.88□□□□□ -0.67
TIM22Q12328 ARE1YCR048W 1833 nt10.86□□□□□ -0.67
TIM22Q12328 POA1YBR022W 534 nt10.81□□□□□ -0.68
TIM22Q12328 SAH1YER043C 1350 nt10.8□□□□□ -0.68
TIM22Q12328 OPI9YLR338W 858 nt10.8□□□□□ -0.68
TIM22Q12328 SCR1SCR1 522 nt10.75□□□□□ -0.69
TIM22Q12328 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt10.74□□□□□ -0.69
TIM22Q12328 DEP1YAL013W 1218 nt10.74□□□□□ -0.69
TIM22Q12328 RPN10YHR200W 807 nt10.69□□□□□ -0.7
TIM22Q12328 YDJ1YNL064C 1230 nt10.68□□□□□ -0.7
TIM22Q12328 BSC6YOL137W 1494 nt10.64□□□□□ -0.71
TIM22Q12328 YNL208WYNL208W 600 nt10.59□□□□□ -0.71
TIM22Q12328 RRN5YLR141W 1092 nt10.56□□□□□ -0.72
TIM22Q12328 PUN1YLR414C 792 nt10.51□□□□□ -0.73
TIM22Q12328 BUD23YCR047C 828 nt10.47□□□□□ -0.73
TIM22Q12328 GAR1YHR089C 618 nt10.47□□□□□ -0.73
TIM22Q12328 ATS1YAL020C 1002 nt10.45□□□□□ -0.74
TIM22Q12328 PTC2YER089C 1395 nt10.4□□□□□ -0.74
TIM22Q12328 SPT5YML010W 3192 nt10.37□□□□□ -0.75
TIM22Q12328 YJR018WYJR018W 363 nt10.37□□□□□ -0.75
TIM22Q12328 NAB2YGL122C 1578 nt10.35□□□□□ -0.75
TIM22Q12328 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.34□□□□□ -0.75
TIM22Q12328 RSB1YOR049C 1065 nt10.25□□□□□ -0.77
TIM22Q12328 SSA4YER103W 1929 nt10.19□□□□□ -0.78
TIM22Q12328 TIR1YER011W 765 nt10.14□□□□□ -0.79
TIM22Q12328 FIS1YIL065C 468 nt10.12□□□□□ -0.79
TIM22Q12328 DAL1YIR027C 1383 nt10.12□□□□□ -0.79
TIM22Q12328 RPP2BYDR382W 333 nt10.09□□□□□ -0.79
TIM22Q12328 FPR4YLR449W 1179 nt10.08□□□□□ -0.8
TIM22Q12328 INM2YDR287W 879 nt10.07□□□□□ -0.8
TIM22Q12328 YJR120WYJR120W 351 nt10.07□□□□□ -0.8
TIM22Q12328 SSA1YAL005C 1929 nt10.06□□□□□ -0.8
TIM22Q12328 MEP2YNL142W 1500 nt10.03□□□□□ -0.8
TIM22Q12328 PHO4YFR034C 939 nt10.02□□□□□ -0.81
TIM22Q12328 YPS1YLR120C 1710 nt9.96□□□□□ -0.82
TIM22Q12328 YBL100CYBL100C 315 nt9.89□□□□□ -0.83
TIM22Q12328 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt9.88□□□□□ -0.83
TIM22Q12328 BDF1YLR399C 2061 nt9.84□□□□□ -0.83
TIM22Q12328 YDR095CYDR095C 411 nt9.84□□□□□ -0.83
TIM22Q12328 DCW1YKL046C 1350 nt9.84□□□□□ -0.83
TIM22Q12328 BDH2YAL061W 1254 nt9.81□□□□□ -0.84
TIM22Q12328 SRB2YHR041C 633 nt9.77□□□□□ -0.85
TIM22Q12328 YMR090WYMR090W 684 nt9.76□□□□□ -0.85
TIM22Q12328 FUN26YAL022C 1554 nt9.75□□□□□ -0.85
TIM22Q12328 PST2YDR032C 597 nt9.74□□□□□ -0.85
TIM22Q12328 EMI2YDR516C 1503 nt9.73□□□□□ -0.85
TIM22Q12328 ALF1YNL148C 765 nt9.72□□□□□ -0.85
TIM22Q12328 TAT1YBR069C 1860 nt9.71□□□□□ -0.85
TIM22Q12328 TRM9YML014W 840 nt9.7□□□□□ -0.86
TIM22Q12328 RPP2AYOL039W 321 nt9.67□□□□□ -0.86
TIM22Q12328 YBR220CYBR220C 1683 nt9.66□□□□□ -0.86
TIM22Q12328 LSM3YLR438C-A 270 nt9.64□□□□□ -0.87
TIM22Q12328 YDL221WYDL221W 552 nt9.63□□□□□ -0.87
TIM22Q12328 PTP1YDL230W 1008 nt9.62□□□□□ -0.87
TIM22Q12328 WWM1YFL010C 636 nt9.61□□□□□ -0.87
TIM22Q12328 CCT6YDR188W 1641 nt9.6□□□□□ -0.87
TIM22Q12328 CAC2YML102W 1407 nt9.59□□□□□ -0.87
TIM22Q12328 SUF2tP(AGG)C 72 nt9.59□□□□□ -0.87
TIM22Q12328 SUF10tP(AGG)N 72 nt9.59□□□□□ -0.87
TIM22Q12328 SDH1YKL148C 1923 nt9.58□□□□□ -0.88
TIM22Q12328 SIS1YNL007C 1059 nt9.56□□□□□ -0.88
TIM22Q12328 PAC11YDR488C 1602 nt9.54□□□□□ -0.88
TIM22Q12328 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt9.5□□□□□ -0.89
TIM22Q12328 YGR021WYGR021W 873 nt9.5□□□□□ -0.89
TIM22Q12328 Q0182Q0182 405 nt9.5□□□□□ -0.89
TIM22Q12328 SCC4YER147C 1875 nt9.48□□□□□ -0.89
TIM22Q12328 IRC15YPL017C 1500 nt9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.6 ms