Protein–RNA interactions for Protein: P53044

UFD1, Ubiquitin fusion degradation protein 1, yeastyeast

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFD1P53044 NSR1YGR159C 1245 nt17.44■□□□□ 0.38
UFD1P53044 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.31■□□□□ 0.36
UFD1P53044 NOP1YDL014W 984 nt16.76■□□□□ 0.27
UFD1P53044 MDJ1YFL016C 1536 nt15.67■□□□□ 0.1
UFD1P53044 YKL036CYKL036C 393 nt15.33■□□□□ 0.04
UFD1P53044 SRX1YKL086W 384 nt14.64□□□□□ -0.07
UFD1P53044 Q0297Q0297 156 nt14.61□□□□□ -0.07
UFD1P53044 YJL027CYJL027C 417 nt14.45□□□□□ -0.1
UFD1P53044 SCS3YGL126W 1143 nt13.89□□□□□ -0.19
UFD1P53044 YCR051WYCR051W 669 nt13.84□□□□□ -0.19
UFD1P53044 DBP2YNL112W 1641 nt13.8□□□□□ -0.2
UFD1P53044 YBR190WYBR190W 312 nt13.45□□□□□ -0.26
UFD1P53044 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.38□□□□□ -0.27
UFD1P53044 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.38□□□□□ -0.27
UFD1P53044 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.38□□□□□ -0.27
UFD1P53044 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.38□□□□□ -0.27
UFD1P53044 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.38□□□□□ -0.27
UFD1P53044 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.38□□□□□ -0.27
UFD1P53044 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.38□□□□□ -0.27
UFD1P53044 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.38□□□□□ -0.27
UFD1P53044 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.38□□□□□ -0.27
UFD1P53044 SSA3YBL075C 1950 nt13.24□□□□□ -0.29
UFD1P53044 YOL085CYOL085C 342 nt13.23□□□□□ -0.29
UFD1P53044 CCC1YLR220W 969 nt13.2□□□□□ -0.3
UFD1P53044 RPP1BYDL130W 321 nt13.09□□□□□ -0.31
UFD1P53044 RTC3YHR087W 336 nt13.09□□□□□ -0.31
UFD1P53044 PKP1YIL042C 1185 nt13.01□□□□□ -0.33
UFD1P53044 RVS167YDR388W 1449 nt12.89□□□□□ -0.35
UFD1P53044 SCJ1YMR214W 1134 nt12.8□□□□□ -0.36
UFD1P53044 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.57□□□□□ -0.4
UFD1P53044 PET122YER153C 765 nt12.52□□□□□ -0.41
UFD1P53044 PUT4YOR348C 1884 nt12.45□□□□□ -0.42
UFD1P53044 ATS1YAL020C 1002 nt12.44□□□□□ -0.42
UFD1P53044 SCR1SCR1 522 nt12.41□□□□□ -0.42
UFD1P53044 SHR5YOL110W 714 nt12.41□□□□□ -0.42
UFD1P53044 URN1YPR152C 1398 nt12.19□□□□□ -0.46
UFD1P53044 YDJ1YNL064C 1230 nt12.18□□□□□ -0.46
UFD1P53044 RRN5YLR141W 1092 nt12.14□□□□□ -0.47
UFD1P53044 DEP1YAL013W 1218 nt12.1□□□□□ -0.47
UFD1P53044 ARE1YCR048W 1833 nt12.09□□□□□ -0.47
UFD1P53044 OPI9YLR338W 858 nt12.08□□□□□ -0.48
UFD1P53044 SAH1YER043C 1350 nt12.05□□□□□ -0.48
UFD1P53044 POA1YBR022W 534 nt11.99□□□□□ -0.49
UFD1P53044 RPN10YHR200W 807 nt11.96□□□□□ -0.49
UFD1P53044 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.93□□□□□ -0.5
UFD1P53044 YNL208WYNL208W 600 nt11.92□□□□□ -0.5
UFD1P53044 GAR1YHR089C 618 nt11.91□□□□□ -0.5
