RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	DRS1	P32892	752 aa	Known RBP	8.89	□□□□□ -0.99
SYF1	YDR416W	TFA1	P36100	482 aa		8.27	□□□□□ -1.08
SYF1	YDR416W	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	8.09	□□□□□ -1.11
SYF1	YDR416W	MTC1	P47018	478 aa	Known RBP	7.96	□□□□□ -1.13
SYF1	YDR416W	RQC2	Q12532	1038 aa	Known RBP	7.95	□□□□□ -1.14
SYF1	YDR416W	TAF7	Q05021	590 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SYF1	YDR416W	AVT3	P36062	692 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SYF1	YDR416W	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SYF1	YDR416W	DMA1	P38823	416 aa		7.15	□□□□□ -1.26
SYF1	YDR416W	LEO1	P38439	464 aa		7.06	□□□□□ -1.28
SYF1	YDR416W	LEU3	P08638	886 aa		6.64	□□□□□ -1.35
SYF1	YDR416W	PTP3	P40048	928 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SYF1	YDR416W	RSE1	Q04693	1361 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
SYF1	YDR416W	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
SYF1	YDR416W	DMA2	P53924	522 aa		6.46	□□□□□ -1.38
SYF1	YDR416W	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	6.45	□□□□□ -1.38
SYF1	YDR416W	SSP1	P38871	571 aa		6.4	□□□□□ -1.39
SYF1	YDR416W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	6.38	□□□□□ -1.39
SYF1	YDR416W	ABP1	P15891	592 aa	Known RBP	6.37	□□□□□ -1.39
SYF1	YDR416W	RLF2	Q12495	606 aa		6.37	□□□□□ -1.39
SYF1	YDR416W	IFH1	P39520	1085 aa		6.32	□□□□□ -1.4
SYF1	YDR416W	AIM44	Q99299	758 aa		6.3	□□□□□ -1.4
SYF1	YDR416W	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
SYF1	YDR416W	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
SYF1	YDR416W	RIM101	P33400	625 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SYF1	YDR416W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
SYF1	YDR416W	ISW2	Q08773	1120 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SYF1	YDR416W	CKB1	P43639	278 aa		6.21	□□□□□ -1.41
SYF1	YDR416W	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.19	□□□□□ -1.42	not detected
SYF1	YDR416W	INO80	P53115	1489 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SYF1	YDR416W	SPT21	P35209	758 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SYF1	YDR416W	IOC4	Q04213	475 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SYF1	YDR416W	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
SYF1	YDR416W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	6.14	□□□□□ -1.43
SYF1	YDR416W	REB1	P21538	810 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SYF1	YDR416W	OXP1	P28273	1286 aa		6.12	□□□□□ -1.43
SYF1	YDR416W	YLR271W	Q06152	274 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SYF1	YDR416W	YAH1	Q12184	172 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
SYF1	YDR416W	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
SYF1	YDR416W	MGA2	P40578	1113 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SYF1	YDR416W	YML020W	Q03722	664 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SYF1	YDR416W	FAP1	P53971	965 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SYF1	YDR416W	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
SYF1	YDR416W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
SYF1	YDR416W	KIN1	P13185	1064 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SYF1	YDR416W	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
SYF1	YDR416W	YPR148C	Q06523	435 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SYF1	YDR416W	KOG1	P38873	1557 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SYF1	YDR416W	VPS70	P47161	811 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SYF1	YDR416W	CST9	Q06032	482 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SYF1	YDR416W	SLX8	P40072	274 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SYF1	YDR416W	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
SYF1	YDR416W	DSF2	P38213	736 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SYF1	YDR416W	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
SYF1	YDR416W	DNA2	P38859	1522 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SYF1	YDR416W	RSM7	P47150	247 aa		5.91	□□□□□ -1.46
SYF1	YDR416W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
SYF1	YDR416W	GEF1	P37020	779 aa		5.9	□□□□□ -1.47
SYF1	YDR416W	AIM7	Q12156	149 aa		5.89	□□□□□ -1.47
SYF1	YDR416W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
SYF1	YDR416W	PRI1	P10363	409 aa		5.88	□□□□□ -1.47
SYF1	YDR416W	SWR1	Q05471	1514 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SYF1	YDR416W	RAM2	P29703	316 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SYF1	YDR416W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
SYF1	YDR416W	PBS2	P08018	668 aa		5.86	□□□□□ -1.47
SYF1	YDR416W	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
SYF1	YDR416W	GLC3	P32775	704 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SYF1	YDR416W	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
SYF1	YDR416W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
SYF1	YDR416W	TOP1	P04786	769 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SYF1	YDR416W	MAM3	Q12296	706 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SYF1	YDR416W	MRX12	P47084	519 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SYF1	YDR416W	HPC2	Q01448	625 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SYF1	YDR416W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SYF1	YDR416W	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SYF1	YDR416W	SLD2	P34252	453 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SYF1	YDR416W	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SYF1	YDR416W	DIT2	P21595	489 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SYF1	YDR416W	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SYF1	YDR416W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SYF1	YDR416W	TFB3	Q03290	321 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SYF1	YDR416W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SYF1	YDR416W	MET10	P39692	1035 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SYF1	YDR416W	IES2	P40154	320 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SYF1	YDR416W	AI2	P03876	854 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SYF1	YDR416W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SYF1	YDR416W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SYF1	YDR416W	BRL1	P38770	471 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SYF1	YDR416W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
SYF1	YDR416W	ATF2	P53296	535 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SYF1	YDR416W	YTA7	P40340	1379 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SYF1	YDR416W	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
SYF1	YDR416W	PKC1	P24583	1151 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SYF1	YDR416W	RRN6	P32786	894 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SYF1	YDR416W	BRN1	P38170	754 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SYF1	YDR416W	HEM3	P28789	327 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SYF1	YDR416W	RCR1	P38212	213 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SYF1	YDR416W	BIM1	P40013	344 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SYF1	YDR416W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SYF1	YDR416W	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5

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