Protein–RNA interactions for Protein: Q04396

LPP1, Lipid phosphate phosphatase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LPP1Q04396 NSR1YGR159C 1245 nt16.89■□□□□ 0.29
LPP1Q04396 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.77■□□□□ 0.28
LPP1Q04396 NOP1YDL014W 984 nt16.31■□□□□ 0.2
LPP1Q04396 MDJ1YFL016C 1536 nt15.08■□□□□ 0.01
LPP1Q04396 YKL036CYKL036C 393 nt14.83□□□□□ -0.04
LPP1Q04396 SRX1YKL086W 384 nt14.21□□□□□ -0.13
LPP1Q04396 Q0297Q0297 156 nt14.19□□□□□ -0.14
LPP1Q04396 YJL027CYJL027C 417 nt13.98□□□□□ -0.17
LPP1Q04396 YCR051WYCR051W 669 nt13.42□□□□□ -0.26
LPP1Q04396 SCS3YGL126W 1143 nt13.35□□□□□ -0.27
LPP1Q04396 DBP2YNL112W 1641 nt13.27□□□□□ -0.29
LPP1Q04396 YBR190WYBR190W 312 nt13□□□□□ -0.33
LPP1Q04396 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.95□□□□□ -0.34
LPP1Q04396 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.95□□□□□ -0.34
LPP1Q04396 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.95□□□□□ -0.34
LPP1Q04396 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.95□□□□□ -0.34
LPP1Q04396 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.95□□□□□ -0.34
LPP1Q04396 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.95□□□□□ -0.34
LPP1Q04396 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.95□□□□□ -0.34
LPP1Q04396 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.95□□□□□ -0.34
LPP1Q04396 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.95□□□□□ -0.34
LPP1Q04396 YOL085CYOL085C 342 nt12.82□□□□□ -0.36
LPP1Q04396 CCC1YLR220W 969 nt12.75□□□□□ -0.37
LPP1Q04396 RPP1BYDL130W 321 nt12.72□□□□□ -0.37
LPP1Q04396 RTC3YHR087W 336 nt12.65□□□□□ -0.38
LPP1Q04396 PKP1YIL042C 1185 nt12.58□□□□□ -0.4
LPP1Q04396 RVS167YDR388W 1449 nt12.54□□□□□ -0.4
LPP1Q04396 SCJ1YMR214W 1134 nt12.34□□□□□ -0.43
LPP1Q04396 SSA3YBL075C 1950 nt12.3□□□□□ -0.44
LPP1Q04396 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.18□□□□□ -0.46
LPP1Q04396 PET122YER153C 765 nt12.13□□□□□ -0.47
LPP1Q04396 SHR5YOL110W 714 nt12.04□□□□□ -0.48
LPP1Q04396 SCR1SCR1 522 nt12.02□□□□□ -0.49
LPP1Q04396 ATS1YAL020C 1002 nt11.89□□□□□ -0.51
LPP1Q04396 PUT4YOR348C 1884 nt11.89□□□□□ -0.51
LPP1Q04396 YDJ1YNL064C 1230 nt11.84□□□□□ -0.51
LPP1Q04396 URN1YPR152C 1398 nt11.78□□□□□ -0.52
LPP1Q04396 RRN5YLR141W 1092 nt11.75□□□□□ -0.53
LPP1Q04396 OPI9YLR338W 858 nt11.67□□□□□ -0.54
LPP1Q04396 DEP1YAL013W 1218 nt11.66□□□□□ -0.54
LPP1Q04396 RPN10YHR200W 807 nt11.65□□□□□ -0.54
LPP1Q04396 ARE1YCR048W 1833 nt11.6□□□□□ -0.55
LPP1Q04396 SAH1YER043C 1350 nt11.59□□□□□ -0.55
LPP1Q04396 YNL208WYNL208W 600 nt11.55□□□□□ -0.56
LPP1Q04396 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.53□□□□□ -0.56
LPP1Q04396 GAR1YHR089C 618 nt11.52□□□□□ -0.57
LPP1Q04396 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.48□□□□□ -0.57