UFD1P53044 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.9□□□□□ -0.5
UFD1P53044 RSB1YOR049C 1065 nt11.86□□□□□ -0.51
UFD1P53044 BSC6YOL137W 1494 nt11.85□□□□□ -0.51
UFD1P53044 PUN1YLR414C 792 nt11.73□□□□□ -0.53
UFD1P53044 SPT5YML010W 3192 nt11.65□□□□□ -0.54
UFD1P53044 YJR018WYJR018W 363 nt11.62□□□□□ -0.55
UFD1P53044 BUD23YCR047C 828 nt11.61□□□□□ -0.55
UFD1P53044 PTC2YER089C 1395 nt11.61□□□□□ -0.55
UFD1P53044 TIR1YER011W 765 nt11.54□□□□□ -0.56
UFD1P53044 SSA4YER103W 1929 nt11.5□□□□□ -0.57
UFD1P53044 NAB2YGL122C 1578 nt11.5□□□□□ -0.57
UFD1P53044 PST2YDR032C 597 nt11.49□□□□□ -0.57
UFD1P53044 SSA1YAL005C 1929 nt11.45□□□□□ -0.58
UFD1P53044 YJR120WYJR120W 351 nt11.42□□□□□ -0.58
UFD1P53044 FIS1YIL065C 468 nt11.33□□□□□ -0.6
UFD1P53044 PAC11YDR488C 1602 nt11.31□□□□□ -0.6
UFD1P53044 RPP2BYDR382W 333 nt11.31□□□□□ -0.6
UFD1P53044 DAL1YIR027C 1383 nt11.3□□□□□ -0.6
UFD1P53044 NVJ2YPR091C 2313 nt11.26□□□□□ -0.61
UFD1P53044 INM2YDR287W 879 nt11.25□□□□□ -0.61
UFD1P53044 FPR4YLR449W 1179 nt11.23□□□□□ -0.61
UFD1P53044 SRB2YHR041C 633 nt11.22□□□□□ -0.61
UFD1P53044 MEP2YNL142W 1500 nt11.19□□□□□ -0.62
UFD1P53044 PHO4YFR034C 939 nt11.19□□□□□ -0.62
UFD1P53044 FPS1YLL043W 2010 nt11.13□□□□□ -0.63
UFD1P53044 YKL097CYKL097C 411 nt11.13□□□□□ -0.63
UFD1P53044 BDF1YLR399C 2061 nt11.1□□□□□ -0.63
UFD1P53044 YBL100CYBL100C 315 nt11.09□□□□□ -0.63
UFD1P53044 YPS1YLR120C 1710 nt11.06□□□□□ -0.64
UFD1P53044 BDH2YAL061W 1254 nt11.06□□□□□ -0.64
UFD1P53044 WWM1YFL010C 636 nt10.99□□□□□ -0.65
UFD1P53044 SHU1YHL006C 453 nt10.99□□□□□ -0.65
UFD1P53044 YDR095CYDR095C 411 nt10.97□□□□□ -0.65
UFD1P53044 TAT1YBR069C 1860 nt10.96□□□□□ -0.65
UFD1P53044 DCW1YKL046C 1350 nt10.96□□□□□ -0.65
UFD1P53044 FUN26YAL022C 1554 nt10.95□□□□□ -0.66
UFD1P53044 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.95□□□□□ -0.66
UFD1P53044 LSM3YLR438C-A 270 nt10.9□□□□□ -0.66
UFD1P53044 YGR021WYGR021W 873 nt10.89□□□□□ -0.67
UFD1P53044 TRM9YML014W 840 nt10.89□□□□□ -0.67
UFD1P53044 YMR090WYMR090W 684 nt10.88□□□□□ -0.67
UFD1P53044 EMI2YDR516C 1503 nt10.84□□□□□ -0.67
UFD1P53044 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.84□□□□□ -0.67
UFD1P53044 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.83□□□□□ -0.68
UFD1P53044 ALF1YNL148C 765 nt10.83□□□□□ -0.68
UFD1P53044 HOM6YJR139C 1080 nt10.82□□□□□ -0.68
UFD1P53044 CCT6YDR188W 1641 nt10.8□□□□□ -0.68
UFD1P53044 YBR220CYBR220C 1683 nt10.8□□□□□ -0.68
UFD1P53044 RPP2AYOL039W 321 nt10.76□□□□□ -0.69
UFD1P53044 PTP1YDL230W 1008 nt10.75□□□□□ -0.69
UFD1P53044 YDL221WYDL221W 552 nt10.73□□□□□ -0.69
UFD1P53044 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.72□□□□□ -0.69
UFD1P53044 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.72□□□□□ -0.69
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