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Protein–RNA interactions for Protein: Q03048
COF1, Cofilin, yeast
Known RBP
Predictions only
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143 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
COF1
Q03048
NSR1
YGR159C
1245 nt
12.52
□□□□□ -0.41
COF1
Q03048
YML009W-B
YML009W-B
477 nt
12.01
□□□□□ -0.49
COF1
Q03048
SSA3
YBL075C
1950 nt
11.63
□□□□□ -0.55
COF1
Q03048
NOP1
YDL014W
984 nt
11.58
□□□□□ -0.56
COF1
Q03048
MDJ1
YFL016C
1536 nt
11.48
□□□□□ -0.57
COF1
Q03048
YJL027C
YJL027C
417 nt
10.59
□□□□□ -0.71
COF1
Q03048
YKL036C
YKL036C
393 nt
10.17
□□□□□ -0.78
COF1
Q03048
YBR190W
YBR190W
312 nt
10.15
□□□□□ -0.78
COF1
Q03048
SRX1
YKL086W
384 nt
10.11
□□□□□ -0.79
COF1
Q03048
SSA1
YAL005C
1929 nt
10.01
□□□□□ -0.81
COF1
Q03048
DBP2
YNL112W
1641 nt
10.01
□□□□□ -0.81
COF1
Q03048
Q0297
Q0297
156 nt
9.99
□□□□□ -0.81
COF1
Q03048
SSA4
YER103W
1929 nt
9.92
□□□□□ -0.82
COF1
Q03048
PUT4
YOR348C
1884 nt
9.9
□□□□□ -0.82
COF1
Q03048
FPS1
YLL043W
2010 nt
9.89
□□□□□ -0.83
COF1
Q03048
PAC11
YDR488C
1602 nt
9.85
□□□□□ -0.83
COF1
Q03048
SPT5
YML010W
3192 nt
9.81
□□□□□ -0.84
COF1
Q03048
RTC3
YHR087W
336 nt
9.79
□□□□□ -0.84
COF1
Q03048
NVJ2
YPR091C
2313 nt
9.79
□□□□□ -0.84
COF1
Q03048
YJL225C
YJL225C
5277 nt
9.68
□□□□□ -0.86
COF1
Q03048
BDF1
YLR399C
2061 nt
9.67
□□□□□ -0.86
COF1
Q03048
RDN37-1
RDN37-1
5354 nt
9.54
□□□□□ -0.88
COF1
Q03048
RDN37-2
RDN37-2
5354 nt
9.54
□□□□□ -0.88
COF1
Q03048
TAT1
YBR069C
1860 nt
9.53
□□□□□ -0.88
COF1
Q03048
BSC6
YOL137W
1494 nt
9.47
□□□□□ -0.89
COF1
Q03048
POA1
YBR022W
534 nt
9.46
□□□□□ -0.9
COF1
Q03048
TRN1
tP(UGG)A
72 nt
9.45
□□□□□ -0.9
COF1
Q03048
SUF9
tP(UGG)F
72 nt
9.45
□□□□□ -0.9
COF1
Q03048
SUF8
tP(UGG)H
72 nt
9.45
□□□□□ -0.9
COF1
Q03048
tP(UGG)L
tP(UGG)L
72 nt
9.45
□□□□□ -0.9
COF1
Q03048
SUF7
tP(UGG)M
72 nt
9.45
□□□□□ -0.9
COF1
Q03048
tP(UGG)N1
tP(UGG)N1
72 nt
9.45
□□□□□ -0.9
COF1
Q03048
tP(UGG)N2
tP(UGG)N2
72 nt
9.45
□□□□□ -0.9
COF1
Q03048
tP(UGG)O1
tP(UGG)O1
72 nt
9.45
□□□□□ -0.9
COF1
Q03048
SUF11
tP(UGG)O2
72 nt
9.45
□□□□□ -0.9
COF1
Q03048
YCR051W
YCR051W
669 nt
9.44
□□□□□ -0.9
COF1
Q03048
ARE1
YCR048W
1833 nt
9.41
□□□□□ -0.9
COF1
Q03048
RVS167
YDR388W
1449 nt
9.31
□□□□□ -0.92
COF1
Q03048
YHR049C-A
YHR049C-A
297 nt
9.28
□□□□□ -0.92
COF1
Q03048
Q0182
Q0182
405 nt
9.2
□□□□□ -0.94
COF1
Q03048
CCC1
YLR220W
969 nt
9.19
□□□□□ -0.94
COF1
Q03048
URN1
YPR152C
1398 nt
9.13
□□□□□ -0.95
COF1
Q03048
SCJ1
YMR214W
1134 nt
9.12
□□□□□ -0.95
COF1
Q03048
SAH1
YER043C
1350 nt
9.06
□□□□□ -0.96
COF1
Q03048
MEP2
YNL142W
1500 nt
9.02
□□□□□ -0.97
COF1
Q03048
SCS3
YGL126W
1143 nt
8.99
□□□□□ -0.97
COF1
Q03048
UME6
YDR207C
2511 nt
8.98
□□□□□ -0.97
COF1
Q03048
BUD23
YCR047C
828 nt