LPP1Q04396 POA1YBR022W 534 nt11.48□□□□□ -0.57
LPP1Q04396 RSB1YOR049C 1065 nt11.47□□□□□ -0.57
LPP1Q04396 PUN1YLR414C 792 nt11.37□□□□□ -0.59
LPP1Q04396 BSC6YOL137W 1494 nt11.3□□□□□ -0.6
LPP1Q04396 YJR018WYJR018W 363 nt11.24□□□□□ -0.61
LPP1Q04396 PTC2YER089C 1395 nt11.19□□□□□ -0.62
LPP1Q04396 BUD23YCR047C 828 nt11.18□□□□□ -0.62
LPP1Q04396 TIR1YER011W 765 nt11.17□□□□□ -0.62
LPP1Q04396 NAB2YGL122C 1578 nt11.11□□□□□ -0.63
LPP1Q04396 PST2YDR032C 597 nt11.05□□□□□ -0.64
LPP1Q04396 SSA1YAL005C 1929 nt11.03□□□□□ -0.64
LPP1Q04396 RPP2BYDR382W 333 nt11.01□□□□□ -0.65
LPP1Q04396 SPT5YML010W 3192 nt10.97□□□□□ -0.65
LPP1Q04396 YJR120WYJR120W 351 nt10.97□□□□□ -0.65
LPP1Q04396 DAL1YIR027C 1383 nt10.93□□□□□ -0.66
LPP1Q04396 FIS1YIL065C 468 nt10.92□□□□□ -0.66
LPP1Q04396 INM2YDR287W 879 nt10.9□□□□□ -0.66
LPP1Q04396 SSA4YER103W 1929 nt10.87□□□□□ -0.67
LPP1Q04396 FPR4YLR449W 1179 nt10.84□□□□□ -0.67
LPP1Q04396 PHO4YFR034C 939 nt10.81□□□□□ -0.68
LPP1Q04396 SRB2YHR041C 633 nt10.74□□□□□ -0.69
LPP1Q04396 BDH2YAL061W 1254 nt10.73□□□□□ -0.69
LPP1Q04396 YBL100CYBL100C 315 nt10.73□□□□□ -0.69
LPP1Q04396 YPS1YLR120C 1710 nt10.66□□□□□ -0.7
LPP1Q04396 MEP2YNL142W 1500 nt10.64□□□□□ -0.71
LPP1Q04396 WWM1YFL010C 636 nt10.61□□□□□ -0.71
LPP1Q04396 SHU1YHL006C 453 nt10.61□□□□□ -0.71
LPP1Q04396 YGR021WYGR021W 873 nt10.6□□□□□ -0.71
LPP1Q04396 YDR095CYDR095C 411 nt10.59□□□□□ -0.71
LPP1Q04396 LSM3YLR438C-A 270 nt10.59□□□□□ -0.71
LPP1Q04396 FUN26YAL022C 1554 nt10.59□□□□□ -0.71
LPP1Q04396 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.56□□□□□ -0.72
LPP1Q04396 TRM9YML014W 840 nt10.55□□□□□ -0.72
LPP1Q04396 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.53□□□□□ -0.72
LPP1Q04396 YKL097CYKL097C 411 nt10.53□□□□□ -0.72
LPP1Q04396 BDF1YLR399C 2061 nt10.53□□□□□ -0.72
LPP1Q04396 ALF1YNL148C 765 nt10.51□□□□□ -0.73
LPP1Q04396 HOM6YJR139C 1080 nt10.49□□□□□ -0.73
LPP1Q04396 CCT6YDR188W 1641 nt10.47□□□□□ -0.73
LPP1Q04396 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.45□□□□□ -0.74
LPP1Q04396 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.43□□□□□ -0.74
LPP1Q04396 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.43□□□□□ -0.74
LPP1Q04396 DCW1YKL046C 1350 nt10.4□□□□□ -0.74
LPP1Q04396 RPP2AYOL039W 321 nt10.39□□□□□ -0.75
LPP1Q04396 TAT1YBR069C 1860 nt10.38□□□□□ -0.75
LPP1Q04396 MNP1YGL068W 585 nt10.35□□□□□ -0.75
LPP1Q04396 RKM5YLR137W 1104 nt10.34□□□□□ -0.75
LPP1Q04396 YMR090WYMR090W 684 nt10.34□□□□□ -0.75
LPP1Q04396 SIS1YNL007C 1059 nt10.34□□□□□ -0.75
LPP1Q04396 EMI2YDR516C 1503 nt10.33□□□□□ -0.76
LPP1Q04396 PTP1YDL230W 1008 nt10.32□□□□□ -0.76
LPP1Q04396 YJL225CYJL225C 5277 nt10.26□□□□□ -0.77
LPP1Q04396 YDL221WYDL221W 552 nt10.25□□□□□ -0.77
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