Protein–RNA interactions for Protein: Q08962

NIP7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIP7Q08962 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.21■□□□□ 0.51
NIP7Q08962 NSR1YGR159C 1245 nt18.11■□□□□ 0.49
NIP7Q08962 NOP1YDL014W 984 nt17.73■□□□□ 0.43
NIP7Q08962 YKL036CYKL036C 393 nt16.29■□□□□ 0.2
NIP7Q08962 MDJ1YFL016C 1536 nt16.09■□□□□ 0.17
NIP7Q08962 Q0297Q0297 156 nt15.45■□□□□ 0.06
NIP7Q08962 SRX1YKL086W 384 nt15.44■□□□□ 0.06
NIP7Q08962 YJL027CYJL027C 417 nt15.21■□□□□ 0.03
NIP7Q08962 SCS3YGL126W 1143 nt14.77□□□□□ -0.05
NIP7Q08962 YCR051WYCR051W 669 nt14.67□□□□□ -0.06
NIP7Q08962 DBP2YNL112W 1641 nt14.16□□□□□ -0.14
NIP7Q08962 YOL085CYOL085C 342 nt14.07□□□□□ -0.16
NIP7Q08962 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.96□□□□□ -0.17
NIP7Q08962 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.96□□□□□ -0.17
NIP7Q08962 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.96□□□□□ -0.17
NIP7Q08962 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.96□□□□□ -0.17
NIP7Q08962 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.96□□□□□ -0.17
NIP7Q08962 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.96□□□□□ -0.17
NIP7Q08962 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.96□□□□□ -0.17
NIP7Q08962 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.96□□□□□ -0.17
NIP7Q08962 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.96□□□□□ -0.17
NIP7Q08962 RPP1BYDL130W 321 nt13.87□□□□□ -0.19
NIP7Q08962 PKP1YIL042C 1185 nt13.87□□□□□ -0.19
NIP7Q08962 CCC1YLR220W 969 nt13.86□□□□□ -0.19
NIP7Q08962 YBR190WYBR190W 312 nt13.75□□□□□ -0.21
NIP7Q08962 RTC3YHR087W 336 nt13.49□□□□□ -0.25
NIP7Q08962 RVS167YDR388W 1449 nt13.45□□□□□ -0.26
NIP7Q08962 SCJ1YMR214W 1134 nt13.27□□□□□ -0.29
NIP7Q08962 PET122YER153C 765 nt13.24□□□□□ -0.29
NIP7Q08962 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.2□□□□□ -0.3
NIP7Q08962 ATS1YAL020C 1002 nt13.2□□□□□ -0.3
NIP7Q08962 SCR1SCR1 522 nt13.16□□□□□ -0.3
NIP7Q08962 SHR5YOL110W 714 nt12.93□□□□□ -0.34
NIP7Q08962 RRN5YLR141W 1092 nt12.85□□□□□ -0.35
NIP7Q08962 YDJ1YNL064C 1230 nt12.78□□□□□ -0.36
NIP7Q08962 RSB1YOR049C 1065 nt12.62□□□□□ -0.39
NIP7Q08962 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.59□□□□□ -0.39
NIP7Q08962 URN1YPR152C 1398 nt12.57□□□□□ -0.4
NIP7Q08962 DEP1YAL013W 1218 nt12.55□□□□□ -0.4
NIP7Q08962 GAR1YHR089C 618 nt12.51□□□□□ -0.41
NIP7Q08962 PUT4YOR348C 1884 nt12.45□□□□□ -0.42
NIP7Q08962 RPN10YHR200W 807 nt12.44□□□□□ -0.42
NIP7Q08962 OPI9YLR338W 858 nt12.39□□□□□ -0.43
NIP7Q08962 YNL208WYNL208W 600 nt12.38□□□□□ -0.43
NIP7Q08962 SAH1YER043C 1350 nt12.31□□□□□ -0.44
NIP7Q08962 ARE1YCR048W 1833 nt12.22□□□□□ -0.45
NIP7Q08962 PST2YDR032C 597 nt12.21□□□□□ -0.45