8.96
□□□□□ -0.98
COF1
Q03048
OPI9
YLR338W
858 nt
8.95
□□□□□ -0.98
COF1
Q03048
RPM1
RPM1
483 nt
8.95
□□□□□ -0.98
COF1
Q03048
RPP1B
YDL130W
321 nt
8.92
□□□□□ -0.98
COF1
Q03048
SHR5
YOL110W
714 nt
8.89
□□□□□ -0.99
COF1
Q03048
YBR220C
YBR220C
1683 nt
8.87
□□□□□ -0.99
COF1
Q03048
PCH2
YBR186W
1695 nt
8.85
□□□□□ -0.99
COF1
Q03048
GUT2
YIL155C
1950 nt
8.82
□□□□□ -1
COF1
Q03048
YOL085C
YOL085C
342 nt
8.8
□□□□□ -1
COF1
Q03048
SEC11
YIR022W
504 nt
8.79
□□□□□ -1
COF1
Q03048
YMR090W
YMR090W
684 nt
8.79
□□□□□ -1
COF1
Q03048
DCW1
YKL046C
1350 nt
8.77
□□□□□ -1.01
COF1
Q03048
NAB2
YGL122C
1578 nt
8.76
□□□□□ -1.01
COF1
Q03048
tP(UGG)O3
tP(UGG)O3
72 nt
8.73
□□□□□ -1.01
COF1
Q03048
RPN10
YHR200W
807 nt
8.72
□□□□□ -1.01
COF1
Q03048
BOR1
YNL275W
1731 nt
8.71
□□□□□ -1.02
COF1
Q03048
PUN1
YLR414C
792 nt
8.7
□□□□□ -1.02
COF1
Q03048
PTC2
YER089C
1395 nt
8.69
□□□□□ -1.02
COF1
Q03048
EMI2
YDR516C
1503 nt
8.69
□□□□□ -1.02
COF1
Q03048
SDH1
YKL148C
1923 nt
8.64
□□□□□ -1.03
COF1
Q03048
DEP1
YAL013W
1218 nt
8.64
□□□□□ -1.03
COF1
Q03048
PIB2
YGL023C
1908 nt
8.63
□□□□□ -1.03
COF1
Q03048
PKP1
YIL042C
1185 nt
8.61
□□□□□ -1.03
COF1
Q03048
YNL208W
YNL208W
600 nt
8.59
□□□□□ -1.03
COF1
Q03048
YDL221W
YDL221W
552 nt
8.55
□□□□□ -1.04
COF1
Q03048
MCH5
YOR306C
1566 nt
8.55
□□□□□ -1.04
COF1
Q03048
YPS1
YLR120C
1710 nt
8.54
□□□□□ -1.04
COF1
Q03048
PET122
YER153C
765 nt
8.53
□□□□□ -1.04
COF1
Q03048
YDJ1
YNL064C
1230 nt
8.52
□□□□□ -1.05
COF1
Q03048
RTF1
YGL244W
1677 nt
8.51
□□□□□ -1.05
COF1
Q03048
FIS1
YIL065C
468 nt
8.5
□□□□□ -1.05
COF1
Q03048
YHR165W-A
YHR165W-A
312 nt
8.48
□□□□□ -1.05
COF1
Q03048
YJR018W
YJR018W
363 nt
8.47
□□□□□ -1.05
COF1
Q03048
DAL1
YIR027C
1383 nt
8.45
□□□□□ -1.06
COF1
Q03048
SCC4
YER147C
1875 nt
8.43
□□□□□ -1.06
COF1
Q03048
ALG12
YNR030W
1656 nt
8.4
□□□□□ -1.06
COF1
Q03048
BOP3
YNL042W
1191 nt
8.38
□□□□□ -1.07
COF1
Q03048
PTK1
YKL198C
1989 nt
8.37
□□□□□ -1.07
COF1
Q03048
YDR095C
YDR095C
411 nt
8.35
□□□□□ -1.07
COF1
Q03048
PHO4
YFR034C
939 nt
8.35
□□□□□ -1.07
COF1
Q03048
SCR1
SCR1
522 nt
8.35
□□□□□ -1.07
COF1
Q03048
YSC84
YHR016C
1407 nt
8.32
□□□□□ -1.08
COF1
Q03048
FPR4
YLR449W
1179 nt
8.31
□□□□□ -1.08
COF1
Q03048
INM2
YDR287W
879 nt
8.29
□□□□□ -1.08
COF1
Q03048
CAC2
YML102W
1407 nt
8.29
□□□□□ -1.08
COF1
Q03048
GAR1
YHR089C
618 nt
8.28
□□□□□ -1.08
COF1
Q03048
YHL050C
YHL050C
2094 nt
8.25
□□□□□ -1.09
COF1
Q03048
YJR120W
YJR120W
351 nt
8.24
□□□□□ -1.09
COF1
Q03048
RRN5
YLR141W
1092 nt
8.22
□□□□□ -1.09
COF1
Q03048
HSP60
YLR259C
1719 nt
8.21
□□□□□ -1.09
COF1
Q03048
PTP1
YDL230W
1008 nt
8.21
□□□□□ -1.1
COF1
Q03048
FRE6
YLL051C
2139 nt
8.2
□□□□□ -1.1
COF1
Q03048
IRC15
YPL017C
1500 nt
8.2
□□□□□ -1.1
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