NIP7Q08962 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.11□□□□□ -0.47
NIP7Q08962 POA1YBR022W 534 nt12.1□□□□□ -0.47
NIP7Q08962 TIR1YER011W 765 nt12.09□□□□□ -0.47
NIP7Q08962 PUN1YLR414C 792 nt12.06□□□□□ -0.48
NIP7Q08962 YJR018WYJR018W 363 nt12□□□□□ -0.49
NIP7Q08962 SSA1YAL005C 1929 nt11.91□□□□□ -0.5
NIP7Q08962 PTC2YER089C 1395 nt11.9□□□□□ -0.5
NIP7Q08962 BUD23YCR047C 828 nt11.86□□□□□ -0.51
NIP7Q08962 BSC6YOL137W 1494 nt11.84□□□□□ -0.51
NIP7Q08962 RPP2BYDR382W 333 nt11.81□□□□□ -0.52
NIP7Q08962 YKL097CYKL097C 411 nt11.76□□□□□ -0.53
NIP7Q08962 NAB2YGL122C 1578 nt11.75□□□□□ -0.53
NIP7Q08962 SHU1YHL006C 453 nt11.72□□□□□ -0.53
NIP7Q08962 YJR120WYJR120W 351 nt11.72□□□□□ -0.53
NIP7Q08962 SRB2YHR041C 633 nt11.64□□□□□ -0.55
NIP7Q08962 SSA3YBL075C 1950 nt11.61□□□□□ -0.55
NIP7Q08962 DAL1YIR027C 1383 nt11.6□□□□□ -0.55
NIP7Q08962 INM2YDR287W 879 nt11.6□□□□□ -0.55
NIP7Q08962 FPR4YLR449W 1179 nt11.6□□□□□ -0.55
NIP7Q08962 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.56□□□□□ -0.56
NIP7Q08962 FIS1YIL065C 468 nt11.55□□□□□ -0.56
NIP7Q08962 WWM1YFL010C 636 nt11.53□□□□□ -0.56
NIP7Q08962 YGR021WYGR021W 873 nt11.52□□□□□ -0.57
NIP7Q08962 BDH2YAL061W 1254 nt11.51□□□□□ -0.57
NIP7Q08962 PHO4YFR034C 939 nt11.48□□□□□ -0.57
NIP7Q08962 YBL100CYBL100C 315 nt11.48□□□□□ -0.57
NIP7Q08962 HOM6YJR139C 1080 nt11.41□□□□□ -0.58
NIP7Q08962 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.38□□□□□ -0.59
NIP7Q08962 LSM3YLR438C-A 270 nt11.36□□□□□ -0.59
NIP7Q08962 MNP1YGL068W 585 nt11.35□□□□□ -0.59
NIP7Q08962 TRM9YML014W 840 nt11.32□□□□□ -0.6
NIP7Q08962 FUN26YAL022C 1554 nt11.32□□□□□ -0.6
NIP7Q08962 RKM5YLR137W 1104 nt11.26□□□□□ -0.61
NIP7Q08962 YPS1YLR120C 1710 nt11.24□□□□□ -0.61
NIP7Q08962 NPL3YDR432W 1245 nt11.23□□□□□ -0.61
NIP7Q08962 YOR139CYOR139C 393 nt11.23□□□□□ -0.61
NIP7Q08962 ALF1YNL148C 765 nt11.22□□□□□ -0.61
NIP7Q08962 YOL037CYOL037C 354 nt11.2□□□□□ -0.62
NIP7Q08962 CCT6YDR188W 1641 nt11.18□□□□□ -0.62
NIP7Q08962 YDR095CYDR095C 411 nt11.18□□□□□ -0.62
NIP7Q08962 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.18□□□□□ -0.62
NIP7Q08962 SPT5YML010W 3192 nt11.17□□□□□ -0.62
NIP7Q08962 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.14□□□□□ -0.63
NIP7Q08962 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.14□□□□□ -0.63
NIP7Q08962 MEP2YNL142W 1500 nt11.11□□□□□ -0.63
NIP7Q08962 SIS1YNL007C 1059 nt10.98□□□□□ -0.65
NIP7Q08962 RPP2AYOL039W 321 nt10.98□□□□□ -0.65
NIP7Q08962 DCW1YKL046C 1350 nt10.91□□□□□ -0.66
NIP7Q08962 YLR281CYLR281C 468 nt10.9□□□□□ -0.66
NIP7Q08962 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.89□□□□□ -0.67
NIP7Q08962 WHI5YOR083W 888 nt10.88□□□□□ -0.67
NIP7Q08962 PTP1YDL230W 1008 nt10.87□□□□□ -0.67
NIP7Q08962 SSA4YER103W 1929 nt10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.9 ms